More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2946 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2440  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2943  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.24885  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2946  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.411322  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2949  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.116038  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2150  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2626  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.888803  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2629  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.8453  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2632  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.602317  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0044  tRNA-Val  95.71 
 
 		 76 bp  115  1.0000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000266715 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0042  tRNA-Val  95.71 
 
 		 76 bp  115  1.0000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000279186  hitchhiker  0.00179895 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0045  tRNA-Val  95.71 
 
 		 76 bp  115  1.0000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0252567  normal  0.0396614 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0024  tRNA-Val  100 
 
 		 73 bp  115  1.0000000000000001e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0168  tRNA-Val  100 
 
 		 73 bp  115  1.0000000000000001e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t1830  tRNA-Val  100 
 
 		 73 bp  115  1.0000000000000001e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.367633  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0001  tRNA-Val  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0005  tRNA-Val  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0011  tRNA-Val  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000197558  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0063  tRNA-Val  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000000708072  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t075  tRNA-Val  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t077  tRNA-Val  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0016  tRNA-Val  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0037  tRNA-Val  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000442416  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0061  tRNA-Val  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000239094  normal  0.0392257 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0061  tRNA-Val  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000062426  normal  0.68295 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0059  tRNA-Val  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000138631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t1227  tRNA-Val  96.55 
 
 		 73 bp  99.6  9e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.411176  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10340  tRNA-Val  93.15 
 
 		 75 bp  97.6  4e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0379292 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0013  tRNA-Val  96.49 
 
 		 76 bp  97.6  4e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0105  tRNA-Val  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000000937132  normal  0.0566469 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0095  tRNA-Val  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000338058  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0016  tRNA-Val  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0113655  normal  0.435414 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0079  tRNA-Val  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000283513  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0110  tRNA-Val  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00758879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0026  tRNA-Val  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000755245 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0014  tRNA-Val  95 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t074  tRNA-Val  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t076  tRNA-Val  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0094  tRNA-Val  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000297438  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0093  tRNA-Val  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000828011  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0097  tRNA-Val  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000319482  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0096  tRNA-Val  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000340582  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0107  tRNA-Val  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000125343  normal  0.0580705 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0104  tRNA-Val  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000459096  normal  0.0566469 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0008  tRNA-Val  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.138827  hitchhiker  0.000689808 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0089  tRNA-Val  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000619858  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0086  tRNA-Val  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000172065  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0106  tRNA-Val  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000011333  normal  0.0580705 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0098  tRNA-Val  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000887403  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0085  tRNA-Val  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000375389  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0083  tRNA-Val  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000495241  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0084  tRNA-Val  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000842373  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0088  tRNA-Val  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000319875  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0089  tRNA-Val  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000342234  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0090  tRNA-Val  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000278646  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0091  tRNA-Val  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000288629  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0092  tRNA-Val  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000281148  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0093  tRNA-Val  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000278646  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0056  tRNA-Val  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000805133  normal  0.0381959 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0057  tRNA-Val  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000143405  normal  0.0390481 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0058  tRNA-Val  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000142133  normal  0.0392257 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0059  tRNA-Val  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000131386  normal  0.0398666 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0060  tRNA-Val  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000140872  normal  0.0392257 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0056  tRNA-Val  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000122931  normal  0.695646 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0057  tRNA-Val  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000113368  normal  0.686257 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0058  tRNA-Val  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000101774  normal  0.68295 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0059  tRNA-Val  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000125159  normal  0.68295 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0060  tRNA-Val  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000118562  normal  0.692299 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0098  tRNA-Val  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000927667  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0099  tRNA-Val  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000868138  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0100  tRNA-Val  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000000389381  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0101  tRNA-Val  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000000312411  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0102  tRNA-Val  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000000271468  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0081  tRNA-Val  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000114332  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0088  tRNA-Val  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000718158  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0082  tRNA-Val  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000470368  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0087  tRNA-Val  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000018587  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0080  tRNA-Val  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000267941  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0058  tRNA-Val  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000107196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0051  tRNA-Val  95 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0054  tRNA-Val  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000293035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0055  tRNA-Val  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000302516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0056  tRNA-Val  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000283847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0057  tRNA-Val  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000258205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t036  tRNA-Val  90.67 
 
 		 76 bp  93.7  5e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000159787  normal  0.229445 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t035  tRNA-Val  90.67 
 
 		 76 bp  93.7  5e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00018344  normal  0.230227 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t038  tRNA-Val  90.67 
 
 		 76 bp  93.7  5e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000157336  normal  0.23935 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t037  tRNA-Val  90.67 
 
 		 76 bp  93.7  5e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000163594  normal  0.236842 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t034  tRNA-Val  90.67 
 
 		 76 bp  93.7  5e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000171056  normal  0.228577 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t033  tRNA-Val  90.67 
 
 		 76 bp  93.7  5e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00112794  normal  0.228577 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0087  tRNA-Val  94.83 
 
 		 73 bp  91.7  2e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000197296  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0003  tRNA-Ala  94.83 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0027  tRNA-Val  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000361499  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0011  tRNA-Val  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000637042  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0054  tRNA-Val  94.83 
 
 		 73 bp  91.7  2e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000682201  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0039  tRNA-Val  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000287509  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0041  tRNA-Val  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000183486  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0016  tRNA-Ala  94.83 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00128049  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t0455  tRNA-Val  94.83 
 
 		 73 bp  91.7  2e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.13115 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1582  tRNA-Val  94.83 
 
 		 73 bp  91.7  2e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1617  tRNA-Val  94.83 
 
 		 73 bp  91.7  2e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.623903 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>