246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_t0024 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_t0024  tRNA-Ile  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00268867  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0568  tRNA-Ile  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0037  tRNA-Ile  95.08 
 
 		 74 bp  97.6  3e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0181  tRNA-Ile  95.08 
 
 		 74 bp  97.6  3e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00212444  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t1214  tRNA-Ile  91.8 
 
 		 74 bp  81.8  0.00000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0003  tRNA-Ile  97.62 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000155812  hitchhiker  0.0000000064789 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0003  tRNA-Ile  97.62 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000227262  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0025  tRNA-Ile  92.31 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000204712  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0016  tRNA-Ile  92.31 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0010  tRNA-Ile  92.31 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0002  tRNA-Ile  92.31 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000719363  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0058  tRNA-Ile  92.86 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.185628  hitchhiker  0.000282949 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0019  tRNA-Ile  92.86 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0049  tRNA-Ile  92.86 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.538867  hitchhiker  0.000544539 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0057  tRNA-Ile  92.86 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0062  tRNA-Ile  92.86 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0015  tRNA-Ile  92.86 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.122753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0073  tRNA-Ile  92.86 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0994061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0068  tRNA-Ile  92.86 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000051508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0020  tRNA-Ile  92.86 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.272586 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0051  tRNA-Ile  92.86 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0200036 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0059  tRNA-Ile  92.86 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0064  tRNA-Ile  92.86 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0063  tRNA-Ile  92.86 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0253659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0029  tRNA-Ile  87.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.856201  normal  0.110623 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0052  tRNA-Ile  90.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.126724  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0057  tRNA-Ile  90.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0013  tRNA-Val  88.68 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.276155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1988  tRNA-OTHER  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000000295907  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_R0086  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00192054  normal  0.222776 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3832  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.406372  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_R0089  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000256192  normal  0.667344 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0018  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000206561  normal  0.886119 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0451  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00000861807  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1338  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Ile-3  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00102646  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA_tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000192753  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA_tRNA-Ile-2  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000169061  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3108  tRNA-OTHER  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000569169  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0005  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000238444  hitchhiker  0.00232572 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0592  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000232315  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_R0084  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000150317  normal  0.67216 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0008  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000057539  normal  0.290833 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0004  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.0000000000586808  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1474  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000230353  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3561  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000191546  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1909  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164589  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0004  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000259664  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_CR0085  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000813778  normal  0.199045 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0016  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000072024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0026  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000721993  normal  0.861053 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0074  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000283868  normal  0.458785 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_BR0002  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000230131  normal  0.891298 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0008  tRNA-His  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00267875  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2046  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000148192  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1097  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000222375  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2897  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000182734  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3094  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000000516421  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0061  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000544975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1329  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00168049  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0074  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000244409  normal  0.0967711 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0008  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000588421  hitchhiker  0.00941116 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_R0080  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000523506  normal  0.960372 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0066  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000012861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0045  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00337012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_R0079  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000119006  normal  0.614456 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_R0078  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000293807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0018  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000535149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0066  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000150192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0701  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000189505  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0039  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000372994  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0054  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00610813  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0065  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00130991  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_R0072  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00108328  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_R0084  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.011536  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1168  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000133954  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0495  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.328394  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3568  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0990712  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3771  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000362493  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1897  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000326046  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3542  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000176081  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0015  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000218545  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0008  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000162248  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0018  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000054904  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0066  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000000013609  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_R0083  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000284492  normal  0.0190641 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_R0089  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000671858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3541  tRNA-OTHER  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00194586  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0630  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000358951  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_R0080  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000000161915  normal  0.0753371 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0008  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000320674  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0017  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000962066  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0064  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000178729  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_R0080  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000338502  normal  0.0447756 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_R0083  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00594726  hitchhiker  0.00848998 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0014  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0002  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_R0073  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000270746  normal  0.313667 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0068  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00409998  normal  0.989602 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0020  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000000559098  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>