122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_R0022 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_R0022  tRNA-Val  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.520763  normal  0.905572 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0041  tRNA-Val  96.72 
 
 		 72 bp  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.576244  normal  0.292589 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0025  tRNA-Val  96.72 
 
 		 72 bp  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0040  tRNA-Val  93.06 
 
 		 72 bp  103  5e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.142714 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0027  tRNA-Val  97.78 
 
 		 72 bp  81.8  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0045  tRNA-Val  97.78 
 
 		 72 bp  81.8  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.106461  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAValVIMSS1309068  tRNA-Val  97.78 
 
 		 72 bp  81.8  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAValVIMSS1309119  tRNA-Val  97.78 
 
 		 72 bp  81.8  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.255702  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAValVIMSS1309186  tRNA-Val  97.78 
 
 		 72 bp  81.8  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.8123 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAValVIMSS1309272  tRNA-Val  97.78 
 
 		 72 bp  81.8  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAValVIMSS1309144  tRNA-Val  97.78 
 
 		 72 bp  81.8  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0213338  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAValVIMSS1309362  tRNA-Val  97.78 
 
 		 72 bp  81.8  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0003  tRNA-Val  97.78 
 
 		 72 bp  81.8  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0033  tRNA-Val  95.65 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000215711  hitchhiker  0.00721353 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0069  tRNA-Val  95.24 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000156801  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0058  tRNA-Val  95.65 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.703111  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0045  tRNA-Val  89.47 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00029215  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0026  tRNA-Val  94.87 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.218598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0051  tRNA-Val  93.33 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000148873  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0078  tRNA-Val  93.48 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0072  tRNA-Val  93.48 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0117931  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0089  tRNA-Val  93.48 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000177778  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0090  tRNA-Val  93.48 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000163432  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0072  tRNA-Val  93.48 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0577987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0052  tRNA-Val  93.48 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.599035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0011  tRNA-Val  93.48 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000560887  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0031  tRNA-Val  93.48 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  5.03601e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0046  tRNA-Val  93.48 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000498396  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0017  tRNA-Val  86.89 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00877292  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0038  tRNA-Val  84.72 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0049  tRNA-Val  84.72 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.890961 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0041  tRNA-Val  94.44 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345856  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0038  tRNA-Val  94.44 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.978426  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0039  tRNA-Val  93.18 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0206433  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0013  tRNA-Val  93.02 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0039  tRNA-Val  85.14 
 
 		 77 bp  54  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.430844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0015  tRNA-Val  90.7 
 
 		 72 bp  54  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0605809  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0044  tRNA-Val  92.11 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0054  tRNA-Val  92.11 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.282022  normal  0.126583 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0053  tRNA-Val  90.48 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000170226  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0044  tRNA-Val  90.48 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0046  tRNA-Val  100 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000514041  unclonable  8.86692e-20 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0031  tRNA-Ala  87.04 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0044  tRNA-Ala  87.04 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0709  tRNA-Val  100 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0027  tRNA-Val  88.89 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000361499  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0011  tRNA-Val  88.89 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000637042  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0018  tRNA-Val  89.8 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.209747  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0022  tRNA-Val  89.8 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510685  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2843  hypothetical protein  100 
 
 		 399 bp  50.1  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0331098  normal  0.0204354 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0054  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.041835  normal  0.0189876 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Val-4  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.464554  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0051  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000353155  normal  0.0160187 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0021  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0016  tRNA-Pro  96.43 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0128175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2783  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0812706  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4309  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0069  tRNA-Val  100 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00232154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0045  tRNA-Pro  96.43 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0039  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.867547  hitchhiker  0.000112761 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1831  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0030  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70827  normal  0.0703177 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0048  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.546388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0001  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.709613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_R0089  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347614  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0061  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0059  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565602  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0001  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0056  tRNA-Pro  96.43 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000452415  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0004  tRNA-Val  92.5 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000000388109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2266  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.248753  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0054  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.452754 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3052  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.728072  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0001  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.613575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2650  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2705  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1539  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.051003  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0035  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.491254  normal  0.639036 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6005  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.859444 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0025  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.149964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0061  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.700263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0027  tRNA-Val  93.75 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0041  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0018  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0061  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.17954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0027  tRNA-Val  93.75 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0041  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0784234  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna32  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna47  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.625367  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0042  tRNA-Val  87.5 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000279186  hitchhiker  0.00179895 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0044  tRNA-Val  87.5 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000266715 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0045  tRNA-Val  87.5 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0252567  normal  0.0396614 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0003  tRNA-Val  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0033  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.675019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0039  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.449991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0040  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.451217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0024  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.508678  normal  0.235406 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0038  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.827791  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1555  tRNA-Val  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0048  tRNA-Val  92.5 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>