152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_R0035 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_R0035  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0205002  normal  0.0343396 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0049  tRNA-Val  90.54 
 
 		 75 bp  91.7  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.890961 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Val-4  tRNA-Val  90.67 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.464554  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0051  tRNA-Val  90.67 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000353155  normal  0.0160187 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2783  tRNA-Val  90.67 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0812706  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1831  tRNA-Val  90.67 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_R0089  tRNA-Val  90.67 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347614  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0061  tRNA-Val  90.67 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0059  tRNA-Val  90.67 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565602  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2266  tRNA-Val  90.67 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.248753  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3052  tRNA-Val  90.67 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.728072  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2650  tRNA-Val  90.67 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2705  tRNA-Val  90.67 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1539  tRNA-Val  90.67 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.051003  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0025  tRNA-Val  90.67 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.149964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0061  tRNA-Val  90.67 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.700263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0061  tRNA-Val  90.67 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.17954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0038  tRNA-Val  90.67 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.827791  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0069  tRNA-Val  90.41 
 
 		 72 bp  73.8  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00232154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0039  tRNA-Val  89.33 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.867547  hitchhiker  0.000112761 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0026  tRNA-Val  89.83 
 
 		 72 bp  69.9  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.142579 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0038  tRNA-Val  92.16 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.290735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0040  tRNA-Val  92.16 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000348872 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0048  tRNA-Val  86.49 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.546388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0025  tRNA-Val  86.49 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000640058  normal  0.0750081 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0046  tRNA-Val  86.49 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna32  tRNA-Val  86.49 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0039  tRNA-Val  86.49 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.449991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0040  tRNA-Val  86.49 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.451217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0005  tRNA-Val  87.67 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.642292 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0040  tRNA-Val  86.11 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.142714 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0026  tRNA-Val  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  0.000000000373011  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tVal01  tRNA-Val  89.09 
 
 		 81 bp  61.9  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.231904  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0031  tRNA-Val  88 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000478109 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2329  tRNA-Val  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2543  tRNA-Val  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00155589  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0021  tRNA-Val  88 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0056  tRNA-Val  86.57 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.389375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0042  tRNA-Val  91.49 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.209916  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0060  tRNA-Val  88 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000546078  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0003  tRNA-Val  91.3 
 
 		 78 bp  60  0.00000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.401069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0002  tRNA-Val  91.3 
 
 		 78 bp  60  0.00000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.264825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0029  tRNA-Val  97.06 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.198673  normal  0.11041 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6005  tRNA-Val  97.06 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.859444 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0046  tRNA-Val  85.14 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0033  tRNA-Val  96.88 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0037  tRNA-Val  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000442416  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0033  tRNA-Val  96.77 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0025  tRNA-Val  86.67 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000057008  normal  0.409519 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0027  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.31278  normal  0.51175 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0054  tRNA-Val  88.89 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.214372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0044  tRNA-Val  96.77 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00403684  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna058  tRNA-Val  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.007323  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0038  tRNA-Val  96.77 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.666126  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna033  tRNA-Val  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.010484  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0031  tRNA-Val  86.67 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0031  tRNA-Val  96.77 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0117254 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0040  tRNA-Val  96.77 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.90959  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0037  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0054  tRNA-Val  86.67 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.452754 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0001  tRNA-Val  96.77 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.613575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0016  tRNA-Val  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0035  tRNA-Val  96.77 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.491254  normal  0.639036 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0044  tRNA-Val  96.77 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.311014  normal  0.10516 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0036  tRNA-Val  96.77 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000120511 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13890  tRNA-Val  96.77 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0287375  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13840  tRNA-Val  96.77 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.150199  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0018  tRNA-Val  86.67 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0038  tRNA-Val  88.89 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.405817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0036  tRNA-Val  88.89 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.012717  normal  0.28653 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna47  tRNA-Val  86.67 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.625367  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna025  tRNA-Val  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0656621  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_rna012  tRNA-Val  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000043327  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0047  tRNA-Val  94.12 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0036  tRNA-Val  88 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.552883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0052  tRNA-Val  94.12 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.886993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0022  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.448408  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0024  tRNA-Val  87.04 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.422383  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0016  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.372982  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0025  tRNA-Val  88 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0239971 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0017  tRNA-Val  83.78 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00877292  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0040  tRNA-Val  88 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0036  tRNA-Val  96.55 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.821341  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0023  tRNA-Val  86.3 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.720893  normal  0.0127386 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0062  tRNA-Thr  90.24 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14009  tRNA-Thr  90.24 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00250  tRNA-Val  86.79 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00375  tRNA-Val  86.79 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00469  tRNA-Val  86.79 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06828  tRNA-Val  86.79 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0052  tRNA-Arg  88.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.165142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0012  tRNA-Thr  90.24 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16810  tRNA-Val  96.55 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.606714  normal  0.0176901 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0005  tRNA-Val  88.89 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0001  tRNA-Val  88.89 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0028  tRNA-Val  93.75 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.13979  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0024  tRNA-Val  93.75 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0046  tRNA-Val  93.75 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.146675 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0026  tRNA-Val  90 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.218598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAValVIMSS1309212  tRNA-Val  83.33 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.430818  normal  0.748874 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>