163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BbuZS7_0709 on replicon NC_011728
Organism: Borrelia burgdorferi ZS7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011728  BbuZS7_0709  tRNA-Val  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0002  tRNA-Ala  92.98 
 
 
76 bp  73.8  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0039  tRNA-Val  95.35 
 
 
77 bp  69.9  0.00000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.430844  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0072  tRNA-Val  97.37 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0577987  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0033  tRNA-Val  97.62 
 
 
73 bp  67.9  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000215711  hitchhiker  0.00721353 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0052  tRNA-Val  97.37 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.599035  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0078  tRNA-Val  97.37 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0031  tRNA-Val  97.37 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  5.03601e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0011  tRNA-Val  97.37 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000560887  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0046  tRNA-Val  97.37 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000498396  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0058  tRNA-Val  97.62 
 
 
73 bp  67.9  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.703111  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0001  tRNA-Ala  91.23 
 
 
73 bp  65.9  0.000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0032  tRNA-Ala  91.23 
 
 
73 bp  65.9  0.000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0018  tRNA-Ala  91.23 
 
 
73 bp  65.9  0.000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0308139  normal  0.84994 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0049  tRNA-Ala  91.23 
 
 
73 bp  65.9  0.000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_R0062  tRNA-Gly  92.45 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.669958  normal  0.100128 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0028  tRNA-Val  92.31 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0026  tRNA-Val  92.31 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0088  tRNA-Arg  88.14 
 
 
77 bp  61.9  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  6.56142e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0016  tRNA-Ala  89.83 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.262033  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0057  tRNA-Ala  89.83 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.185628  hitchhiker  0.000293533 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0062  tRNA-Ala  89.83 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0469123  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0067  tRNA-Ala  89.83 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000523585  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0072  tRNA-Ala  89.83 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.064194  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0051  tRNA-Val  94.74 
 
 
74 bp  60  0.00000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000148873  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0072  tRNA-Val  100 
 
 
76 bp  60  0.00000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0117931  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0089  tRNA-Val  100 
 
 
76 bp  60  0.00000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000177778  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0090  tRNA-Val  100 
 
 
76 bp  60  0.00000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000163432  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0038  tRNA-Ala  93.33 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60160  tRNA-Pro  100 
 
 
74 bp  58  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000641605  hitchhiker  0.0000000111412 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0041  tRNA-Ala  93.33 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.239536  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0042  tRNA-Pro  100 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.010895  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60070  tRNA-Pro  100 
 
 
74 bp  58  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.662949  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAValVIMSS1309272  tRNA-Val  100 
 
 
72 bp  58  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5179  tRNA-Pro  100 
 
 
79 bp  58  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.827734  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0085  tRNA-Pro  100 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000032412  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0027  tRNA-Val  100 
 
 
72 bp  56  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0045  tRNA-Val  100 
 
 
72 bp  56  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.106461  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0003  tRNA-Val  100 
 
 
72 bp  56  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0039  tRNA-Val  93.18 
 
 
76 bp  56  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0206433  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0040  tRNA-Val  100 
 
 
72 bp  56  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.142714 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAValVIMSS1309362  tRNA-Val  100 
 
 
72 bp  56  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAValVIMSS1309068  tRNA-Val  100 
 
 
72 bp  56  0.000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAValVIMSS1309119  tRNA-Val  100 
 
 
72 bp  56  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.255702  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAValVIMSS1309186  tRNA-Val  100 
 
 
72 bp  56  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.8123 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAValVIMSS1309144  tRNA-Val  100 
 
 
72 bp  56  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0213338  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0025  tRNA-Val  89.09 
 
 
76 bp  54  0.000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000570702  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0038  tRNA-Val  89.09 
 
 
76 bp  54  0.000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000120227  normal  0.246953 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0019  tRNA-Ala  93.02 
 
 
73 bp  54  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.399377  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0038  tRNA-Ala  93.02 
 
 
73 bp  54  0.000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0011  tRNA-Ala  93.02 
 
 
73 bp  54  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0026  tRNA-Val  89.09 
 
 
76 bp  54  0.000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000263702  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0040  tRNA-Val  89.09 
 
