More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_tVal01 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_tVal01  tRNA-Val  100 
 
 		 81 bp  161  3e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.231904  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0003  tRNA-Val  100 
 
 		 78 bp  151  3e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.401069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0002  tRNA-Val  100 
 
 		 78 bp  151  3e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.264825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0060  tRNA-Val  95.16 
 
 		 75 bp  99.6  9e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.206205  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0061  tRNA-Val  95.16 
 
 		 78 bp  99.6  9e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.304237  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0062  tRNA-Val  95.16 
 
 		 78 bp  99.6  9e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.296107  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2329  tRNA-Val  96.43 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2543  tRNA-Val  96.43 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00155589  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna058  tRNA-Val  94.64 
 
 		 76 bp  87.7  4e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.007323  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna025  tRNA-Val  94.64 
 
 		 76 bp  87.7  4e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0656621  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_rna012  tRNA-Val  94.64 
 
 		 76 bp  87.7  4e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000043327  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna033  tRNA-Val  94.64 
 
 		 76 bp  87.7  4e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.010484  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0016  tRNA-Val  97.83 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0037  tRNA-Val  97.83 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000442416  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0001  tRNA-Val  97.78 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00469  tRNA-Val  94.34 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00250  tRNA-Val  94.34 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06828  tRNA-Val  94.34 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00375  tRNA-Val  94.34 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0090  tRNA-Val  91.8 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.825054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0092  tRNA-Val  91.8 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.825054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0091  tRNA-Val  91.8 
 
 		 78 bp  81.8  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.830426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0005  tRNA-Val  97.78 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0059  tRNA-Val  90.62 
 
 		 78 bp  79.8  0.00000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0037  tRNA-Val  90.91 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000120415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0078  tRNA-Val  90.91 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000285873  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0034  tRNA-Val  90.91 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000784133  normal  0.347644 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0039  tRNA-Val  90.91 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000106718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0063  tRNA-Val  90.91 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000284788  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0061  tRNA-Val  90.91 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00024378  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0119  tRNA-Val  90.91 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000206834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0034  tRNA-Val  90.91 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000134518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0068  tRNA-Val  90.91 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000103531  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0062  tRNA-Val  90.91 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00027509  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0115  tRNA-Val  90.91 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000107203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0117  tRNA-Val  90.91 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000194506  normal  0.999094 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0116  tRNA-Val  90.91 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000516317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0120  tRNA-Val  90.91 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000221581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0118  tRNA-Val  90.91 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00020053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0122  tRNA-Val  90.91 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000703597  normal  0.991143 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0121  tRNA-Val  90.91 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000223353  normal  0.991143 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0060  tRNA-Val  90.91 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000229541  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0123  tRNA-Val  90.91 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000761032  normal  0.999094 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0092  tRNA-Val  90.91 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000905029  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0038  tRNA-Val  90.91 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000124113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0032  tRNA-Val  90.91 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000487693  normal  0.350378 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t039  tRNA-Val  90.91 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000279431  normal  0.23935 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0064  tRNA-Val  90.91 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000300215  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0066  tRNA-Val  90.91 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000106688  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0065  tRNA-Val  90.91 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000940035  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0067  tRNA-Val  90.91 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000378114  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0069  tRNA-Val  90.91 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000229651  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0070  tRNA-Val  90.91 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000218766  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0103  tRNA-Val  90.91 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000000279802  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0083  tRNA-Val  90.91 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000131084  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0026  tRNA-Val  90.91 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00167202  normal  0.213758 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0028  tRNA-Val  90.91 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000556083  normal  0.337243 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0027  tRNA-Val  90.91 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000568482  normal  0.334713 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0030  tRNA-Val  90.91 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000589005  normal  0.351876 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0029  tRNA-Val  90.91 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000556083  normal  0.342231 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0036  tRNA-Val  90.91 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000113346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0031  tRNA-Val  90.91 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000509299  normal  0.347644 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0033  tRNA-Val  90.91 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000154108  normal  0.350378 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0035  tRNA-Val  90.91 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000119187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0026  tRNA-Val  91.07 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  0.000000000373011  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0082  tRNA-Val  90.32 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000470368  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0107  tRNA-Val  90.32 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000125343  normal  0.0580705 
 
 
-
 
NC_004347  SO_t075  tRNA-Val  90.32 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0095  tRNA-Val  90.32 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000338058  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0093  tRNA-Val  90.32 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000828011  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0094  tRNA-Val  90.32 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000297438  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0085  tRNA-Val  90.32 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000375389  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0088  tRNA-Val  90.32 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000319875  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0089  tRNA-Val  90.32 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000342234  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0090  tRNA-Val  90.32 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000278646  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0091  tRNA-Val  90.32 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000288629  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0092  tRNA-Val  90.32 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000281148  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0093  tRNA-Val  90.32 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000278646  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t034  tRNA-Val  90.32 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000171056  normal  0.228577 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t036  tRNA-Val  90.32 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000159787  normal  0.229445 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t037  tRNA-Val  90.32 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000163594  normal  0.236842 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t038  tRNA-Val  90.32 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000157336  normal  0.23935 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0105  tRNA-Val  90.32 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000000937132  normal  0.0566469 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0106  tRNA-Val  90.32 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000011333  normal  0.0580705 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0100  tRNA-Val  90.32 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000000389381  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0101  tRNA-Val  90.32 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000000312411  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0102  tRNA-Val  90.32 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000000271468  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0084  tRNA-Val  90.32 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000842373  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0087  tRNA-Val  90.32 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000018587  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0089  tRNA-Val  90.32 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000619858  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0097  tRNA-Val  90.32 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000319482  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0096  tRNA-Val  90.32 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000340582  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0098  tRNA-Val  90.32 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000887403  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0024  tRNA-Val  92.59 
 
 		 73 bp  69.9  0.00000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0168  tRNA-Val  92.59 
 
 		 73 bp  69.9  0.00000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t1830  tRNA-Val  92.59 
 
 		 73 bp  69.9  0.00000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.367633  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0086  tRNA-Val  90.32 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000172065  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0059  tRNA-Val  90.32 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000138631  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t033  tRNA-Val  90.32 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00112794  normal  0.228577 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t035  tRNA-Val  90.32 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00018344  normal  0.230227 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>