19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_R0039 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_R0039  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.02275  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14031  tRNA-Val  93.15 
 
 		 75 bp  105  1e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000460426  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0024  tRNA-Val  92.65 
 
 		 75 bp  95.6  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0021  tRNA-Val  87.84 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0018  tRNA-Val  86.49 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0243467  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0017  tRNA-Val  86.49 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0017  tRNA-Val  86.49 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.217131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0043  tRNA-Val  86.11 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0298498  normal  0.206957 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0032  tRNA-Val  87.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00002348 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0031  tRNA-Val  87.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0117254 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0002  tRNA-Arg  100 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000177149  normal  0.0400034 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0021  tRNA-Val  100 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0021  tRNA-Val  100 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.357184  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0029  tRNA-Val  100 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0046  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0191389  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0019  tRNA-Arg  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.414165 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0047  tRNA-Asn  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0440889 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0052  tRNA-Val  89.47 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.587124 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2270  hypothetical protein  100 
 
 		 333 bp  44.1  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>