 
76 bp  54  0.000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000028212  normal  0.502069 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0020  tRNA-Ala  93.02 
 
 
73 bp  54  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0004  tRNA-Ala  93.02 
 
 
73 bp  54  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAAlaVIMSS1309372  tRNA-Ala  93.02 
 
 
73 bp  54  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.272937  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAAlaVIMSS1309089  tRNA-Ala  93.02 
 
 
73 bp  54  0.000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAAlaVIMSS1309140  tRNA-Ala  93.02 
 
 
73 bp  54  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAAlaVIMSS1309204  tRNA-Ala  93.02 
 
 
73 bp  54  0.000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.72887  normal  0.842293 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAAlaVIMSS1309163  tRNA-Ala  93.02 
 
 
73 bp  54  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0020  tRNA-Val  89.09 
 
 
76 bp  54  0.000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000221319  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0023  tRNA-Val  89.09 
 
 
76 bp  54  0.000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109055  hitchhiker  0.00000350688 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0026  tRNA-Val  89.09 
 
 
76 bp  54  0.000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00233079  normal  0.0590774 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0028  tRNA-Val  89.09 
 
 
76 bp  54  0.000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0840048 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Val-3  tRNA-Val  92.11 
 
 
76 bp  52  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.382302  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Ala-1  tRNA-Ala  92.11 
 
 
76 bp  52  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.116637  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Ala-3  tRNA-Ala  92.11 
 
 
76 bp  52  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0133528  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0045  tRNA-Val  92.11 
 
 
76 bp  52  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000307248  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0027  tRNA-Ala  92.86 
 
 
73 bp  52  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0167749  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0022  tRNA-Val  94.12 
 
 
74 bp  52  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.267849  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0008  tRNA-Ala  92.86 
 
 
73 bp  52  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0953331  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0032  tRNA-Ala  92.86 
 
 
73 bp  52  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.2035  normal  0.168105 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0037  tRNA-Ala  92.86 
 
 
73 bp  52  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.344221  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0051  tRNA-Ala  92.86 
 
 
73 bp  52  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0030  tRNA-Val  92.11 
 
 
76 bp  52  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000541175  normal  0.0247209 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0021  tRNA-Ala  92.86 
 
 
76 bp  52  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000106448  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0034  tRNA-Ala  92.86 
 
 
76 bp  52  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000564918  normal  0.218531 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0025  tRNA-Val  100 
 
 
72 bp  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0041  tRNA-Val  100 
 
 
72 bp  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.576244  normal  0.292589 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0007  tRNA-Pro  100 
 
 
77 bp  52  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00014183  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0022  tRNA-Val  100 
 
 
72 bp  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.520763  normal  0.905572 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0046  tRNA-Val  92.11 
 
 
76 bp  52  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.31806 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0027  tRNA-Val  83.78 
 
 
77 bp  52  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.20425  decreased coverage  0.00178196 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0004  tRNA-Ala  92.86 
 
 
76 bp  52  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.892843  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0041  tRNA-Ala  92.86 
 
 
76 bp  52  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.312045 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0032  tRNA-Val  92.11 
 
 
76 bp  52  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000105255  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAAlaVIMSS1309282  tRNA-Ala  92.86 
 
 
73 bp  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.127609 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAAlaVIMSS1309290  tRNA-Ala  92.86 
 
 
73 bp  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1239  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  52  0.00002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0037  tRNA-Ala  87.72 
 
 
76 bp  50.1  0.00008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0234109  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0058  tRNA-Ala  87.72 
 
 
76 bp  50.1  0.00008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0015  tRNA-Gly  88.68 
 
 
76 bp  50.1  0.00008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000000209319  hitchhiker  0.00483772 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0004  tRNA-Ala  87.72 
 
 
76 bp  50.1  0.00008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0038  tRNA-Val  96.55 
 
 
75 bp  50.1  0.00008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.978426  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0041  tRNA-Val  96.55 
 
 
75 bp  50.1  0.00008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345856  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0020  tRNA-Ala  92.5 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0053  tRNA-Val  90.91 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.460889  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0070  tRNA-Val  90.91 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.817758 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R82  tRNA-Pro  100 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000106099  normal  0.132387 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0030  tRNA-Ile  96.43 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>