40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_163 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_163  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0004  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Val-1  tRNA-Val  98.61 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1248  tRNA-Val  89.61 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.134542  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Val-3  tRNA-Val  89.61 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00184226  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0046  tRNA-Val  89.61 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.461452  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0035  tRNA-Val  90.14 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0051  tRNA-Val  87.84 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000148873  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0056  tRNA-Val  92.59 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.389375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0035  tRNA-Val  87.1 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000568068  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0040  tRNA-Val  86.3 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.142714 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0001  tRNA-Val  87.27 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000681114  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  tRNA-Val-2  tRNA-Val  87.27 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.599636  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0021  tRNA-Val  94.87 
 
 		 72 bp  54  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.357184  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0021  tRNA-Val  94.87 
 
 		 72 bp  54  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0029  tRNA-Val  94.87 
 
 		 72 bp  54  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0014  tRNA-Ala  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0213488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00375  tRNA-Val  85.71 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_rna012  tRNA-Val  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000043327  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna058  tRNA-Val  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.007323  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna033  tRNA-Val  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.010484  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna025  tRNA-Val  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0656621  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60490  tRNA-Val  96.43 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0021  tRNA-Val  84.21 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0039  tRNA-Val  87.5 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0206433  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2329  tRNA-Val  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2543  tRNA-Val  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00155589  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0036  tRNA-Val  92.5 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.432227 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06828  tRNA-Val  85.71 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00469  tRNA-Val  85.71 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00250  tRNA-Val  85.71 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0030  tRNA-Ala  86.27 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAAlaVIMSS1309124  tRNA-Ala  85.45 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.127335  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0024  tRNA-Ala  88.1 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0197077  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0018  tRNA-Ala  88.1 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000012168  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0050  tRNA-Ala  88.1 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00215399  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0034  tRNA-Ala  88.1 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.36427 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0029  tRNA-Val  89.13 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000000771916  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0016  tRNA-Val  86 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0037  tRNA-Val  86 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000442416  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>