145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_R0015 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_R0015  tRNA-Val  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000000205698  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0026  tRNA-Val  97.1 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0033  tRNA-Val  97.06 
 
 		 74 bp  119  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0053  tRNA-Val  95.77 
 
 		 77 bp  117  3.9999999999999997e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0873696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0023  tRNA-Val  94.37 
 
 		 77 bp  109  9.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.169175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0024  tRNA-Val  94.37 
 
 		 77 bp  109  9.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.469275  hitchhiker  0.0000034793 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0054  tRNA-Val  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00910713  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0003  tRNA-Val  89.61 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0049  tRNA-Val  89.61 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000683912  normal  0.27317 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0033  tRNA-Val  91.23 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0032  tRNA-Val  91.23 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00002348 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0053  tRNA-Val  86.84 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0042  tRNA-Val  91.07 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0153066  hitchhiker  0.00834851 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0026  tRNA-Val  91.07 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0408746  normal  0.0924489 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0044  tRNA-Val  91.07 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00403684  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14900  tRNA-Val  91.07 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0031  tRNA-Val  91.07 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0117254 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0010  tRNA-Val  86.67 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0030  tRNA-Val  90.91 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0001  tRNA-Val  89.66 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0036  tRNA-Val  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.432227 
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Val-2  tRNA-Val  85.71 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000334583  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0036  tRNA-Val  85.71 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0029  tRNA-Val  90.57 
 
 		 72 bp  65.9  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.742373  hitchhiker  0.00208243 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_966  tRNA-Val  85.71 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00216309  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0037  tRNA-Val  90.57 
 
 		 72 bp  65.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.960362  normal  0.0810888 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0038  tRNA-Val  90.38 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.666126  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0040  tRNA-Val  90.38 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.90959  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0033  tRNA-Val  90.38 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0036  tRNA-Val  90.38 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000120511 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0012  tRNA-Val  88.14 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000513005  hitchhiker  0.00749206 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0049  tRNA-Val  88.14 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0048  tRNA-Val  88.14 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0035  tRNA-Val  85.92 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00123613  unclonable  0.0000000227981 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16810  tRNA-Val  90 
 
 		 72 bp  60  0.00000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.606714  normal  0.0176901 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0057  tRNA-Val  86.89 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.385214  hitchhiker  0.00196821 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0022  tRNA-Val  84.42 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0746641  normal  0.301569 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0068  tRNA-Val  84.72 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.392082  normal  0.0474076 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0057  tRNA-Val  84.72 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.858787  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0029  tRNA-Val  87.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.198673  normal  0.11041 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0013  tRNA-Val  96.88 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.276155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0035  tRNA-Val  84.51 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0047  tRNA-Val  87.27 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.561657  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0017  tRNA-Val  86.44 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0025  tRNA-Val  86.44 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.19601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0015  tRNA-Val  86.21 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0037  tRNA-Val  83.78 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0052  tRNA-Val  87.1 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.587124 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0045  tRNA-Val  96.55 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0449962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0044  tRNA-Val  88.89 
 
 		 75 bp  50.1  0.00008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.311014  normal  0.10516 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6005  tRNA-Val  85.96 
 
 		 75 bp  50.1  0.00008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.859444 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0064  tRNA-Val  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.192566  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Val-4  tRNA-Val  93.75 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.464554  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0051  tRNA-Val  93.75 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000353155  normal  0.0160187 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14160  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2783  tRNA-Val  93.75 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0812706  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08680  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00345298  normal  0.233368 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t06  tRNA-Val  96.43 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1831  tRNA-Val  93.75 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13730  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0026  tRNA-Val  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  0.000000000373011  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0039  tRNA-Val  96.43 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.430844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0020  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000252373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_R0089  tRNA-Val  93.75 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347614  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0013  tRNA-Val  87.5 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.736454 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0061  tRNA-Val  93.75 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0019  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000264705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0059  tRNA-Val  93.75 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565602  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2266  tRNA-Val  93.75 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.248753  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3052  tRNA-Val  93.75 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.728072  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0001  tRNA-Val  93.75 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.613575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2650  tRNA-Val  93.75 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2705  tRNA-Val  93.75 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1539  tRNA-Val  93.75 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.051003  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0035  tRNA-Val  93.75 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.491254  normal  0.639036 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0025  tRNA-Val  93.75 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.149964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0061  tRNA-Val  93.75 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.700263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0061  tRNA-Val  93.75 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.17954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0038  tRNA-Val  93.75 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.827791  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0035  tRNA-Val  93.55 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0205002  normal  0.0343396 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0039  tRNA-His  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0033  tRNA-Val  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna101  tRNA-Asn  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000041783  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0004  tRNA-Val  93.55 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0051  tRNA-Val  93.55 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000148873  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna098  tRNA-Asn  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000481863  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna095  tRNA-Asn  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000672543  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0026  tRNA-Val  93.55 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna093  tRNA-Asn  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000268933  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04040  tRNA-Val  90.48 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0006  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0007  tRNA-Val  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.309042  normal  0.118966 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0011  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0219307 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07715  tRNA-Met  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.461139  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0014  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0037  tRNA-Val  86.21 
 
 		 78 bp  44.1  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0035  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1085  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0063  tRNA-Met  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>