46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_R0052 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010830  Aasi_R0052  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.587124 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0003  tRNA-Val  92.75 
 
 		 77 bp  89.7  8e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0049  tRNA-Val  92.75 
 
 		 77 bp  89.7  8e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000683912  normal  0.27317 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0054  tRNA-Val  93.55 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00910713  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0001  tRNA-Val  92.31 
 
 		 74 bp  81.8  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0035  tRNA-Val  88.73 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00123613  unclonable  0.0000000227981 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0015  tRNA-Val  89.83 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0010  tRNA-Val  89.83 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0053  tRNA-Val  87.32 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0873696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0012  tRNA-Val  88.33 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000513005  hitchhiker  0.00749206 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0023  tRNA-Val  96.77 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.169175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0024  tRNA-Val  96.77 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.469275  hitchhiker  0.0000034793 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0033  tRNA-Val  96.77 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0026  tRNA-Val  96.77 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0068  tRNA-Val  88.14 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.392082  normal  0.0474076 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0015  tRNA-Val  87.1 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000000205698  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0057  tRNA-Val  87.1 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.385214  hitchhiker  0.00196821 
 
 
-
 
NC_002620  tRNA-Val-1  tRNA-Val  91.3 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.301674  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0057  tRNA-Val  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.858787  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1713  tRNA-Val  86.67 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.205594  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Val-1  tRNA-Val  96.55 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.133132  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0025  tRNA-Val  91.67 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.19601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0045  tRNA-Val  96.43 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0449962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0049  tRNA-Val  91.67 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0026  tRNA-Val  93.75 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0048  tRNA-Val  91.67 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0067  tRNA-Val  90.91 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000631396  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0068  tRNA-Val  90.91 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000545577  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0066  tRNA-Val  93.55 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0004  tRNA-Val  93.55 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tVal03  tRNA-Val  86.44 
 
 		 80 bp  46.1  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna093  tRNA-Asn  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000268933  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna095  tRNA-Asn  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000672543  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna098  tRNA-Asn  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000481863  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna101  tRNA-Asn  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000041783  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_966  tRNA-Val  87.04 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00216309  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0031  tRNA-Val  85.19 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0117254 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07715  tRNA-Met  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.461139  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0039  tRNA-Val  89.47 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.02275  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0002  tRNA-Met  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.594163  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0032  tRNA-Val  85.19 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00002348 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0013  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.276155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0036  tRNA-Val  87.04 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0092  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.368967  normal  0.0448761 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0035  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Val-2  tRNA-Val  87.04 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000334583  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>