215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_R0024 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_R0028  tRNA-Val  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.13979  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0024  tRNA-Val  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0046  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  143  6e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.146675 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0016  tRNA-Val  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0014  tRNA-Val  97.22 
 
 		 72 bp  127  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0013  tRNA-Val  97.22 
 
 		 72 bp  127  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAValVIMSS1309267  tRNA-Val  93.06 
 
 		 72 bp  103  5e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0044  tRNA-Val  93.06 
 
 		 75 bp  103  5e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.311014  normal  0.10516 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0029  tRNA-Val  93.06 
 
 		 75 bp  103  5e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.198673  normal  0.11041 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13860  tRNA-Val  90.28 
 
 		 72 bp  87.7  3e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0312518  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0018  tRNA-Val  90.28 
 
 		 72 bp  87.7  3e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.347531  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0026  tRNA-Val  90.28 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.851542  hitchhiker  0.00348632 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0031  tRNA-Val  90.28 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000478109 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0038  tRNA-Val  90.28 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.666126  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0037  tRNA-Val  90.28 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0040  tRNA-Val  90.28 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.90959  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0036  tRNA-Val  90.28 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000120511 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0033  tRNA-Val  90.28 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16810  tRNA-Val  90.28 
 
 		 72 bp  87.7  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.606714  normal  0.0176901 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAValVIMSS1309212  tRNA-Val  90.28 
 
 		 72 bp  87.7  3e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.430818  normal  0.748874 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15510  tRNA-Val  90.28 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00141573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0060  tRNA-Val  90.28 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000546078  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0025  tRNA-Val  88.89 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000057008  normal  0.409519 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0023  tRNA-Val  88.89 
 
 		 72 bp  79.8  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.720893  normal  0.0127386 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0036  tRNA-Val  88.89 
 
 		 72 bp  79.8  0.00000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0028  tRNA-Val  88.89 
 
 		 72 bp  79.8  0.00000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000436096 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0033  tRNA-Val  88.89 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13890  tRNA-Val  88.89 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0287375  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0026  tRNA-Val  88.89 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000411365 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAValVIMSS1309100  tRNA-Val  88.89 
 
 		 72 bp  79.8  0.00000000000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAValVIMSS1309269  tRNA-Val  88.89 
 
 		 72 bp  79.8  0.00000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAValVIMSS1309382  tRNA-Val  88.89 
 
 		 72 bp  79.8  0.00000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.658487  normal  0.0584078 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAValVIMSS1309173  tRNA-Val  88.89 
 
 		 72 bp  79.8  0.00000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.124324  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0027  tRNA-Val  88.89 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.60657 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0029  tRNA-Val  88.89 
 
 		 72 bp  79.8  0.00000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.575368 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13840  tRNA-Val  88.89 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.150199  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0044  tRNA-Val  88.89 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00403684  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0038  tRNA-Val  87.5 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00268365  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0036  tRNA-Val  87.5 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.821341  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Val-4  tRNA-Val  87.5 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.464554  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0051  tRNA-Val  87.5 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000353155  normal  0.0160187 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0038  tRNA-Val  87.5 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16730  tRNA-Val  87.5 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.251043  normal  0.0595565 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2783  tRNA-Val  87.5 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0812706  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0045  tRNA-Val  87.5 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0069  tRNA-Val  87.5 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00232154  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0028  tRNA-Val  87.5 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00986707 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0061  tRNA-Val  87.5 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.17954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1831  tRNA-Val  87.5 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0052  tRNA-Val  87.5 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.886993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_R0089  tRNA-Val  87.5 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347614  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0027  tRNA-Val  90 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.000000730329  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0061  tRNA-Val  87.5 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0033  tRNA-Val  87.5 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.526612  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0035  tRNA-Val  87.5 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.522217  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0059  tRNA-Val  87.5 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565602  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0025  tRNA-Val  87.5 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000640058  normal  0.0750081 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0049  tRNA-Val  87.5 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16760  tRNA-Val  87.5 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.268589  normal  0.0588163 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2266  tRNA-Val  87.5 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.248753  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0029  tRNA-Val  87.5 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000337509 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3052  tRNA-Val  87.5 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.728072  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2650  tRNA-Val  87.5 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2705  tRNA-Val  87.5 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0008  tRNA-Val  90 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.000000957098  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1539  tRNA-Val  87.5 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.051003  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0038  tRNA-Val  87.5 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.827791  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0031  tRNA-Val  87.5 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000451767 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0061  tRNA-Val  87.5 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.700263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0025  tRNA-Val  87.5 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.149964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0036  tRNA-Val  87.5 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0032  tRNA-Val  87.5 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.463355  normal  0.0505941 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0033  tRNA-Val  87.5 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000837062 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10750  tRNA-Val  88.06 
 
 		 72 bp  69.9  0.00000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0216656  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0032  tRNA-Val  86.11 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0042  tRNA-Val  86.11 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0153066  hitchhiker  0.00834851 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0031  tRNA-Val  86.11 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0117254 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0026  tRNA-Val  86.11 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0408746  normal  0.0924489 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0029  tRNA-Val  86.11 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.742373  hitchhiker  0.00208243 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0021  tRNA-Val  86.11 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1385  tRNA-Val  88.33 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0561605 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0031  tRNA-Val  86.11 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14900  tRNA-Val  86.11 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAValVIMSS1309132  tRNA-Val  86.11 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0037  tRNA-Val  86.11 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.960362  normal  0.0810888 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0041  tRNA-Val  86.11 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000505895  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0030  tRNA-Val  86.11 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0039  tRNA-Val  86.11 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.867547  hitchhiker  0.000112761 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0038  tRNA-Val  90.2 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.405817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0036  tRNA-Val  90.2 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.012717  normal  0.28653 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0056  tRNA-Val  88.14 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.389375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0054  tRNA-Val  90.2 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.214372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0041  tRNA-Val  86.57 
 
 		 72 bp  61.9  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.532077  normal  0.0646966 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1386  tRNA-Val  94.87 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0550643 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0021  tRNA-Val  87.72 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0029  tRNA-Val  84.72 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0044  tRNA-Val  84.72 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.320122  normal  0.198064 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0013  tRNA-Val  84.72 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.736454 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0052  tRNA-Val  84.72 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0037  tRNA-Val  84.72 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.605152  normal  0.0106326 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>