246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_R0010 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_R0010  tRNA-Val  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.194881 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0023  tRNA-Val  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.885733 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0032  tRNA-Val  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00000020219  hitchhiker  8.04575e-18 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0047  tRNA-Val  92.11 
 
 		 77 bp  103  6e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.877588  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0022  tRNA-Val  92.11 
 
 		 77 bp  103  6e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.766553  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Val-2  tRNA-Val  92.11 
 
 		 77 bp  103  6e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0045  tRNA-Val  92.11 
 
 		 77 bp  103  6e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.431879  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0042  tRNA-Val  92.11 
 
 		 77 bp  103  6e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00372557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0026  tRNA-Val  92.11 
 
 		 77 bp  103  6e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.211344  normal  0.0167997 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0017  tRNA-Val  92.11 
 
 		 77 bp  103  6e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00286264  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0026  tRNA-Val  92.11 
 
 		 77 bp  103  6e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.478102  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0043  tRNA-Val  92.11 
 
 		 77 bp  103  6e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.13273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0010  tRNA-Val  92.11 
 
 		 77 bp  103  6e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00245461  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0032  tRNA-Val  92.11 
 
 		 77 bp  103  6e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.100652  normal  0.0918353 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0029  tRNA-Val  92.11 
 
 		 77 bp  103  6e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0528689 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0016  tRNA-Val  92.11 
 
 		 77 bp  103  6e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0039  tRNA-Val  92.11 
 
 		 77 bp  103  6e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0358134  normal  0.456153 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0042  tRNA-Val  92.11 
 
 		 77 bp  103  6e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.921175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0054  tRNA-Val  92.11 
 
 		 77 bp  103  6e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.125066 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0045  tRNA-Val  92.11 
 
 		 77 bp  103  6e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t34  tRNA-Val  91.67 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0987104  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t35  tRNA-Val  91.67 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0521138  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA41  tRNA-Val  91.67 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.179382 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA42  tRNA-Val  91.67 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.191671  normal  0.176048 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R39  tRNA-Val  91.67 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0141809  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RS05795  tRNA-OTHER  90.28 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0045  tRNA-Val  90.28 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00877282  normal  0.995576 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0010  tRNA-Val  90.28 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.116783  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0021  tRNA-Val  90.28 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0027  tRNA-Val  89.47 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.543066  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_R0076  tRNA-Val  90.28 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.369233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0050  tRNA-Val  90.28 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0857362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0015  tRNA-Val  90.28 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000941457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_R0080  tRNA-Val  90.28 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0217837  normal  0.25513 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0041  tRNA-Val  90.28 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.0000251829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0033  tRNA-Val  90.28 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.449979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0029  tRNA-Val  89.47 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0041  tRNA-Val  90.28 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.352531  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0025  tRNA-Val  90.28 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0029  tRNA-Val  90.28 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.804432  normal  0.0419406 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0054  tRNA-Val  90.28 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0020  tRNA-Val  90.28 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.649475  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t068  tRNA-Val  93.22 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0011202  hitchhiker  0.00473676 
 
 
-
 
NC_004347  SO_t039  tRNA-Val  93.22 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t040  tRNA-Val  93.22 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0049  tRNA-Val  92.06 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00100813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0064  tRNA-Val  93.22 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00446845  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t069  tRNA-Val  93.22 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00122297  hitchhiker  0.00465561 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0061  tRNA-Val  93.22 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.144549  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0062  tRNA-Val  93.22 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.202264  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0074  tRNA-Val  93.22 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00199895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0089  tRNA-Val  93.22 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000402356  normal  0.221127 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0090  tRNA-Val  93.22 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000384332  normal  0.221127 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0100  tRNA-Val  93.22 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00395733  normal  0.242808 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0101  tRNA-Val  93.22 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.003873  normal  0.249554 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0073  tRNA-Val  93.22 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.618922  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0074  tRNA-Val  93.22 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.593802  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0062  tRNA-Val  93.22 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.373541  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0073  tRNA-Val  93.22 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00216703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0085  tRNA-Val  93.22 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0569302  hitchhiker  0.00000332622 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0086  tRNA-Val  93.22 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.236197  normal  0.0136376 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0087  tRNA-Val  93.22 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.235286  normal  0.0134883 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0066  tRNA-Val  93.22 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.603715  normal  0.0472692 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0067  tRNA-Val  93.22 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.325907  normal  0.0460929 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0061  tRNA-Val  93.22 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.366342  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0063  tRNA-Val  93.22 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00384271  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0042  tRNA-Val  93.22 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00634518  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0043  tRNA-Val  93.22 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00131984  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_R0076  tRNA-Val  88.89 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.083212  hitchhiker  0.00562166 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Val-2  tRNA-Val  88.89 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0034  tRNA-Val  88.89 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1888  tRNA-Val  88.89 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.207939  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1133  tRNA-Val  88.89 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.646427  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0339  tRNA-Val  88.89 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0351781  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2596  tRNA-Val  88.89 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_BR0006  tRNA-Val  88.89 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0001  tRNA-Val  88.89 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.400265  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0026  tRNA-Val  88.89 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000276019  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0004  tRNA-Val  88.89 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0580435  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0004  tRNA-Val  88.89 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0212233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0004  tRNA-Val  88.89 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105423  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0039  tRNA-Val  88.89 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00187665  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0001  tRNA-Val  88.89 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2457  tRNA-Val  88.89 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0499895  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1541  tRNA-Val  88.89 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.713195  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0041  tRNA-Val  88.89 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0075941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0004  tRNA-Val  88.89 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.559063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0203  tRNA-Val  88.89 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00945827  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1710  tRNA-Val  88.89 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.713691  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2904  tRNA-Val  88.89 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1734  tRNA-Val  88.89 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.528515  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2749  tRNA-Val  88.89 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0961  tRNA-Val  88.89 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.0032972  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_t55  tRNA-Val  91.53 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.38897  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t56  tRNA-Val  91.53 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0111  tRNA-Val  91.53 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0150231  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0012  tRNA-Val  90.48 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000181787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0060  tRNA-Val  91.53 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00132937  hitchhiker  0.000239512 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0079  tRNA-Val  91.53 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0663805  normal  0.0847945 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0081  tRNA-Val  91.53 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0183039  normal  0.0880297 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>