More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_R0051 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_R0051  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.163425  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0030  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000010319  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0035  tRNA-Val  98.68 
 
 		 76 bp  143  7e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000297756  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0071  tRNA-Val  97.22 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0069  tRNA-Val  97.22 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000032502  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0079  tRNA-Val  97.22 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.262586  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0035  tRNA-Val  98.39 
 
 		 73 bp  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0049  tRNA-Val  98.39 
 
 		 73 bp  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000361087  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0006  tRNA-Val  96.77 
 
 		 73 bp  107  4e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0011  tRNA-Val  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000197558  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0063  tRNA-Val  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000000708072  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0087  tRNA-Val  96.49 
 
 		 73 bp  97.6  4e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000197296  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0074  tRNA-Val  96.49 
 
 		 73 bp  97.6  4e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0054  tRNA-Val  96.49 
 
 		 73 bp  97.6  4e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000682201  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t0455  tRNA-Val  96.49 
 
 		 73 bp  97.6  4e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.13115 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1582  tRNA-Val  96.49 
 
 		 73 bp  97.6  4e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1617  tRNA-Val  96.49 
 
 		 73 bp  97.6  4e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.623903 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0051  tRNA-Val  96.43 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0045  tRNA-Val  96.43 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0252567  normal  0.0396614 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0044  tRNA-Val  96.43 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000266715 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0014  tRNA-Val  96.43 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0013  tRNA-Val  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0042  tRNA-Val  96.43 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000279186  hitchhiker  0.00179895 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t1227  tRNA-Val  95 
 
 		 73 bp  95.6  1e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.411176  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0024  tRNA-Val  95 
 
 		 73 bp  95.6  1e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0168  tRNA-Val  95 
 
 		 73 bp  95.6  1e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t1830  tRNA-Val  95 
 
 		 73 bp  95.6  1e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.367633  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0027  tRNA-Val  94.74 
 
 		 73 bp  89.7  9e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0011  tRNA-Val  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2440  tRNA-Val  94.64 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2943  tRNA-Val  94.64 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.24885  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2946  tRNA-Val  94.64 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.411322  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2949  tRNA-Val  94.64 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.116038  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2150  tRNA-Val  94.64 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2626  tRNA-Val  94.64 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.888803  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2629  tRNA-Val  94.64 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.8453  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2632  tRNA-Val  94.64 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.602317  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0004  tRNA-Val  94.64 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000770056 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0016  tRNA-Val  93.22 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0037  tRNA-Val  93.22 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000442416  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna033  tRNA-Val  91.94 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.010484  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00250  tRNA-Val  91.94 
 
 		 73 bp  83.8  0.000000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00375  tRNA-Val  91.94 
 
 		 73 bp  83.8  0.000000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna058  tRNA-Val  91.94 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.007323  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna025  tRNA-Val  91.94 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0656621  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_rna012  tRNA-Val  91.94 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000043327  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00469  tRNA-Val  91.94 
 
 		 73 bp  83.8  0.000000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06828  tRNA-Val  91.94 
 
 		 73 bp  83.8  0.000000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Val-1  tRNA-Val  94.23 
 
 		 73 bp  79.8  0.00000000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Val-2  tRNA-Val  94.23 
 
 		 73 bp  79.8  0.00000000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00946418  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Val-3  tRNA-Val  94.23 
 
 		 73 bp  79.8  0.00000000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Val-4  tRNA-Val  94.23 
 
 		 73 bp  79.8  0.00000000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Val-5  tRNA-Val  94.23 
 
 		 73 bp  79.8  0.00000000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0040  tRNA-Val  92.86 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000943403  normal  0.0843805 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0055  tRNA-Val  95.83 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0368844  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0035  tRNA-Val  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0701  tRNA-Val  91.67 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0038  tRNA-Val  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0349926  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0556  tRNA-Val  94.23 
 
 		 73 bp  79.8  0.00000000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2175  tRNA-Val  94.23 
 
 		 73 bp  79.8  0.00000000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.527459  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2568  tRNA-Val  94.23 
 
 		 73 bp  79.8  0.00000000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0023  tRNA-Val  94.23 
 
 		 73 bp  79.8  0.00000000000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0226385  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0172  tRNA-Val  94.23 
 
 		 73 bp  79.8  0.00000000000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0088  tRNA-Val  91.53 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000718158  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0096  tRNA-Val  91.53 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000340582  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0001  tRNA-Val  92.73 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0094  tRNA-Val  91.53 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000297438  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0086  tRNA-Val  91.53 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000172065  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0093  tRNA-Val  91.53 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000828011  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t036  tRNA-Val  91.53 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000159787  normal  0.229445 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t033  tRNA-Val  91.53 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00112794  normal  0.228577 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0097  tRNA-Val  91.53 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000319482  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0082  tRNA-Val  91.53 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000470368  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0095  tRNA-Val  91.53 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000338058  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0106  tRNA-Val  91.53 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000011333  normal  0.0580705 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t034  tRNA-Val  91.53 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000171056  normal  0.228577 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0089  tRNA-Val  91.53 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000619858  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0107  tRNA-Val  91.53 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000125343  normal  0.0580705 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t038  tRNA-Val  91.53 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000157336  normal  0.23935 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t035  tRNA-Val  91.53 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00018344  normal  0.230227 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0088  tRNA-Val  91.53 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000319875  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0089  tRNA-Val  91.53 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000342234  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0090  tRNA-Val  91.53 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000278646  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0091  tRNA-Val  91.53 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000288629  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0092  tRNA-Val  91.53 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000281148  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0093  tRNA-Val  91.53 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000278646  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0098  tRNA-Val  91.53 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000927667  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0099  tRNA-Val  91.53 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000868138  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0100  tRNA-Val  91.53 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000000389381  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0101  tRNA-Val  91.53 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000000312411  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0102  tRNA-Val  91.53 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000000271468  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0098  tRNA-Val  91.53 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000887403  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0105  tRNA-Val  91.53 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000000937132  normal  0.0566469 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0081  tRNA-Val  91.53 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000114332  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0080  tRNA-Val  91.53 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000267941  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0079  tRNA-Val  91.53 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000283513  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0085  tRNA-Val  91.53 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000375389  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0087  tRNA-Val  91.53 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000018587  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0084  tRNA-Val  91.53 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000842373  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0083  tRNA-Val  91.53 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000495241  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>