133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_R0005 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_R0005  tRNA-Val  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.642292 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0035  tRNA-Val  87.67 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0205002  normal  0.0343396 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0039  tRNA-Val  86.49 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.430844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0038  tRNA-Val  91.84 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.290735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0040  tRNA-Val  91.84 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000348872 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0040  tRNA-Val  91.11 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0013  tRNA-Val  84.93 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0033  tRNA-Val  92.5 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000215711  hitchhiker  0.00721353 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0062  tRNA-Thr  90.38 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0058  tRNA-Val  92.5 
 
 		 73 bp  56  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.703111  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0031  tRNA-Arg  90.2 
 
 		 77 bp  54  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.464558  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0015  tRNA-Gly  90.7 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000000209319  hitchhiker  0.00483772 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0039  tRNA-Val  92.31 
 
 		 75 bp  54  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0072  tRNA-Val  88 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0041  tRNA-Val  88 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0037  tRNA-Val  100 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0066  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.894934  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0017  tRNA-Ile  85.14 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000664856  normal  0.0132434 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0051  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.472837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0015  tRNA-Val  88 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0048  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.253759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0042  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.965777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0043  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.408373 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0036  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.457558 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0114  tRNA-Val  88 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000145742  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0064  tRNA-Val  88 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0147303  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0048  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_R0098  tRNA-Phe  86.21 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.772561 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0047  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0018  tRNA-Val  88 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00275689  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0035  tRNA-Val  88 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna033  tRNA-Val  83.56 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.010484  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0325  tRNA-Val  100 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.241533  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0043  tRNA-Val  85.25 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00024501  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0056  tRNA-Thr  88.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.752628 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0013  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.276155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00250  tRNA-Val  83.56 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00375  tRNA-Val  83.56 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00469  tRNA-Val  83.56 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06828  tRNA-Val  83.56 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna025  tRNA-Val  83.56 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0656621  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_rna012  tRNA-Val  83.56 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000043327  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0058  tRNA-Thr  88.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.340534  normal  0.330008 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna058  tRNA-Val  83.56 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.007323  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0050  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.721622 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0062  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0052  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0020  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00000915512  hitchhiker  0.000000256884 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0054  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.18853  normal  0.800854 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0915  tRNA-Val  100 
 
 		 78 bp  50.1  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.118093  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0036  tRNA-Val  91.67 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.552883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0026  tRNA-Val  91.67 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  0.000000000373011  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0012  tRNA-Thr  88.46 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0003  tRNA-Thr  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.210155  normal  0.203261 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0033  tRNA-Thr  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2329  tRNA-Val  90 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2543  tRNA-Val  90 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00155589  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14009  tRNA-Thr  88.46 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0025  tRNA-Val  91.67 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0239971 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0088  tRNA-Thr  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.241374 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0049  tRNA-Val  90.91 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.890961 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0017  tRNA-Thr  86.54 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1179  tRNA-Asp  100 
 
 		 79 bp  48.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.015483  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0003  tRNA-Thr  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0008  tRNA-Thr  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0022  tRNA-Val  94.29 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.267849  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0031  tRNA-Arg  90.7 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0002  tRNA-Lys  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0037  tRNA-Val  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00204676  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0039  tRNA-Val  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00777868  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14040  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0020  tRNA-Thr  100 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0183484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_R0056  tRNA-Phe  85.71 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.0000288017  normal  0.0354601 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0052  tRNA-Arg  88.24 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.165142  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Val-1  tRNA-Val  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0259741  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0044    96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0056  tRNA-Asp  86.21 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0046  tRNA-Lys  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0052  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000639553  hitchhiker  0.00795761 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0047  tRNA-Lys  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.487247 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0035  tRNA-Lys  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0379309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0036  tRNA-Lys  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0360191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0037  tRNA-Lys  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00809358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0039  tRNA-Lys  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0153762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0062  tRNA-Val  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000000673345  normal  0.0836086 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14002  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0077  tRNA-Val  91.18 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000578274  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4223  tRNA-Val  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000199522  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4225  tRNA-Val  96.15 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000236439  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0057  tRNA-Lys  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000000607595  normal  0.906339 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0058  tRNA-Lys  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000000626368  normal  0.708619 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0059  tRNA-Lys  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000000522849  normal  0.720074 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0060  tRNA-Lys  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000123741  normal  0.545219 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0061  tRNA-Lys  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000126169  normal  0.545219 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0062  tRNA-Lys  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000112705  normal  0.545219 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0064  tRNA-Lys  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000484105  normal  0.405062 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0051  tRNA-Lys  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000000619589  hitchhiker  0.0000190999 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0023  tRNA-Ala  84.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.756244  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0060  tRNA-Lys  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0060  tRNA-Lys  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.845098  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>