78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_R0049 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_R0049  tRNA-Val  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0048  tRNA-Val  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0017  tRNA-Val  98.65 
 
 		 74 bp  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0024  tRNA-Val  94.74 
 
 		 74 bp  89.7  8e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0265895  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0025  tRNA-Val  91.04 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.19601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0012  tRNA-Val  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000513005  hitchhiker  0.00749206 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0053  tRNA-Val  91.53 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0873696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0001  tRNA-Val  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00000456569  normal  0.401472 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0024  tRNA-Val  89.83 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.469275  hitchhiker  0.0000034793 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0023  tRNA-Val  89.83 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.169175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_tVal03  tRNA-Val  88.33 
 
 		 80 bp  63.9  0.000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0054  tRNA-Val  88.14 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00910713  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0052  tRNA-Val  88.14 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00919857  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0015  tRNA-Val  88.14 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000000205698  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0049  tRNA-Val  88.14 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000683912  normal  0.27317 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0003  tRNA-Val  88.14 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0071  tRNA-Val  87.72 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.99894  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0001  tRNA-Val  87.72 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Val-2  tRNA-Val  88.46 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000334583  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0036  tRNA-Val  88.46 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_966  tRNA-Val  88.46 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00216309  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0026  tRNA-Val  86.44 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6005  tRNA-Val  92.31 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.859444 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0057  tRNA-Val  86.44 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.858787  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0033  tRNA-Val  86.44 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0052  tRNA-Val  92.31 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.886993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1713  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.205594  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0064  tRNA-Val  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.192566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0052  tRNA-Val  96.43 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0017  tRNA-Val  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000274688  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0052  tRNA-Val  91.67 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.587124 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0002  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000719363  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0025  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000204712  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0086  tRNA-Asn  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000469656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0090  tRNA-Asn  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000613104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0013  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.276155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1201  tRNA-Val  84.75 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0742483  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0057  tRNA-Val  84.75 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.385214  hitchhiker  0.00196821 
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Val-1  tRNA-Val  84.75 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.133132  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_t56  tRNA-Val  84.48 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1919  tRNA-Val  84.48 
 
 		 79 bp  44.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0105703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0040  tRNA-Val  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.949801 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0048  tRNA-Val  84.48 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000092114  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2378  tRNA-Val  84.48 
 
 		 79 bp  44.1  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000316536  hitchhiker  0.00924941 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t55  tRNA-Val  84.48 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.38897  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60190  tRNA-Val  84.48 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0042  tRNA-Val  84.48 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0053  tRNA-Val  84.48 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0045  tRNA-Val  84.48 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.653402  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0021  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.715825 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0022  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00591364 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07715  tRNA-Met  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.461139  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0002  tRNA-Met  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.594163  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0053  tRNA-Val  84.48 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.855863  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0059  tRNA-Val  93.33 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.40098  normal  0.609607 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0092  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.368967  normal  0.0448761 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0046  tRNA-Val  84.48 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00278064 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0032  tRNA-Val  84.48 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.148621  normal  0.0470696 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0053  tRNA-Val  84.48 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0699636  normal  0.799268 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0054  tRNA-Val  84.48 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0691597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0042  tRNA-Val  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.206576  normal  0.0624418 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0074  tRNA-Val  93.33 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0744587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0019  tRNA-Val  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.941577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0013  tRNA-Val  93.33 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.38084 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4667  tRNA-Val  84.48 
 
 		 79 bp  44.1  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000334967  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5035  tRNA-Val  84.48 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000158599  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1750  tRNA-Val  84.48 
 
 		 79 bp  44.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000307379  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00027  tRNA-Val  84.48 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.825713  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0070  tRNA-Val  84.48 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.256886 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0071  tRNA-Val  84.48 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193392 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1532  tRNA-Val  84.48 
 
 		 79 bp  44.1  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000254029  hitchhiker  0.00110314 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0045  tRNA-Val  84.48 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000191089 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0046  tRNA-Val  84.48 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00020068 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2148  tRNA-Val  84.48 
 
 		 79 bp  44.1  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000010936  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0013  tRNA-Val  93.33 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.688167  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1534  tRNA-Val  84.48 
 
 		 79 bp  44.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0495924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1557  tRNA-Val  84.48 
 
 		 79 bp  44.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.939336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1520  tRNA-Val  84.48 
 
 		 79 bp  44.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00188804  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>