24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_R0038 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_R0038  tRNA-Val  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0041  tRNA-Val  87.69 
 
 		 72 bp  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.576244  normal  0.292589 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0025  tRNA-Val  87.69 
 
 		 72 bp  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0040  tRNA-Val  87.69 
 
 		 72 bp  65.9  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.142714 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0049  tRNA-Val  86.11 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.890961 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAValVIMSS1309272  tRNA-Val  87.3 
 
 		 72 bp  61.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0045  tRNA-Val  87.93 
 
 		 72 bp  60  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.106461  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAValVIMSS1309362  tRNA-Val  87.93 
 
 		 72 bp  60  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAValVIMSS1309144  tRNA-Val  87.93 
 
 		 72 bp  60  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0213338  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAValVIMSS1309186  tRNA-Val  87.93 
 
 		 72 bp  60  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.8123 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAValVIMSS1309119  tRNA-Val  87.93 
 
 		 72 bp  60  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.255702  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAValVIMSS1309068  tRNA-Val  87.93 
 
 		 72 bp  60  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0027  tRNA-Val  87.93 
 
 		 72 bp  60  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0022  tRNA-Val  84.72 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.520763  normal  0.905572 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0060  tRNA-Val  92.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.206205  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0061  tRNA-Val  92.5 
 
 		 78 bp  56  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.304237  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0062  tRNA-Val  92.5 
 
 		 78 bp  56  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.296107  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0008  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0410887  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tVal01  tRNA-Val  89.74 
 
 		 81 bp  46.1  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.231904  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0015  tRNA-Val  84.13 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0605809  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0002  tRNA-Val  89.74 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.264825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0003  tRNA-Val  89.74 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.401069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0016  tRNA-Arg  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000516971  normal  0.0942255 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0020  tRNA-Arg  89.47 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0247478  normal  0.430055 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>