59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CBUD_1195 on replicon NC_009727
Organism: Coxiella burnetii Dugway 5J108-111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009727  CBUD_1195  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1236  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt16  tRNA-Arg  91.3 
 
 
77 bp  89.7  9e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt16  tRNA-Arg  91.3 
 
 
77 bp  89.7  9e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01275  tRNA-Arg  92.98 
 
 
74 bp  81.8  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna130  tRNA-Arg  92.98 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0043  tRNA-Arg  91.53 
 
 
77 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0038  tRNA-Arg  84.93 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0080  tRNA-Arg  87.72 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.833302  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0030  tRNA-Arg  89.8 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.474637  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0030  tRNA-Arg  87.27 
 
 
77 bp  54  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000202832  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0003  tRNA-Arg  85.25 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_R0053  tRNA-Arg  87.76 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.667012 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0032  tRNA-Arg  83.12 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.513939  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0044  tRNA-Arg  87.76 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.310656 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6049  tRNA-Arg  87.76 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0051  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000159293 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0069  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00149713  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0058  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.547375 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0052  tRNA-Met  100 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000423304 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0062  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0039  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0030  tRNA-Met  100 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0013  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.105797  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0016  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0003  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0223244  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0026  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0040  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0057  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.762222  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0071  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0084  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0029  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000365135 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0052  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0036  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.465493  normal  0.444935 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0010  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0051  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0332583 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0028  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00000000334964  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_R0090  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.419074  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0053  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00198096  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0054  tRNA-Met  100 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00220789  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0058  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.263555  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0031  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0043  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0039  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0042  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0018  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.317768 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0024  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00230769 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0056  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.603033 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0060  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.189075  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_R0079  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0046  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.342079 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0064  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0523811 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0075  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.323397 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0048  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.816962 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0023  tRNA-Arg  87.23 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.350487  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_R0104  tRNA-Arg  86.96 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.147929 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0046  tRNA-Val  100 
 
 
72 bp  44.1  0.005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000514041  unclonable  8.86692e-20 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0045  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0025  tRNA-Val  100 
 
 
75 bp  44.1  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.962727  normal  0.312894 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>