More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_R0045 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010718  Nther_R0045  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0252567  normal  0.0396614 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0042  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000279186  hitchhiker  0.00179895 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0044  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000266715 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0040  tRNA-Val  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000943403  normal  0.0843805 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0004  tRNA-Val  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000770056 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2440  tRNA-Val  95.71 
 
 		 76 bp  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2943  tRNA-Val  95.71 
 
 		 76 bp  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.24885  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2946  tRNA-Val  95.71 
 
 		 76 bp  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.411322  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2949  tRNA-Val  95.71 
 
 		 76 bp  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.116038  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2150  tRNA-Val  95.71 
 
 		 76 bp  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2626  tRNA-Val  95.71 
 
 		 76 bp  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.888803  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2629  tRNA-Val  95.71 
 
 		 76 bp  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.8453  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2632  tRNA-Val  95.71 
 
 		 76 bp  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.602317  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0027  tRNA-Val  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000361499  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0011  tRNA-Val  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000637042  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0013  tRNA-Val  96.88 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0024  tRNA-Val  98.28 
 
 		 73 bp  107  4e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0168  tRNA-Val  98.28 
 
 		 73 bp  107  4e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t1830  tRNA-Val  98.28 
 
 		 73 bp  107  4e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.367633  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0011  tRNA-Val  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0014  tRNA-Val  96.67 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0051  tRNA-Val  96.67 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0053  tRNA-Val  93.42 
 
 		 75 bp  103  6e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000170226  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0011  tRNA-Val  92.86 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000197558  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0063  tRNA-Val  92.86 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000000708072  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0087  tRNA-Val  96.55 
 
 		 73 bp  99.6  9e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000197296  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0074  tRNA-Val  96.55 
 
 		 73 bp  99.6  9e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0054  tRNA-Val  96.55 
 
 		 73 bp  99.6  9e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000682201  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t0455  tRNA-Val  96.55 
 
 		 73 bp  99.6  9e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.13115 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1582  tRNA-Val  96.55 
 
 		 73 bp  99.6  9e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1617  tRNA-Val  96.55 
 
 		 73 bp  99.6  9e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.623903 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna025  tRNA-Val  92.75 
 
 		 76 bp  97.6  4e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0656621  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna058  tRNA-Val  92.75 
 
 		 76 bp  97.6  4e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.007323  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna033  tRNA-Val  92.75 
 
 		 76 bp  97.6  4e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.010484  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_rna012  tRNA-Val  92.75 
 
 		 76 bp  97.6  4e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000043327  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0035  tRNA-Val  92.75 
 
 		 76 bp  97.6  4e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000297756  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0042  tRNA-Val  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10340  tRNA-Val  92.11 
 
 		 75 bp  95.6  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0379292 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0001  tRNA-Val  96.43 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0039  tRNA-Val  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000287509  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0041  tRNA-Val  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000183486  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0005  tRNA-Val  96.43 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0051  tRNA-Val  96.43 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.163425  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0030  tRNA-Val  96.43 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000010319  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06828  tRNA-Val  96.36 
 
 		 73 bp  93.7  5e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0016  tRNA-Val  96.36 
 
 		 76 bp  93.7  5e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00469  tRNA-Val  96.36 
 
 		 73 bp  93.7  5e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00375  tRNA-Val  96.36 
 
 		 73 bp  93.7  5e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0037  tRNA-Val  96.36 
 
 		 76 bp  93.7  5e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000442416  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00250  tRNA-Val  96.36 
 
 		 73 bp  93.7  5e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0027  tRNA-Val  94.83 
 
 		 73 bp  91.7  2e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t1227  tRNA-Val  94.83 
 
 		 73 bp  91.7  2e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.411176  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2329  tRNA-Val  91.3 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2543  tRNA-Val  91.3 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00155589  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0035  tRNA-Val  94.64 
 
 		 73 bp  87.7  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0049  tRNA-Val  94.64 
 
 		 73 bp  87.7  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000361087  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0022  tRNA-Val  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510685  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0079  tRNA-Val  94.64 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.262586  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0018  tRNA-Val  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.209747  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0071  tRNA-Val  94.64 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0069  tRNA-Val  94.64 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000032502  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0062  tRNA-Val  94.55 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00027509  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0107  tRNA-Val  94.55 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000125343  normal  0.0580705 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0065  tRNA-Val  94.55 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000940035  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0064  tRNA-Val  94.55 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000300215  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0105  tRNA-Val  94.55 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000000937132  normal  0.0566469 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0104  tRNA-Val  94.55 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000459096  normal  0.0566469 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0060  tRNA-Val  94.55 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000229541  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0063  tRNA-Val  94.55 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000284788  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0069  tRNA-Val  94.55 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000229651  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0066  tRNA-Val  94.55 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000106688  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0097  tRNA-Val  94.55 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000319482  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0096  tRNA-Val  94.55 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000340582  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0095  tRNA-Val  94.55 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000338058  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0092  tRNA-Val  94.55 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000905029  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0091  tRNA-Val  94.55 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000288629  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0092  tRNA-Val  94.55 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000281148  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0093  tRNA-Val  94.55 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000278646  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0070  tRNA-Val  94.55 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000218766  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0106  tRNA-Val  94.55 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000011333  normal  0.0580705 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0098  tRNA-Val  94.55 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000927667  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0099  tRNA-Val  94.55 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000868138  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0100  tRNA-Val  94.55 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000000389381  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0101  tRNA-Val  94.55 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000000312411  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0102  tRNA-Val  94.55 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000000271468  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0103  tRNA-Val  94.55 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000000279802  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0088  tRNA-Val  94.55 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000718158  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0087  tRNA-Val  94.55 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000018587  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0036  tRNA-Val  94.55 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000113346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0038  tRNA-Val  94.55 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000124113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0037  tRNA-Val  94.55 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000120415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0035  tRNA-Val  94.55 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000119187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0034  tRNA-Val  94.55 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000134518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0080  tRNA-Val  94.55 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000267941  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0098  tRNA-Val  94.55 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000887403  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0039  tRNA-Val  94.55 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000106718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0089  tRNA-Val  94.55 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000619858  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0093  tRNA-Val  94.55 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000828011  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0082  tRNA-Val  94.55 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000470368  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0081  tRNA-Val  94.55 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000114332  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>