50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_R0046 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010644  Emin_R0046  tRNA-Val  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000514041  unclonable  8.86692e-20 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0022  tRNA-Val  100 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.520763  normal  0.905572 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0035  tRNA-Val  96.55 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.81932  normal  0.306729 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0025  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.962727  normal  0.312894 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0029  tRNA-Val  89.74 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07570  tRNA-Val  84.75 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.10137  normal  0.977811 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0051  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000159293 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0048  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.816962 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0010  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0036  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.465493  normal  0.444935 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0013  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.105797  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0030  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0039  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0062  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0069  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00149713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0003  tRNA-Val  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0022  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0121384  normal  0.0431401 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0052  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0052  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000423304 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0003  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0223244  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0026  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0040  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0057  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.762222  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0071  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0084  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0029  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000365135 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0039  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0045  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0051  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0332583 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0028  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00000000334964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_R0090  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.419074  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0053  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00198096  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0054  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00220789  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0058  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.263555  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0031  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0043  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1195  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1236  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0058  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.547375 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0042  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0018  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.317768 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0024  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230769 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0056  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.603033 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0060  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.189075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_R0079  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0016  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0046  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.342079 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0064  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0523811 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0075  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.323397 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0010  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>