More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCAH187_A0103 on replicon NC_011658
Organism: Bacillus cereus AH187



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011658  BCAH187_A0033  tRNA-Ala  100 
 
 
78 bp  155  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.362537  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0009  tRNA-Ala  100 
 
 
78 bp  155  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0348385  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0103  tRNA-Ala  100 
 
 
78 bp  155  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00163997  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5625  tRNA-Ala  100 
 
 
78 bp  155  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0342896  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5618  tRNA-Ala  100 
 
 
78 bp  155  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0269583  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5287  tRNA-Ala  100 
 
 
78 bp  155  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.231328  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0008  tRNA-Ala  100 
 
 
78 bp  155  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5311  tRNA-Ala  100 
 
 
78 bp  155  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.124894  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0029  tRNA-Ala  100 
 
 
78 bp  155  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5641  tRNA-Ala  100 
 
 
78 bp  153  7e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.105844  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ala-2  tRNA-Ala  100 
 
 
79 bp  153  7e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ala-4  tRNA-Ala  100 
 
 
79 bp  153  7e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.511469  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ala-1  tRNA-Ala  100 
 
 
79 bp  153  7e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ala-3  tRNA-Ala  100 
 
 
79 bp  153  7e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ala-5  tRNA-Ala  100 
 
 
79 bp  153  7e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ala-1  tRNA-Ala  100 
 
 
79 bp  153  7e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.520164  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ala-4  tRNA-Ala  100 
 
 
79 bp  153  7e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5641  tRNA-Ile  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5644  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0026  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0540884  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0003  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0003  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ala-1  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00147071  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ala-2  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.132549  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0026  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0248198  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0010  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0010  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5734  tRNA-Ala  100 
 
 
78 bp  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000108147  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5026  tRNA-Ala  100 
 
 
78 bp  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000587824  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0862  tRNA-Ala  100 
 
 
78 bp  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000933142  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4995  tRNA-Ala  100 
 
 
78 bp  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0787  tRNA-Ala  100 
 
 
78 bp  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3879199999999999e-31 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4569  tRNA-Ala  100 
 
 
78 bp  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000675831  normal  0.111562 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0220  tRNA-Ala  100 
 
 
78 bp  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000245454  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5811  tRNA-Ala  100 
 
 
78 bp  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00210274  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ala-3  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000677485  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ala-5  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000396068  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ala-4  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.265738  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ala-6  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000288872  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ala-2  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000494003  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ala-3  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00200718  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5658  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  145  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000863381  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5655  tRNA-Ala  100 
 
 
73 bp  145  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000213498  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5696  tRNA-Ala  100 
 
 
73 bp  145  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000731558  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5724  tRNA-Ala  100 
 
 
73 bp  145  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000745652  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0135  tRNA-Ala  100 
 
 
73 bp  145  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00338984  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0041  tRNA-Ala  100 
 
 
73 bp  145  2e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000928737  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0175  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  145  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0809338 
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ala-1  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  145  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000729752  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ala-2  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  145  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000114514  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ala-5  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  145  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000442244  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5140  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  145  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00011996  normal  0.803313 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0106  tRNA-Ala  100 
 
 
73 bp  145  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000506231  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ala-3  tRNA-Ala  100 
 
 
73 bp  145  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000936426  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ala-4  tRNA-Ala  100 
 
 
73 bp  145  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000418225  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ala-5  tRNA-Ala  100 
 
 
73 bp  145  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000357086  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0041  tRNA-Ala  100 
 
 
73 bp  145  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.66128  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0131  tRNA-Ala  100 
 
 
73 bp  145  2e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000907835  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0196  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  145  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000704358  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0102  tRNA-Ala  100 
 
 
73 bp  145  2e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00179656  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0169  tRNA-Ala  98.63 
 
 
73 bp  137  4e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2608  tRNA-Ala  98.63 
 
 
73 bp  137  4e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2571  tRNA-Ala  98.63 
 
 
73 bp  137  4e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ala-1  tRNA-Ala  98.63 
 
 
73 bp  137  4e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ala-2  tRNA-Ala  98.63 
 
 
73 bp  137  4e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ala-3  tRNA-Ala  98.63 
 
 
73 bp  137  4e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ala-4  tRNA-Ala  98.63 
 
 
73 bp  137  4e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ala-5  tRNA-Ala  98.63 
 
 
73 bp  137  4e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ala-6  tRNA-Ala  98.63 
 
 
73 bp  137  4e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ala-7  tRNA-Ala  98.63 
 
 
73 bp  137  4e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2493  tRNA-Ala  98.63 
 
 
73 bp  137  4e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2450  tRNA-Ala  98.63 
 
 
73 bp  137  4e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2178  tRNA-Ala  98.63 
 
 
73 bp  137  4e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0553  tRNA-Ala  98.63 
 
 
73 bp  137  4e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0410  tRNA-Ala  98.63 
 
 
73 bp  137  4e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0182  tRNA-Ala  98.63 
 
 
73 bp  137  4e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t1783  tRNA-Ala  98.63 
 
 
73 bp  137  4e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0020  tRNA-Ala  98.63 
 
 
73 bp  137  4e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0080  tRNA-Ala  98.63 
 
 
73 bp  137  4e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0006  tRNA-Ala  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000138481  normal  0.649612 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0008  tRNA-Ala  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000983847  hitchhiker  0.000163043 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t62  tRNA-Ala  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.132362  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA15  tRNA-Ala  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.140136  normal  0.0102335 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0062  tRNA-Ala  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000746222  normal  0.783318 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA50  tRNA-Ala  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000979507  normal  0.305106 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA6  tRNA-Ala  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0168581  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA72  tRNA-Ala  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000170851  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA81  tRNA-Ala  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00142149  normal  0.0185896 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R14  tRNA-Ala  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000817824  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0023  tRNA-Ala  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000263771  hitchhiker  0.000576138 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0060  tRNA-Ala  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000273656  normal  0.689003 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0054  tRNA-Ala  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00629084  normal  0.3868 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0033  tRNA-Ala  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000292455  normal  0.447414 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0003  tRNA-Ala  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00193312  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0013  tRNA-Ala  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000457589  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0057  tRNA-Ala  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0288839  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0077  tRNA-Ala  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000402465  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0085  tRNA-Ala  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00934773  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0097  tRNA-Ala  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000376718  normal  0.165584 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0078  tRNA-Ala  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000280494  normal  0.145068 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>