81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_R0001 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_R0001  tRNA-Ile  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000000056497 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0001  tRNA-Ile  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00080  tRNA-Ile  97.3 
 
 		 74 bp  131  2.0000000000000002e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0001  tRNA-Ile  98.31 
 
 		 77 bp  109  9.000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0001  tRNA-Ile  95.31 
 
 		 74 bp  103  5e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0001  tRNA-Ile  95.31 
 
 		 77 bp  103  5e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.269179  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0001  tRNA-Ile  95.31 
 
 		 77 bp  103  5e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.48782 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0001  tRNA-Ile  95.24 
 
 		 74 bp  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0001  tRNA-Ile  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0441602 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00090  tRNA-Ile  96.55 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.609024  normal  0.459297 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00090  tRNA-Ile  96.49 
 
 		 74 bp  97.6  3e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.387136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0001  tRNA-Ile  93.75 
 
 		 74 bp  95.6  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0001  tRNA-Ile  93.75 
 
 		 74 bp  95.6  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.226648  normal  0.0173253 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0001  tRNA-Ile  93.75 
 
 		 74 bp  95.6  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.484512  normal  0.062918 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14001  tRNA-Ile  93.75 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0004  tRNA-Ile  94.92 
 
 		 74 bp  93.7  5e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0654807  normal  0.562233 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0001  tRNA-Ile  94.92 
 
 		 74 bp  93.7  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531061 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0001  tRNA-Ile  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0001  tRNA-Ile  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0001  tRNA-Ile  92.19 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.522467  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0001  tRNA-Ile  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.429514  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0001  tRNA-Ile  90.62 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00699866 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0001  tRNA-Ile  90.62 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0001  tRNA-Ile  91.38 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0054  tRNA-Ile  91.07 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.467793  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0001  tRNA-Ile  88.89 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0001  tRNA-Ile  89.66 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0051  tRNA-Ile  92 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0181  tRNA-Ile  88.14 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00212444  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0037  tRNA-Ile  88.14 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0095  tRNA-Ile  87.93 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0001  tRNA-Ile  87.93 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.826373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1353  tRNA-Ile  87.72 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00031485 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0001  tRNA-Ile  87.72 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.996709  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_R0077  tRNA-Ile  92.68 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tIle01  tRNA-Ile  87.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.982278 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0001  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t1214  tRNA-Ile  86.44 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0010  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0016  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflt016  tRNA-Ile  86.21 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0012  tRNA-Asn  89.13 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.571236  normal  0.0197692 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0660  tRNA-Ile  86.21 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.834568  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0040  tRNA-Ile  85.96 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.22275  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0001  tRNA-Ile  85.96 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09730  tRNA-Thr  87.5 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.0000000907355  hitchhiker  0.0000119481 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0014  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAIleVIMSS1309203  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.765225  normal  0.83434 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAIleVIMSS1309139  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAIleVIMSS1309088  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0028  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000471614  decreased coverage  0.000367782 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0015  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000549591  normal  0.119153 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0033  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000000982153  normal  0.21977 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0022  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000102931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0010  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0044  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000172197  normal  0.222216 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0050  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0017  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0314309  normal  0.837845 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0033  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0006  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0037  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0043  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0208406  normal  0.220068 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0023  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0022  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.362568  normal  0.10266 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAIleVIMSS1309281  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.126115 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAIleVIMSS1309289  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAIleVIMSS1309162  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0042  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAIleVIMSS1309371  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.284723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0012  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0048  tRNA-Ile  96.43 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00260543  hitchhiker  0.000838943 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0028  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.568304 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1788  tRNA-Met  100 
 
 		 79 bp  46.1  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  84.13 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0217  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00000283281  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00090  tRNA-Ile  84.13 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0390  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00170  tRNA-Ile  84.13 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0040  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.138957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0008  tRNA-Met  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0018  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.169574 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>