More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_R0005 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_R0001  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0005  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0016  tRNA-Val  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0037  tRNA-Val  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000442416  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2440  tRNA-Val  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2943  tRNA-Val  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.24885  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2946  tRNA-Val  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.411322  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2949  tRNA-Val  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.116038  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2150  tRNA-Val  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2626  tRNA-Val  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.888803  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2629  tRNA-Val  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.8453  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2632  tRNA-Val  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.602317  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00250  tRNA-Val  100 
 
 		 73 bp  109  9.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00469  tRNA-Val  100 
 
 		 73 bp  109  9.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna025  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  109  9.000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0656621  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_rna012  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  109  9.000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000043327  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna058  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  109  9.000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.007323  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00375  tRNA-Val  100 
 
 		 73 bp  109  9.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06828  tRNA-Val  100 
 
 		 73 bp  109  9.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna033  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  109  9.000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.010484  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0096  tRNA-Val  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000340582  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0086  tRNA-Val  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000172065  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0085  tRNA-Val  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000375389  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0095  tRNA-Val  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000338058  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0089  tRNA-Val  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000619858  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0098  tRNA-Val  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000887403  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0088  tRNA-Val  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000718158  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0081  tRNA-Val  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000114332  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0079  tRNA-Val  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000283513  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0082  tRNA-Val  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000470368  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0083  tRNA-Val  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000495241  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0080  tRNA-Val  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000267941  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0084  tRNA-Val  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000842373  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0104  tRNA-Val  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000459096  normal  0.0566469 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0087  tRNA-Val  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000018587  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0088  tRNA-Val  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000319875  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0089  tRNA-Val  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000342234  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0090  tRNA-Val  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000278646  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0091  tRNA-Val  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000288629  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0092  tRNA-Val  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000281148  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0093  tRNA-Val  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000278646  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0094  tRNA-Val  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000297438  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0097  tRNA-Val  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000319482  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0107  tRNA-Val  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000125343  normal  0.0580705 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0105  tRNA-Val  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000000937132  normal  0.0566469 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0106  tRNA-Val  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000011333  normal  0.0580705 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0098  tRNA-Val  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000927667  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0099  tRNA-Val  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000868138  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0100  tRNA-Val  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000000389381  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0101  tRNA-Val  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000000312411  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0102  tRNA-Val  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000000271468  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0093  tRNA-Val  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000828011  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t036  tRNA-Val  92 
 
 		 76 bp  101  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000159787  normal  0.229445 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t034  tRNA-Val  92 
 
 		 76 bp  101  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000171056  normal  0.228577 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2543  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  101  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00155589  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2329  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  101  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t033  tRNA-Val  92 
 
 		 76 bp  101  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00112794  normal  0.228577 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t037  tRNA-Val  92 
 
 		 76 bp  101  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000163594  normal  0.236842 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t038  tRNA-Val  92 
 
 		 76 bp  101  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000157336  normal  0.23935 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t035  tRNA-Val  92 
 
 		 76 bp  101  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00018344  normal  0.230227 
 
 
-
 
NC_004347  SO_t075  tRNA-Val  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t077  tRNA-Val  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0059  tRNA-Val  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000138631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0051  tRNA-Val  96.43 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0042  tRNA-Val  96.43 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000279186  hitchhiker  0.00179895 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0061  tRNA-Val  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000239094  normal  0.0392257 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0044  tRNA-Val  96.43 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000266715 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0045  tRNA-Val  96.43 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0252567  normal  0.0396614 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0061  tRNA-Val  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000062426  normal  0.68295 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0014  tRNA-Val  96.43 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0074  tRNA-Val  96.36 
 
 		 73 bp  93.7  5e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0087  tRNA-Val  96.36 
 
 		 73 bp  93.7  5e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000197296  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1117t  tRNA-Val  96.36 
 
 		 73 bp  93.7  5e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00968485  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3188t  tRNA-Val  96.36 
 
 		 73 bp  93.7  5e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0373931  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0054  tRNA-Val  96.36 
 
 		 73 bp  93.7  5e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000682201  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3082t  tRNA-Val  96.36 
 
 		 73 bp  93.7  5e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.0006696  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3089t  tRNA-Val  96.36 
 
 		 73 bp  93.7  5e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00274094  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0078  tRNA-Val  94.83 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000285873  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0035  tRNA-Val  94.83 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000119187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0063  tRNA-Val  94.83 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000284788  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0118  tRNA-Val  94.83 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00020053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0038  tRNA-Val  94.83 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000124113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0123  tRNA-Val  94.83 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000761032  normal  0.999094 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0119  tRNA-Val  94.83 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000206834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0036  tRNA-Val  94.83 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000113346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0034  tRNA-Val  94.83 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000134518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0037  tRNA-Val  94.83 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000120415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0026  tRNA-Val  94.83 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  0.000000000373011  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0026  tRNA-Val  94.83 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00167202  normal  0.213758 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0027  tRNA-Val  94.83 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000568482  normal  0.334713 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0032  tRNA-Val  94.83 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000487693  normal  0.350378 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0033  tRNA-Val  94.83 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000154108  normal  0.350378 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0034  tRNA-Val  94.83 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000784133  normal  0.347644 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0103  tRNA-Val  94.83 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000000279802  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0061  tRNA-Val  94.83 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00024378  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0121  tRNA-Val  94.83 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000223353  normal  0.991143 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0120  tRNA-Val  94.83 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000221581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0122  tRNA-Val  94.83 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000703597  normal  0.991143 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0064  tRNA-Val  94.83 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000300215  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0065  tRNA-Val  94.83 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000940035  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>