299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_R0025 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_R0025  tRNA-Val  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.19601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0012  tRNA-Val  94.03 
 
 		 74 bp  101  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000513005  hitchhiker  0.00749206 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0048  tRNA-Val  91.04 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0052  tRNA-Val  93.22 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00919857  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0049  tRNA-Val  91.04 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0054  tRNA-Val  93.22 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00910713  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0003  tRNA-Val  93.22 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_tVal03  tRNA-Val  93.22 
 
 		 80 bp  85.7  0.000000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0049  tRNA-Val  93.22 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000683912  normal  0.27317 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0042  tRNA-Val  92.98 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00634518  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0001  tRNA-Val  92.98 
 
 		 74 bp  81.8  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t039  tRNA-Val  92.98 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t040  tRNA-Val  92.98 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0063  tRNA-Val  92.98 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00384271  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0074  tRNA-Val  92.98 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00199895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t069  tRNA-Val  92.98 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00122297  hitchhiker  0.00465561 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0043  tRNA-Val  92.98 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00131984  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0064  tRNA-Val  92.98 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00446845  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0061  tRNA-Val  92.98 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.144549  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0062  tRNA-Val  92.98 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.202264  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0001  tRNA-Val  91.8 
 
 		 74 bp  81.8  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00000456569  normal  0.401472 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0089  tRNA-Val  92.98 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000402356  normal  0.221127 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0090  tRNA-Val  92.98 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000384332  normal  0.221127 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0100  tRNA-Val  92.98 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00395733  normal  0.242808 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0101  tRNA-Val  92.98 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.003873  normal  0.249554 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0061  tRNA-Val  92.98 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.366342  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0085  tRNA-Val  92.98 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0569302  hitchhiker  0.00000332622 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0086  tRNA-Val  92.98 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.236197  normal  0.0136376 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0087  tRNA-Val  92.98 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.235286  normal  0.0134883 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t068  tRNA-Val  92.98 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0011202  hitchhiker  0.00473676 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0067  tRNA-Val  92.98 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.325907  normal  0.0460929 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0062  tRNA-Val  92.98 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.373541  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0073  tRNA-Val  92.98 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00216703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0017  tRNA-Val  89.55 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t55  tRNA-Val  89.23 
 
 		 74 bp  73.8  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.38897  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t56  tRNA-Val  89.23 
 
 		 74 bp  73.8  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0060  tRNA-Val  91.23 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00132937  hitchhiker  0.000239512 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0032  tRNA-Val  89.23 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.148621  normal  0.0470696 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0109  tRNA-Val  91.23 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0124836  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0066  tRNA-Val  91.23 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00442679  hitchhiker  0.000900174 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0045  tRNA-Val  89.23 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000191089 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60190  tRNA-Val  89.23 
 
 		 74 bp  73.8  0.000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0054  tRNA-Val  89.23 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0691597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0081  tRNA-Val  91.23 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0183039  normal  0.0880297 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0071  tRNA-Val  89.23 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193392 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0070  tRNA-Val  89.23 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.256886 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0046  tRNA-Val  89.23 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00020068 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0053  tRNA-Val  89.23 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0699636  normal  0.799268 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0073  tRNA-Val  91.23 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.618922  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0074  tRNA-Val  91.23 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.593802  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0111  tRNA-Val  91.23 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0150231  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0079  tRNA-Val  91.23 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0663805  normal  0.0847945 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0032  tRNA-Val  91.23 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00000020219  hitchhiker  8.04575e-18 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0084  tRNA-Val  91.23 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0193203  normal  0.0545316 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0066  tRNA-Val  91.23 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.603715  normal  0.0472692 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0068  tRNA-Val  91.23 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0104216  hitchhiker  0.000843897 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0047  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00027  tRNA-Val  89.83 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.825713  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0048  tRNA-Val  89.83 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000092114  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5035  tRNA-Val  89.83 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000158599  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0001  tRNA-Val  97.44 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.613575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2378  tRNA-Val  89.83 
 
 		 79 bp  69.9  0.00000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000316536  hitchhiker  0.00924941 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0045  tRNA-Val  89.83 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.653402  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0042  tRNA-Val  89.83 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2148  tRNA-Val  89.83 
 
 		 79 bp  69.9  0.00000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000010936  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1557  tRNA-Val  89.83 
 
 		 79 bp  69.9  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.939336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4667  tRNA-Val  89.83 
 
 		 79 bp  69.9  0.00000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000334967  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1534  tRNA-Val  89.83 
 
 		 79 bp  69.9  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0495924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0046  tRNA-Val  89.83 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00278064 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0035  tRNA-Val  97.44 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.491254  normal  0.639036 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1520  tRNA-Val  89.83 
 
 		 79 bp  69.9  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00188804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1532  tRNA-Val  89.83 
 
 		 79 bp  69.9  0.00000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000254029  hitchhiker  0.00110314 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1750  tRNA-Val  89.83 
 
 		 79 bp  69.9  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000307379  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1919  tRNA-Val  89.83 
 
 		 79 bp  69.9  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0105703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0013  tRNA-Val  91.53 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.276155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0053  tRNA-Val  89.83 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.855863  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0053  tRNA-Val  89.83 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0033  tRNA-Val  89.66 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000435872  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0046  tRNA-Val  97.37 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.052544 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0028  tRNA-Val  97.37 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.163089  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0019  tRNA-Val  97.37 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0002  tRNA-Val  97.37 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.884588  normal  0.179612 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0047  tRNA-Val  95.24 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0087743  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1201  tRNA-Val  89.66 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0742483  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00028  tRNA-Val  89.47 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.813226  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0077  tRNA-Val  89.47 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00426255  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0075  tRNA-Val  89.47 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00433017  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1531  tRNA-Val  89.47 
 
 		 79 bp  65.9  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000929457  hitchhiker  0.00112826 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0062  tRNA-Val  89.47 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000022739  hitchhiker  0.00000336445 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0061  tRNA-Val  89.47 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000225678  hitchhiker  0.00000327406 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0027  tRNA-Val  88.52 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.543066  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1202  tRNA-Val  89.47 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0491839  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0076  tRNA-Val  89.47 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00448767  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0045  tRNA-Val  89.47 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00278064 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0053  tRNA-Val  89.47 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.452595  hitchhiker  0.000000169384 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1920  tRNA-Val  89.47 
 
 		 79 bp  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0104306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1556  tRNA-Val  89.47 
 
 		 79 bp  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2581  tRNA-Val  89.47 
 
 		 79 bp  65.9  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0567199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2580  tRNA-Val  89.47 
 
 		 79 bp  65.9  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0938444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0044  tRNA-Val  90.57 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.64476  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>