More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_R0051 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007947  Mfla_R0051  tRNA-Val  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.959203 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0037  tRNA-Val  93.33 
 
 		 78 bp  101  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0073  tRNA-Val  90.67 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.618922  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0074  tRNA-Val  90.67 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.593802  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0066  tRNA-Val  90.67 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.603715  normal  0.0472692 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0074  tRNA-Val  89.33 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00199895  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_t039  tRNA-Val  89.33 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t040  tRNA-Val  89.33 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0043  tRNA-Val  89.33 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00131984  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0062  tRNA-Val  89.33 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.373541  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0073  tRNA-Val  89.33 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00216703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0042  tRNA-Val  89.33 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00634518  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0061  tRNA-Val  89.33 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.144549  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0062  tRNA-Val  89.33 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.202264  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0061  tRNA-Val  89.33 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.366342  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0063  tRNA-Val  89.33 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00384271  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0089  tRNA-Val  89.33 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000402356  normal  0.221127 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0090  tRNA-Val  89.33 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000384332  normal  0.221127 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0100  tRNA-Val  89.33 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00395733  normal  0.242808 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0101  tRNA-Val  89.33 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.003873  normal  0.249554 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0064  tRNA-Val  89.33 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00446845  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0085  tRNA-Val  89.33 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0569302  hitchhiker  0.00000332622 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0086  tRNA-Val  89.33 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.236197  normal  0.0136376 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0087  tRNA-Val  89.33 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.235286  normal  0.0134883 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0067  tRNA-Val  89.33 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.325907  normal  0.0460929 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t068  tRNA-Val  89.19 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0011202  hitchhiker  0.00473676 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t069  tRNA-Val  89.19 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00122297  hitchhiker  0.00465561 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0010  tRNA-Val  88.89 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.239466  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2130  tRNA-Val  91.04 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2208  tRNA-Val  91.04 
 
 		 78 bp  77.8  0.0000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0076  tRNA-Val  89.23 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00448767  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4229  tRNA-Val  89.23 
 
 		 79 bp  73.8  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000067821  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2580  tRNA-Val  89.23 
 
 		 79 bp  73.8  0.000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0938444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4230  tRNA-Val  89.23 
 
 		 79 bp  73.8  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000689927  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0075  tRNA-Val  89.23 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00433017  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2581  tRNA-Val  88.71 
 
 		 79 bp  67.9  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0567199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna124  tRNA-Val  87.69 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.12558  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0109  tRNA-Val  87.69 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0124836  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0081  tRNA-Val  87.69 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0183039  normal  0.0880297 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1751  tRNA-Val  88.52 
 
 		 79 bp  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000295955  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1533  tRNA-Val  88.52 
 
 		 79 bp  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.102488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1556  tRNA-Val  88.52 
 
 		 79 bp  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0079  tRNA-Val  87.69 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0663805  normal  0.0847945 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1519  tRNA-Val  88.52 
 
 		 79 bp  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000581354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0111  tRNA-Val  87.69 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0150231  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0084  tRNA-Val  87.69 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0193203  normal  0.0545316 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0060  tRNA-Val  87.69 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00132937  hitchhiker  0.000239512 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0068  tRNA-Val  87.69 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0104216  hitchhiker  0.000843897 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0066  tRNA-Val  87.69 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00442679  hitchhiker  0.000900174 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1920  tRNA-Val  88.52 
 
 		 79 bp  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0104306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0043  tRNA-Val  86.11 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.13273  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RS05795  tRNA-OTHER  86.11 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0025  tRNA-Val  86.11 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0057  tRNA-Val  85.53 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.385214  hitchhiker  0.00196821 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0045  tRNA-Val  86.11 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0020  tRNA-Val  86.11 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.649475  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0010  tRNA-Val  86.11 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.116783  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0021  tRNA-Val  86.11 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0026  tRNA-Val  86.11 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.211344  normal  0.0167997 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0017  tRNA-Val  86.11 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00286264  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0029  tRNA-Val  86.11 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0528689 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0041  tRNA-Val  86.11 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.0000251829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0010  tRNA-Val  86.11 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00245461  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0042  tRNA-Val  86.11 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00372557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0032  tRNA-Val  86.11 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.100652  normal  0.0918353 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0045  tRNA-Val  86.11 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00877282  normal  0.995576 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0050  tRNA-Val  86.11 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0857362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0032  tRNA-Val  86.11 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00000020219  hitchhiker  8.04575e-18 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0033  tRNA-Val  86.11 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.449979  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0029  tRNA-Val  86.11 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.804432  normal  0.0419406 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0026  tRNA-Val  86.11 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.478102  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0015  tRNA-Val  86.11 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000941457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_R0080  tRNA-Val  86.11 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0217837  normal  0.25513 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0022  tRNA-Val  86.11 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.766553  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0047  tRNA-Val  86.11 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.877588  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0054  tRNA-Val  86.11 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.125066 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0054  tRNA-Val  86.11 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0029  tRNA-Val  86.11 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0041  tRNA-Val  86.11 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.352531  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0019  tRNA-Val  90.38 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.941577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0016  tRNA-Val  86.11 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_R0076  tRNA-Val  86.11 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.369233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0039  tRNA-Val  86.11 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0358134  normal  0.456153 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0042  tRNA-Val  86.11 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.921175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4228  tRNA-Val  88.14 
 
 		 79 bp  61.9  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000102748  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0023  tRNA-Val  88.14 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.885733 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0049  tRNA-Val  88.14 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00100813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0077  tRNA-Val  88.14 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00426255  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0018  tRNA-Val  92.86 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0040  tRNA-Val  92.86 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.949801 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0039  tRNA-Val  92.86 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0173168  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0025  tRNA-Val  92.86 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000321659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0042  tRNA-Val  92.86 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.206576  normal  0.0624418 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0063  tRNA-Val  92.86 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0036  tRNA-Val  92.86 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0063  tRNA-Val  86.15 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000215806  hitchhiker  0.00000333382 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0027  tRNA-Val  87.72 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.543066  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1202  tRNA-Val  86.15 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0491839  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2379  tRNA-Val  86.15 
 
 		 79 bp  58  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000292558  hitchhiker  0.00911124 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2149  tRNA-Val  86.15 
 
 		 79 bp  58  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000169486  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>