299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_R0039 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_R0039  tRNA-Val  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.430844  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0013  tRNA-Val  93.51 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0039  tRNA-Val  90.91 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0206433  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0051  tRNA-Val  97.96 
 
 		 74 bp  89.7  9e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000148873  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0033  tRNA-Val  97.78 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000215711  hitchhiker  0.00721353 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0058  tRNA-Val  97.78 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.703111  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0027  tRNA-Val  91.53 
 
 		 73 bp  69.9  0.00000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0709  tRNA-Val  95.35 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0046  tRNA-Asp  91.23 
 
 		 78 bp  65.9  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000106741  normal  0.144267 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t07  tRNA-Asp  91.23 
 
 		 78 bp  65.9  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.802625  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0044  tRNA-Val  89.23 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000266715 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0045  tRNA-Val  89.23 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0252567  normal  0.0396614 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0042  tRNA-Val  89.23 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000279186  hitchhiker  0.00179895 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10340  tRNA-Val  93.33 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0379292 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0038  tRNA-Val  93.33 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.978426  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t0455  tRNA-Val  97.3 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.13115 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1582  tRNA-Val  97.3 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1617  tRNA-Val  97.3 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.623903 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0041  tRNA-Val  93.33 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345856  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0041  tRNA-Asp  91.23 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0134468  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0051  tRNA-Asp  91.23 
 
 		 78 bp  65.9  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.681144  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0053  tRNA-Val  88.33 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0039  tRNA-Asp  89.29 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00299876 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0015  tRNA-Asp  89.29 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA43  tRNA-Asp  89.29 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.353058 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0031  tRNA-Asp  89.29 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0034  tRNA-Asp  89.29 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0659672  normal  0.192968 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0031  tRNA-Asp  89.29 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0703177 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0021  tRNA-Asp  89.29 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0046  tRNA-Asp  89.29 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.165738 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0043  tRNA-Asp  89.29 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.956354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0060  tRNA-Asp  89.29 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.285107  normal  0.0443211 
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Val-3  tRNA-Val  88.14 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00184226  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna025  tRNA-Val  88.89 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0656621  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1248  tRNA-Val  88.14 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.134542  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0087  tRNA-Val  89.83 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000197296  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0054  tRNA-Val  89.83 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000682201  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00375  tRNA-Val  88.89 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_rna012  tRNA-Val  88.89 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000043327  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00469  tRNA-Val  88.89 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00250  tRNA-Val  88.89 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna033  tRNA-Val  88.89 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.010484  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna058  tRNA-Val  88.89 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.007323  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0074  tRNA-Val  89.83 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0036  tRNA-Val  88.14 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.432227 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAValVIMSS1309272  tRNA-Val  94.87 
 
 		 72 bp  61.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06828  tRNA-Val  88.89 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0046  tRNA-Val  88.14 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.461452  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0005  tRNA-Val  86.49 
 
 		 73 bp  60  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.642292 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0040  tRNA-Val  93.33 
 
 		 72 bp  60  0.00000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.142714 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0051  tRNA-Val  89.66 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0014  tRNA-Val  89.66 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0003  tRNA-Val  93.33 
 
 		 72 bp  60  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0052  tRNA-Asp  90.74 
 
 		 78 bp  60  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000156743  normal  0.332639 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03750  tRNA-Val  89.8 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00394114  normal  0.229582 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0053  tRNA-Val  87.5 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000170226  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4570  tRNA-Arg  86.89 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.188546  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0022  tRNA-Val  88.68 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.267849  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0027  tRNA-Val  91.11 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0027  tRNA-Arg  86.89 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.005  hitchhiker  0.000281231 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0016  tRNA-Val  89.47 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAValVIMSS1309362  tRNA-Val  91.11 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0045  tRNA-Val  91.11 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.106461  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0025  tRNA-Asp  88.68 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0357766  normal  0.112448 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0019  tRNA-Asp  89.47 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  6.4765400000000006e-24  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0006  tRNA-Asp  88.68 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.604068 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0049  tRNA-Val  100 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000683912  normal  0.27317 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0026  tRNA-Asp  88.68 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0364321  normal  0.064648 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0027  tRNA-Asp  88.68 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.221595  normal  0.0673851 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t1227  tRNA-Val  94.59 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.411176  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0037  tRNA-Val  89.47 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000442416  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0003  tRNA-Val  100 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAValVIMSS1309068  tRNA-Val  91.11 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAValVIMSS1309119  tRNA-Val  91.11 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.255702  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAValVIMSS1309186  tRNA-Val  91.11 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.8123 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0027  tRNA-Asp  88.68 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0556629  normal  0.064648 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAValVIMSS1309144  tRNA-Val  91.11 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0213338  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0050  tRNA-Asp  90.57 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Val-2  tRNA-Val  100 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000334583  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0046  tRNA-Asp  87.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0068  tRNA-Val  100 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.392082  normal  0.0474076 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0035  tRNA-Asp  87.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.143388 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0033  tRNA-Asp  87.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0194372  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0034  tRNA-Asp  87.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0194372  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2440  tRNA-Val  90.91 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0045  tRNA-Asp  87.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2943  tRNA-Val  90.91 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.24885  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0013  tRNA-Asp  87.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2946  tRNA-Val  90.91 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.411322  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2949  tRNA-Val  90.91 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.116038  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2150  tRNA-Val  90.91 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2626  tRNA-Val  90.91 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.888803  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2629  tRNA-Val  90.91 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.8453  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2632  tRNA-Val  90.91 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.602317  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0037  tRNA-Asp  87.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0047  tRNA-Val  96.88 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0045  tRNA-Val  94.44 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00029215  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0036  tRNA-Val  100 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0049  tRNA-Asp  87.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0048  tRNA-Asp  87.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>