258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_t06 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_t06  tRNA-Val  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0050  tRNA-Val  97.37 
 
 		 77 bp  135  1.9999999999999998e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0007  tRNA-Val  94.59 
 
 		 74 bp  115  2.0000000000000002e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.309042  normal  0.118966 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0022  tRNA-Val  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0746641  normal  0.301569 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0037  tRNA-Val  96.77 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0018  tRNA-Val  96.72 
 
 		 74 bp  105  1e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0018  tRNA-Val  95.08 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0063  tRNA-Val  96.43 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0040  tRNA-Val  96.15 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.949801 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0042  tRNA-Val  96.15 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.206576  normal  0.0624418 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0019  tRNA-Val  92.86 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.941577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0012  tRNA-Val  92.86 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0036  tRNA-Val  92.73 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0039  tRNA-Val  97.62 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0173168  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0025  tRNA-Val  97.62 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000321659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0023  tRNA-Val  90.16 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11940  tRNA-Val  86.84 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000016484  normal  0.0993064 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0028  tRNA-Val  89.47 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0035  tRNA-Val  85.53 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00123613  unclonable  0.0000000227981 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0047  tRNA-Val  90.38 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0087743  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02187  tRNA-Val  89.29 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0111  tRNA-Val  89.09 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0150231  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0066  tRNA-Val  89.09 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00442679  hitchhiker  0.000900174 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0084  tRNA-Val  89.09 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0193203  normal  0.0545316 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0081  tRNA-Val  89.09 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0183039  normal  0.0880297 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0029  tRNA-Val  92 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0012  tRNA-Val  93.02 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000513005  hitchhiker  0.00749206 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0060  tRNA-Val  89.09 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00132937  hitchhiker  0.000239512 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0026  tRNA-Val  92 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.179113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0037  tRNA-Val  92 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.605152  normal  0.0106326 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0109  tRNA-Val  89.09 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0124836  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0079  tRNA-Val  89.09 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0663805  normal  0.0847945 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0025  tRNA-Val  89.09 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000000368107  normal  0.0217616 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0068  tRNA-Val  89.09 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0104216  hitchhiker  0.000843897 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0010  tRNA-Val  85.33 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0003  tRNA-Val  94.74 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_t039  tRNA-Val  92.86 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t040  tRNA-Val  92.86 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0064  tRNA-Val  92.86 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00446845  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0074  tRNA-Val  92.86 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00199895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0062  tRNA-Val  92.86 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.373541  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t069  tRNA-Val  92.86 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00122297  hitchhiker  0.00465561 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0049  tRNA-Val  94.74 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000683912  normal  0.27317 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0061  tRNA-Val  92.86 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.366342  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0073  tRNA-Val  92.86 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00216703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0061  tRNA-Val  92.86 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.144549  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0062  tRNA-Val  92.86 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.202264  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0036  tRNA-Val  100 
 
 		 72 bp  60  0.00000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.821341  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t068  tRNA-Val  92.86 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0011202  hitchhiker  0.00473676 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0089  tRNA-Val  92.86 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000402356  normal  0.221127 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0090  tRNA-Val  92.86 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000384332  normal  0.221127 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0100  tRNA-Val  92.86 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00395733  normal  0.242808 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0101  tRNA-Val  92.86 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.003873  normal  0.249554 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0085  tRNA-Val  92.86 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0569302  hitchhiker  0.00000332622 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0086  tRNA-Val  92.86 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.236197  normal  0.0136376 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0087  tRNA-Val  92.86 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.235286  normal  0.0134883 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0041  tRNA-Val  91.84 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.424139  normal  0.210105 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0067  tRNA-Val  92.86 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.325907  normal  0.0460929 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0063  tRNA-Val  92.86 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00384271  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0042  tRNA-Val  92.86 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00634518  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0043  tRNA-Val  92.86 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00131984  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0068  tRNA-Val  94.59 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.392082  normal  0.0474076 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0032  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0046  tRNA-Val  85.53 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14860  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.303289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2615  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.71269  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Val-2  tRNA-Val  100 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000334583  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Val-1  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.0049359  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0015  tRNA-Val  87.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_966  tRNA-Val  100 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00216309  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0052  tRNA-Val  90.91 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00919857  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0035  tRNA-Val  87.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0021  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0144657  normal  0.36354 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0037  tRNA-Val  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00204676  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0039  tRNA-Val  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00777868  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0053  tRNA-Val  100 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0039  tRNA-Val  100 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.430844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0036  tRNA-Val  100 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.432227 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0042  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.288324  hitchhiker  0.00194275 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0036  tRNA-Val  100 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0037  tRNA-Val  84.21 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0260915  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0045  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.218137  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0001  tRNA-Val  94.44 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0033  tRNA-Val  100 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0032  tRNA-Val  96.77 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00000020219  hitchhiker  8.04575e-18 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0007  tRNA-Val  89.09 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00275012  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0033  tRNA-Val  87.27 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000435872  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0037  tRNA-Val  93.02 
 
 		 78 bp  54  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0054  tRNA-Val  92.11 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00910713  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna123  tRNA-Val  90.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.193593  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0051  tRNA-Val  90.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.959203 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0088  tRNA-Val  90.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.109488  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0010  tRNA-Val  90.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.194881 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0073  tRNA-Val  90.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.618922  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0074  tRNA-Val  90.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.593802  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02186  tRNA-Val  90.48 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0066  tRNA-Val  90.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.603715  normal  0.0472692 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0010  tRNA-Val  90.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.239466  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0023  tRNA-Val  90.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.885733 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0040  tRNA-Val  84.21 
 
 		 75 bp  50.1  0.00008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.451217  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>