More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET_tRNA-Ile-1 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET_tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.449511  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_892  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0454631  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0031  tRNA-Ile  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.136071  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0007  tRNA-Ile  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00808178  normal  0.792486 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0042  tRNA-Ile  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00111432  normal  0.385328 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0007  tRNA-Ile  88.16 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0924996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0036  tRNA-Ile  88.16 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.432918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0052  tRNA-Ile  88.16 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAIleVIMSS1309203  tRNA-Ile  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.765225  normal  0.83434 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAIleVIMSS1309088  tRNA-Ile  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAIleVIMSS1309139  tRNA-Ile  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0037  tRNA-Ile  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0006  tRNA-Ile  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0033  tRNA-Ile  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0017  tRNA-Ile  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0314309  normal  0.837845 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0050  tRNA-Ile  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0010  tRNA-Ile  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAIleVIMSS1309289  tRNA-Ile  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAIleVIMSS1309162  tRNA-Ile  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAIleVIMSS1309281  tRNA-Ile  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.126115 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0022  tRNA-Ile  86.84 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.362568  normal  0.10266 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0023  tRNA-Ile  86.84 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0012  tRNA-Ile  86.84 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0022  tRNA-Ile  86.84 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000102931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0033  tRNA-Ile  86.84 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000000982153  normal  0.21977 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0028  tRNA-Ile  86.84 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.568304 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0042  tRNA-Ile  86.84 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0043  tRNA-Ile  86.84 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0208406  normal  0.220068 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0057  tRNA-Ile  92.31 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0031  tRNA-Ile  87.32 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAIleVIMSS1309371  tRNA-Ile  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.284723  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0026  tRNA-Ile  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0180152  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0020  tRNA-Ile  90.57 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0038  tRNA-Ile  90.57 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0015  tRNA-Ile  85.53 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000549591  normal  0.119153 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0028  tRNA-Ile  85.53 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000471614  decreased coverage  0.000367782 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4561  tRNA-Ile  88.68 
 
 		 79 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000271401  normal  0.0816805 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0002  tRNA-Ile  88.68 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  88.68 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.428746  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Ile-2  tRNA-Ile  88.68 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5640  tRNA-Ala  88.68 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5643  tRNA-Ile  88.68 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5704  tRNA-Ile  88.68 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00205374  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5714  tRNA-Ile  88.68 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.287498  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0032  tRNA-Ile  88.68 
 
 		 79 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.243312  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0008  tRNA-Ile  88.68 
 
 		 79 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0344807  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5801  tRNA-Ile  88.68 
 
 		 79 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00827668  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0007  tRNA-Ile  88.68 
 
 		 79 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5288  tRNA-Ile  88.68 
 
 		 79 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.330851  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  88.68 
 
 		 80 bp  58  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00325098  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ile-2  tRNA-Ile  88.68 
 
 		 80 bp  58  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ile-3  tRNA-Ile  88.68 
 
 		 80 bp  58  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0703604  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ile-4  tRNA-Ile  88.68 
 
 		 80 bp  58  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.667521  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  88.68 
 
 		 80 bp  58  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ile-2  tRNA-Ile  88.68 
 
 		 80 bp  58  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ile-3  tRNA-Ile  88.68 
 
 		 80 bp  58  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000227383  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ile-4  tRNA-Ile  88.68 
 
 		 80 bp  58  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  88.68 
 
 		 80 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ile-2  tRNA-Ile  88.68 
 
 		 80 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.426749  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ile-3  tRNA-Ile  88.68 
 
 		 80 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000656223  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ile-4  tRNA-Ile  88.68 
 
 		 80 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.438933  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0007  tRNA-Ile  88.68 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000177312  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4985  tRNA-Ile  88.68 
 
 		 79 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  88.68 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0014391  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ile-2  tRNA-Ile  88.68 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.182943  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ile-3  tRNA-Ile  88.68 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000945265  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ile-4  tRNA-Ile  88.68 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0663179  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0058  tRNA-Ile  88.68 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00305768  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0015  tRNA-Ile  88.68 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0066  tRNA-Ile  88.68 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0009  tRNA-Ile  88.68 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5016  tRNA-Ile  88.68 
 
 		 79 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0220679  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0069  tRNA-Ile  88.68 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0018  tRNA-Ile  88.68 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.891633  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0870  tRNA-Ile  88.68 
 
 		 79 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000703823  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5617  tRNA-Ile  88.68 
 
 		 79 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0278362  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5742  tRNA-Ile  88.68 
 
 		 79 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000134738  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5624  tRNA-Ile  88.68 
 
 		 79 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.037102  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0230  tRNA-Ile  88.68 
 
 		 79 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00182201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0066  tRNA-Ile  88.68 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0028  tRNA-Ile  88.68 
 
 		 79 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5312  tRNA-Ile  88.68 
 
 		 79 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.122008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0062  tRNA-Ile  88.68 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0795  tRNA-Ile  88.68 
 
 		 79 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.48355e-33 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0114  tRNA-Ile  88.68 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00549183  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0125  tRNA-Ile  88.68 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.865634  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0017  tRNA-Ile  84.51 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000664856  normal  0.0132434 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0009  tRNA-Ile  84.51 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.374214 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0035  tRNA-Ile  90.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1610  tRNA-Ile  90.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0052  tRNA-Ile  86.21 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.126724  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0057  tRNA-Ile  86.21 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0045  tRNA-Ile  90.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000457584  normal  0.0314224 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0003  tRNA-Ile  86.21 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000212749  normal  0.769134 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0056  tRNA-Ile  86.21 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00769688  normal  0.444616 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0043  tRNA-Ile  86.21 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.077359  normal  0.13157 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0008  tRNA-Ile  90.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0289136  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0118  tRNA-Ile  90.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000845195  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0036  tRNA-Ile  90.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.912426  normal  0.0318611 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0064  tRNA-Ile  86.21 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>