205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_R0031 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_R0031  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0117254 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0032  tRNA-Val  97.3 
 
 		 75 bp  131  2.0000000000000002e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00002348 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0033  tRNA-Val  97.3 
 
 		 75 bp  131  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0038  tRNA-Val  94.67 
 
 		 75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.666126  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0040  tRNA-Val  94.59 
 
 		 75 bp  115  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.90959  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0044  tRNA-Val  94.59 
 
 		 75 bp  115  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00403684  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0036  tRNA-Val  94.59 
 
 		 75 bp  115  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000120511 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0033  tRNA-Val  94.59 
 
 		 75 bp  115  1.0000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16810  tRNA-Val  94.44 
 
 		 72 bp  111  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.606714  normal  0.0176901 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0029  tRNA-Val  93.33 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.198673  normal  0.11041 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0030  tRNA-Val  92 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0026  tRNA-Val  91.89 
 
 		 75 bp  99.6  9e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0408746  normal  0.0924489 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14900  tRNA-Val  91.89 
 
 		 75 bp  99.6  9e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0044  tRNA-Val  91.89 
 
 		 75 bp  99.6  9e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.311014  normal  0.10516 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0042  tRNA-Val  91.89 
 
 		 75 bp  99.6  9e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0153066  hitchhiker  0.00834851 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0037  tRNA-Val  91.67 
 
 		 72 bp  95.6  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.960362  normal  0.0810888 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0029  tRNA-Val  91.67 
 
 		 72 bp  95.6  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.742373  hitchhiker  0.00208243 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0013  tRNA-Val  90.54 
 
 		 75 bp  91.7  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.736454 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0036  tRNA-Val  90.28 
 
 		 72 bp  87.7  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.821341  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0037  tRNA-Val  89.19 
 
 		 75 bp  83.8  0.000000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15510  tRNA-Val  89.19 
 
 		 75 bp  83.8  0.000000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00141573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0047  tRNA-Val  89.19 
 
 		 75 bp  83.8  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.561657  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0053  tRNA-Val  89.47 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0873696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0023  tRNA-Val  89.47 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.169175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0024  tRNA-Val  89.47 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.469275  hitchhiker  0.0000034793 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13860  tRNA-Val  88.89 
 
 		 72 bp  79.8  0.00000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0312518  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0026  tRNA-Val  92.73 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13890  tRNA-Val  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0287375  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13840  tRNA-Val  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.150199  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0033  tRNA-Val  89.19 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0026  tRNA-Val  87.84 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000411365 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0052  tRNA-Val  87.84 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.886993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0027  tRNA-Val  87.84 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.60657 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0028  tRNA-Val  87.5 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000436096 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0015  tRNA-Val  91.07 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000000205698  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0029  tRNA-Val  87.5 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.575368 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0037  tRNA-Val  86.49 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0032  tRNA-Val  86.49 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0033  tRNA-Val  86.49 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.526612  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0035  tRNA-Val  86.49 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.522217  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0028  tRNA-Val  86.49 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00986707 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0029  tRNA-Val  86.49 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000337509 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0032  tRNA-Val  86.49 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.463355  normal  0.0505941 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0036  tRNA-Val  86.49 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0038  tRNA-Val  86.49 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0028  tRNA-Val  86.11 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.13979  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0024  tRNA-Val  86.11 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0031  tRNA-Val  86.11 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000451767 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0046  tRNA-Val  86.11 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.146675 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16730  tRNA-Val  86.11 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.251043  normal  0.0595565 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0015  tRNA-Val  86.11 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0605809  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0016  tRNA-Val  86.11 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16760  tRNA-Val  86.11 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.268589  normal  0.0588163 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0033  tRNA-Val  86.11 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000837062 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0003  tRNA-Val  89.29 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0049  tRNA-Val  89.29 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000683912  normal  0.27317 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0060  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000546078  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10750  tRNA-Val  86.57 
 
 		 72 bp  61.9  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0216656  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0031  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000478109 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0037  tRNA-Val  85.14 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.605152  normal  0.0106326 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0029  tRNA-Val  85.14 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0026  tRNA-Val  85.14 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.179113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0052  tRNA-Val  85.14 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0026  tRNA-Val  85.14 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.851542  hitchhiker  0.00348632 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6005  tRNA-Val  85.14 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.859444 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0035  tRNA-Val  85.53 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00123613  unclonable  0.0000000227981 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0026  tRNA-Val  84.72 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0265977  hitchhiker  0.000432959 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0054  tRNA-Val  87.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00910713  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0021  tRNA-Val  84.72 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0776  tRNA-Val  93.18 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.522118  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0013  tRNA-Val  93.18 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4591  tRNA-Val  93.18 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0012  tRNA-Val  93.18 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0012  tRNA-Val  93.18 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0036  tRNA-Val  84.72 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0258762  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0039  tRNA-Val  87.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.02275  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0038  tRNA-Val  84.72 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00268365  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0026  tRNA-Val  96.88 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0001  tRNA-Val  86.57 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0025  tRNA-Val  96.77 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000057008  normal  0.409519 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0035  tRNA-Val  96.77 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0205002  normal  0.0343396 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tVal01  tRNA-Val  96.77 
 
 		 81 bp  54  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.231904  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0025  tRNA-Val  96.77 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000640058  normal  0.0750081 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2329  tRNA-Val  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2543  tRNA-Val  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00155589  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0041  tRNA-Val  85.07 
 
 		 72 bp  54  0.000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.532077  normal  0.0646966 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4328  tRNA-Val  83.78 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0024  tRNA-Val  83.78 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.540332 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0002  tRNA-Val  96.67 
 
 		 78 bp  52  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.264825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0003  tRNA-Val  96.67 
 
 		 78 bp  52  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.401069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0014  tRNA-Val  83.78 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.167112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0023  tRNA-Val  96.55 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.720893  normal  0.0127386 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAValVIMSS1309132  tRNA-Val  96.55 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14860  tRNA-Val  93.94 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.303289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0054  tRNA-Val  96.43 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.282022  normal  0.126583 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0015  tRNA-Val  83.33 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0817161  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0103  tRNA-Val  91.67 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000000279802  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0034  tRNA-Val  91.67 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000784133  normal  0.347644 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0033  tRNA-Val  91.67 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000154108  normal  0.350378 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAValVIMSS1309272  tRNA-Val  83.33 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>