More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_R0090 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_R0072  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0117931  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0089  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000177778  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0090  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000163432  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0046  tRNA-Val  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000498396  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0078  tRNA-Val  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0031  tRNA-Val  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  5.03601e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0052  tRNA-Val  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.599035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0011  tRNA-Val  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000560887  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0072  tRNA-Val  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0577987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R25  tRNA-Val  95.83 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00112378  normal  0.0215792 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R27  tRNA-Val  95.83 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000323391  normal  0.0212721 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R36  tRNA-Val  95.83 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5034  tRNA-Val  95.31 
 
 		 78 bp  103  6e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000220203  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0212  tRNA-Val  95.31 
 
 		 78 bp  103  6e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000868799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5633  tRNA-Val  95.31 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.115457  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5819  tRNA-Val  95.31 
 
 		 78 bp  103  6e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000675228  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Val-3  tRNA-Val  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.382302  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0018  tRNA-Val  95.31 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.010388  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5650  tRNA-Val  95.31 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000315313  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0097  tRNA-Val  95.31 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000152963  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5659  tRNA-Val  95.31 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000220141  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5674  tRNA-Val  95.31 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000774972  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5687  tRNA-Val  95.31 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000478099  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0778  tRNA-Val  95.31 
 
 		 78 bp  103  6e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34684e-29 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5732  tRNA-Val  95.31 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000412764  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0272  tRNA-Val  95.31 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4774  tRNA-Val  95.31 
 
 		 78 bp  103  6e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000014475  hitchhiker  6.83474e-16 
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Val-2  tRNA-Val  95.31 
 
 		 79 bp  103  6e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000213554  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Val-3  tRNA-Val  95.31 
 
 		 79 bp  103  6e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000108525  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Val-4  tRNA-Val  95.31 
 
 		 79 bp  103  6e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000645962  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Val-5  tRNA-Val  95.31 
 
 		 79 bp  103  6e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000098013  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Val-6  tRNA-Val  95.31 
 
 		 79 bp  103  6e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000153225  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0170  tRNA-Val  95.31 
 
 		 78 bp  103  6e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0237549 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0143  tRNA-Val  95.31 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000199332  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0080  tRNA-Val  95.31 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000518886  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0045  tRNA-Val  95.31 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000150428  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0603  tRNA-Val  95.31 
 
 		 78 bp  103  6e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000989267  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Val-1  tRNA-Val  95.31 
 
 		 79 bp  103  6e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0417532  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Val-3  tRNA-Val  95.31 
 
 		 79 bp  103  6e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000052933  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Val-4  tRNA-Val  95.31 
 
 		 79 bp  103  6e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00757095  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Val-5  tRNA-Val  95.31 
 
 		 79 bp  103  6e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Val-6  tRNA-Val  95.31 
 
 		 79 bp  103  6e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000716932  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Val-7  tRNA-Val  95.31 
 
 		 79 bp  103  6e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000452768  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5725  tRNA-Val  95.31 
 
 		 78 bp  103  6e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000777644  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Val-1  tRNA-Val  95.31 
 
 		 79 bp  103  6e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000230232  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Val-2  tRNA-Val  95.31 
 
 		 79 bp  103  6e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000226351  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Val-3  tRNA-Val  95.31 
 
 		 79 bp  103  6e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000779763  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Val-5  tRNA-Val  95.31 
 
 		 79 bp  103  6e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000106447  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Val-6  tRNA-Val  95.31 
 
 		 79 bp  103  6e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000394218  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0030  tRNA-Val  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000541175  normal  0.0247209 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5050  tRNA-Val  95.31 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000188833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5653  tRNA-Val  95.31 
 
 		 78 bp  103  6e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000741856  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5666  tRNA-Val  95.31 
 
 		 78 bp  103  6e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000870426  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5709  tRNA-Val  95.31 
 
 		 78 bp  103  6e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000949158  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Val-1  tRNA-Val  95.31 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000155621  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Val-2  tRNA-Val  95.31 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000053562  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Val-3  tRNA-Val  95.31 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196603  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Val-4  tRNA-Val  95.31 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000015578  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Val-6  tRNA-Val  95.31 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000778849  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5145  tRNA-Val  95.31 
 
 		 78 bp  103  6e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000184879  normal  0.692523 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4578  tRNA-Val  95.31 
 
 		 78 bp  103  6e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000592849  normal  0.0827232 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0527  tRNA-Val  95.31 
 
 		 78 bp  103  6e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3227999999999999e-28 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0095  tRNA-Val  95.31 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00165095  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0191  tRNA-Val  95.31 
 
 		 78 bp  103  6e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000034986  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0294  tRNA-Val  95.31 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000261183  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5003  tRNA-Val  95.31 
 
 		 78 bp  103  6e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0036  tRNA-Val  95.31 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.286435  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0853  tRNA-Val  95.31 
 
 		 78 bp  103  6e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000111044  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0018  tRNA-Val  95.31 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0022012  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0036  tRNA-Val  95.31 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000418472  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0045  tRNA-Val  95.31 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000240957  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0093  tRNA-Val  95.31 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000186576  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0139  tRNA-Val  95.31 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000555984  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0016  tRNA-Val  91.78 
 
 		 73 bp  97.6  4e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00018  tRNA-Val  91.67 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000172255  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00043  tRNA-Val  91.67 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000135072  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0032  tRNA-Val  91.67 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000121865  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0034  tRNA-Val  91.67 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000138641  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0059  tRNA-Val  91.67 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  6.36722e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2837  tRNA-Val  91.67 
 
 		 78 bp  95.6  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  1.88964e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0584  tRNA-Val  91.67 
 
 		 78 bp  95.6  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  7.67929e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2555  tRNA-Val  91.67 
 
 		 78 bp  95.6  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000000393303  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t48  tRNA-Val  91.67 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t50  tRNA-Val  91.67 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.220633  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0665  tRNA-Val  91.67 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000217876  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2651  tRNA-Val  91.67 
 
 		 78 bp  95.6  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000000523066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2554  tRNA-Val  91.67 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000000138872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0072  tRNA-Val  91.67 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000000560906  normal  0.267671 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2650  tRNA-Val  91.67 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000000507401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2556  tRNA-Val  91.67 
 
 		 78 bp  95.6  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000000389314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0769  tRNA-Val  91.67 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000076951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0767  tRNA-Val  91.67 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000000989037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA26  tRNA-Val  91.67 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.241705  normal  0.163758 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA28  tRNA-Val  91.67 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000265839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0037  tRNA-Val  91.67 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000000578787  hitchhiker  0.00129397 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0911  tRNA-Val  91.67 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000875601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2039  tRNA-Val  91.67 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0070  tRNA-Val  91.67 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000000583072  normal  0.270802 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0039  tRNA-Val  91.67 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000000567069  hitchhiker  0.00359795 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0077  tRNA-Val  93.75 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000578274  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>