More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_R0051 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_R0051  tRNA-Val  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000148873  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0039  tRNA-Val  97.96 
 
 		 77 bp  89.7  8e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.430844  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Val-3  tRNA-Val  87.84 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00184226  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1248  tRNA-Val  87.84 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.134542  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0040  tRNA-Val  90.54 
 
 		 72 bp  75.8  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.142714 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0046  tRNA-Val  87.84 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.461452  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0053  tRNA-Val  87.84 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0039  tRNA-Val  95.92 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0206433  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Val-1  tRNA-Val  88.57 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_163  tRNA-Val  87.84 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0003  tRNA-Val  92.59 
 
 		 78 bp  67.9  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.401069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0033  tRNA-Val  94 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000215711  hitchhiker  0.00721353 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0002  tRNA-Val  92.59 
 
 		 78 bp  67.9  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.264825  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0058  tRNA-Val  94 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.703111  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0042  tRNA-Val  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000405377  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tVal01  tRNA-Val  92.59 
 
 		 81 bp  67.9  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.231904  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0004  tRNA-Val  87.84 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0053  tRNA-Ala  90.57 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t13664  tRNA-Ala  90.57 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.235996  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07699  tRNA-Ala  90.57 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.515536  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0035  tRNA-Val  88.52 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0047  tRNA-Ala  90.57 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.591987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0013  tRNA-Ala  90.57 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0447386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0069  tRNA-Ala  90.57 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.181592  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0059  tRNA-Ala  90.57 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.455983  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0053  tRNA-Ala  90.57 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0047  tRNA-Ala  90.57 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0003  tRNA-Ala  90.57 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0017  tRNA-Ala  90.57 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0010  tRNA-Val  100 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  88.14 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.428746  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Ile-2  tRNA-Ile  88.14 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0066  tRNA-Ile  88.14 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0066  tRNA-Ile  88.14 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0018  tRNA-Ile  88.14 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.891633  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0072  tRNA-Val  89.83 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0117931  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0089  tRNA-Val  89.83 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000177778  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0090  tRNA-Val  89.83 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000163432  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0007  tRNA-Ile  87.93 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000177312  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0003  tRNA-Ala  94.74 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0022  tRNA-Val  93.33 
 
 		 72 bp  60  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.520763  normal  0.905572 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0709  tRNA-Val  94.74 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0016  tRNA-Ala  94.74 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.168843  normal  0.312064 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0062  tRNA-Ile  87.93 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0003  tRNA-Val  94 
 
 		 72 bp  60  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0003  tRNA-Ala  90.57 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5641  tRNA-Ile  90.57 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5655  tRNA-Ala  90.57 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000213498  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5696  tRNA-Ala  90.57 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000731558  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5724  tRNA-Ala  90.57 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000745652  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0131  tRNA-Ala  90.57 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000907835  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0103  tRNA-Ala  90.57 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00163997  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0033  tRNA-Ala  90.57 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.362537  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ala-1  tRNA-Ala  90.57 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000729752  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ala-2  tRNA-Ala  90.57 
 
 		 79 bp  58  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ala-3  tRNA-Ala  90.57 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000677485  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ala-4  tRNA-Ala  90.57 
 
 		 79 bp  58  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.511469  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ala-5  tRNA-Ala  90.57 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000396068  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ala-1  tRNA-Ala  90.57 
 
 		 79 bp  58  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ala-2  tRNA-Ala  90.57 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000114514  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ala-3  tRNA-Ala  90.57 
 
 		 79 bp  58  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ala-4  tRNA-Ala  90.57 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.265738  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ala-5  tRNA-Ala  90.57 
 
 		 79 bp  58  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ala-3  tRNA-Ala  90.57 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00200718  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ala-4  tRNA-Ala  90.57 
 
 		 79 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ala-5  tRNA-Ala  90.57 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000442244  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0041  tRNA-Ala  90.57 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.66128  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5641  tRNA-Ala  90.57 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.105844  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5618  tRNA-Ala  90.57 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0269583  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0009  tRNA-Ala  90.57 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0348385  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5811  tRNA-Ala  90.57 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00210274  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0196  tRNA-Ala  90.57 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000704358  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0008  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0953331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0032  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.2035  normal  0.168105 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0037  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.344221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0051  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0029  tRNA-Ala  90.57 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0787  tRNA-Ala  90.57 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3879199999999999e-31 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0175  tRNA-Ala  90.57 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0809338 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0008  tRNA-Ala  90.57 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5311  tRNA-Ala  90.57 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.124894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4995  tRNA-Ala  90.57 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ala-1  tRNA-Ala  90.57 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00147071  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ala-2  tRNA-Ala  90.57 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.132549  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ala-3  tRNA-Ala  90.57 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000936426  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ala-4  tRNA-Ala  90.57 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000418225  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ala-5  tRNA-Ala  90.57 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000357086  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0019  tRNA-Ala  90.57 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0010  tRNA-Ala  90.57 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0026  tRNA-Ala  90.57 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0248198  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0106  tRNA-Ala  90.57 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000506231  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5287  tRNA-Ala  90.57 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.231328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5026  tRNA-Ala  90.57 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000587824  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5658  tRNA-Ala  90.57 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000863381  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5625  tRNA-Ala  90.57 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0342896  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0862  tRNA-Ala  90.57 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000933142  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5734  tRNA-Ala  90.57 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000108147  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0220  tRNA-Ala  90.57 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000245454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAAlaVIMSS1309282  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.127609 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAAlaVIMSS1309290  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>