299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_R0052 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_R0052  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.886993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6005  tRNA-Val  97.33 
 
 		 75 bp  133  6e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.859444 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0052  tRNA-Val  97.33 
 
 		 75 bp  133  6e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0029  tRNA-Val  94.59 
 
 		 75 bp  115  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.198673  normal  0.11041 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0001  tRNA-Val  93.33 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.613575  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0026  tRNA-Val  93.33 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0408746  normal  0.0924489 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14900  tRNA-Val  93.33 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0025  tRNA-Val  93.33 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000640058  normal  0.0750081 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0035  tRNA-Val  93.33 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.491254  normal  0.639036 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0042  tRNA-Val  93.33 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0153066  hitchhiker  0.00834851 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0030  tRNA-Val  93.24 
 
 		 75 bp  107  4e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0037  tRNA-Val  93.06 
 
 		 72 bp  103  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.960362  normal  0.0810888 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0029  tRNA-Val  93.06 
 
 		 72 bp  103  6e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.742373  hitchhiker  0.00208243 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4309  tRNA-Val  92 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0047  tRNA-Val  92 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0001  tRNA-Val  92 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.709613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0013  tRNA-Val  92 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.736454 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0001  tRNA-Val  92 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0033  tRNA-Val  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0044  tRNA-Val  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00403684  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0032  tRNA-Val  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00002348 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0047  tRNA-Val  90.54 
 
 		 75 bp  91.7  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.561657  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0018  tRNA-Val  90.28 
 
 		 72 bp  87.7  3e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.347531  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0023  tRNA-Val  90.28 
 
 		 72 bp  87.7  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.720893  normal  0.0127386 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0026  tRNA-Val  91.18 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000113953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAValVIMSS1309212  tRNA-Val  90.28 
 
 		 72 bp  87.7  3e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.430818  normal  0.748874 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2705  tRNA-Val  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Val-4  tRNA-Val  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.464554  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0051  tRNA-Val  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000353155  normal  0.0160187 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2783  tRNA-Val  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0812706  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0045  tRNA-Val  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0038  tRNA-Val  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.827791  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0031  tRNA-Val  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000478109 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2266  tRNA-Val  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.248753  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1831  tRNA-Val  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3052  tRNA-Val  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.728072  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_R0089  tRNA-Val  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347614  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0025  tRNA-Val  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.149964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1539  tRNA-Val  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.051003  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0061  tRNA-Val  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0059  tRNA-Val  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565602  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0049  tRNA-Val  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2650  tRNA-Val  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0061  tRNA-Val  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.700263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0060  tRNA-Val  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000546078  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0061  tRNA-Val  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.17954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0002  tRNA-Val  89.71 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.884588  normal  0.179612 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0026  tRNA-Val  88.89 
 
 		 72 bp  79.8  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0265977  hitchhiker  0.000432959 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0069  tRNA-Val  88.89 
 
 		 72 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00232154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0019  tRNA-Val  89.71 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0059  tRNA-Val  89.71 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.40098  normal  0.609607 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0013  tRNA-Val  89.71 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.38084 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0074  tRNA-Val  89.71 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0744587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0046  tRNA-Val  89.71 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.052544 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0028  tRNA-Val  89.71 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.163089  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0013  tRNA-Val  89.71 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.688167  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAValVIMSS1309382  tRNA-Val  88.89 
 
 		 72 bp  79.8  0.00000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.658487  normal  0.0584078 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAValVIMSS1309269  tRNA-Val  88.89 
 
 		 72 bp  79.8  0.00000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0028  tRNA-Val  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00986707 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0032  tRNA-Val  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0051  tRNA-Val  88.73 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000163002  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0025  tRNA-Val  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000057008  normal  0.409519 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0040  tRNA-Val  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.451217  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0029  tRNA-Val  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000337509 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0036  tRNA-Val  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna32  tRNA-Val  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0039  tRNA-Val  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.449991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0038  tRNA-Val  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0033  tRNA-Val  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.526612  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0035  tRNA-Val  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.522217  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0031  tRNA-Val  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0032  tRNA-Val  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.463355  normal  0.0505941 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0036  tRNA-Val  87.84 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000120511 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0038  tRNA-Val  87.84 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.666126  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0031  tRNA-Val  87.84 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0117254 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0040  tRNA-Val  87.84 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.90959  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0033  tRNA-Val  87.84 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0015  tRNA-Val  87.67 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0817161  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0014  tRNA-Val  87.67 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14860  tRNA-Val  87.67 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.303289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0046  tRNA-Val  87.67 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.467185  normal  0.202309 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0014  tRNA-Val  87.67 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.591193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14034  tRNA-Val  87.67 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000622318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0105  tRNA-Val  90.16 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0018  tRNA-Val  87.67 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0044  tRNA-Val  89.23 
 
 		 72 bp  73.8  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRAt01  tRNA-Val  88.24 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.762273  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16730  tRNA-Val  87.5 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.251043  normal  0.0595565 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0016  tRNA-Val  87.5 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4574  tRNA-Val  88.24 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0200099  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0028  tRNA-Val  87.5 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.13979  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0043  tRNA-Val  88.24 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0024  tRNA-Val  87.5 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0044  tRNA-Val  87.5 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.320122  normal  0.198064 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0045  tRNA-Val  88.24 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.374674 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0048  tRNA-Val  88.24 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0187429  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_R0073  tRNA-Val  88.24 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16810  tRNA-Val  87.5 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.606714  normal  0.0176901 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0044  tRNA-Val  88.24 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.306747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0039  tRNA-Val  88.24 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.910644  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>