299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_R0016 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_R0016  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.168843  normal  0.312064 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0003  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0020  tRNA-Ala  96.05 
 
 
76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0040  tRNA-Ala  96.05 
 
 
76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000841644  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Ala-2  tRNA-Ala  93.42 
 
 
76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Ala-3  tRNA-Ala  93.42 
 
 
76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.238742  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0009  tRNA-Ala  93.42 
 
 
76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.292395  normal  0.689631 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0080  tRNA-Ala  93.42 
 
 
76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0050  tRNA-Ala  93.42 
 
 
76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.903687  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0055  tRNA-Ala  93.42 
 
 
76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.186103  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0013  tRNA-Ala  93.42 
 
 
76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0032  tRNA-Ala  92.11 
 
 
76 bp  103  6e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0119257  normal  0.670174 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0052  tRNA-Ala  92.11 
 
 
76 bp  103  6e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0013  tRNA-Ala  92.11 
 
 
76 bp  103  6e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0119522  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0044  tRNA-Ala  92.11 
 
 
76 bp  103  6e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.541664  hitchhiker  0.000000158432 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0021  tRNA-Ala  92.11 
 
 
76 bp  103  6e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000106448  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0034  tRNA-Ala  92.11 
 
 
76 bp  103  6e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000564918  normal  0.218531 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0014  tRNA-Ala  92.11 
 
 
76 bp  103  6e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0213488  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0015  tRNA-Ala  92.11 
 
 
76 bp  103  6e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0358184  normal  0.634668 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0049  tRNA-Ala  92.11 
 
 
76 bp  103  6e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000677236  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAAlaVIMSS1309290  tRNA-Ala  91.78 
 
 
73 bp  97.6  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0019  tRNA-Ala  91.78 
 
 
73 bp  97.6  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.399377  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0004  tRNA-Ala  91.78 
 
 
73 bp  97.6  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAAlaVIMSS1309372  tRNA-Ala  91.78 
 
 
73 bp  97.6  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.272937  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0020  tRNA-Ala  91.78 
 
 
73 bp  97.6  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAAlaVIMSS1309163  tRNA-Ala  91.78 
 
 
73 bp  97.6  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0038  tRNA-Ala  91.78 
 
 
73 bp  97.6  4e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0008  tRNA-Ala  91.78 
 
 
73 bp  97.6  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0953331  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0032  tRNA-Ala  91.78 
 
 
73 bp  97.6  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.2035  normal  0.168105 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0037  tRNA-Ala  91.78 
 
 
73 bp  97.6  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.344221  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0051  tRNA-Ala  91.78 
 
 
73 bp  97.6  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0011  tRNA-Ala  91.78 
 
 
73 bp  97.6  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAAlaVIMSS1309282  tRNA-Ala  91.78 
 
 
73 bp  97.6  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.127609 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAAlaVIMSS1309204  tRNA-Ala  91.78 
 
 
73 bp  97.6  4e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.72887  normal  0.842293 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAAlaVIMSS1309140  tRNA-Ala  91.78 
 
 
73 bp  97.6  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAAlaVIMSS1309089  tRNA-Ala  91.78 
 
 
73 bp  97.6  4e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0058  tRNA-Ala  90.79 
 
 
76 bp  95.6  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0008  tRNA-Ala  90.79 
 
 
76 bp  95.6  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000809396  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0033  tRNA-Ala  92.11 
 
 
75 bp  95.6  1e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0072  tRNA-Ala  90.79 
 
 
76 bp  95.6  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000540506  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0023  tRNA-Ala  90.79 
 
 
76 bp  95.6  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00683735  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0034  tRNA-Ala  90.79 
 
 
76 bp  95.6  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0822071  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0052  tRNA-Ala  90.79 
 
 
76 bp  95.6  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00134949  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0062  tRNA-Ala  90.79 
 
 
76 bp  95.6  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.128618  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0063  tRNA-Ala  90.79 
 
 
76 bp  95.6  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.808449  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0028  tRNA-Ala  91.43 
 
 
76 bp  91.7  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.139647  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0028  tRNA-Ala  91.43 
 
 
76 bp  91.7  2e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.408156  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0047  tRNA-Ala  91.3 
 
 
76 bp  89.7  9e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000145993  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0103  tRNA-Ala  91.3 
 
 
76 bp  89.7  9e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000241452  normal  0.0209132 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0004  tRNA-Ala  91.3 
 
 
76 bp  89.7  9e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000571046  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0627  tRNA-Ala  91.3 
 
 
78 bp  89.7  9e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000351596  normal  0.0173581 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0084  tRNA-Ala  91.3 
 
 
76 bp  89.7  9e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0403496  normal  0.138563 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0060  tRNA-Ala  91.3 
 
 
76 bp  89.7  9e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000375554  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0128  tRNA-Ala  91.3 
 
 
78 bp  89.7  9e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000050642  normal  0.0403899 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0017  tRNA-Ala  91.3 
 
 
76 bp  89.7  9e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00161415  hitchhiker  0.00407434 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0469  tRNA-Ala  91.3 
 
 
78 bp  89.7  9e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000319828  normal  0.0257822 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4292  tRNA-Ala  91.3 
 
 
78 bp  89.7  9e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000724507  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4205  tRNA-Ala  91.3 
 
 
78 bp  89.7  9e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000556554  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4264  tRNA-Ala  91.3 
 
 
78 bp  89.7  9e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000257856  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0046  tRNA-Ala  90.41 
 
 
73 bp  89.7  9e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0034  tRNA-Ala  90.41 
 
 
73 bp  89.7  9e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tAla01  tRNA-Ala  91.3 
 
 
79 bp  89.7  9e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tAla02  tRNA-Ala  91.3 
 
 
79 bp  89.7  9e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0040  tRNA-Ala  89.47 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.130821  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0020  tRNA-Ala  89.47 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0058  tRNA-Ala  89.47 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.819419 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0004  tRNA-Ala  89.47 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0013  tRNA-Ala  89.47 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6552  tRNA-Ala  89.47 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0058  tRNA-Ala  89.47 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.168421  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0049  tRNA-Ala  89.47 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0056  tRNA-Ala  89.47 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0056  tRNA-Ala  89.47 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.216594  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0071  tRNA-Ala  89.47 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0080  tRNA-Ala  89.47 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0038  tRNA-Ala  89.47 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0030  tRNA-Ala  89.47 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0020  tRNA-Ala  89.47 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.18478  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0035  tRNA-Ala  89.47 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.304574  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0046  tRNA-Ala  89.47 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0032  tRNA-Ala  89.47 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0037  tRNA-Ala  89.47 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0234109  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0047  tRNA-Ala  89.47 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6555  tRNA-Ala  89.47 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0003  tRNA-Ala  89.47 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0022  tRNA-Ala  89.47 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0054  tRNA-Ala  89.47 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0077  tRNA-Ala  89.47 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0022  tRNA-Ala  89.47 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000459218  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0061  tRNA-Ala  89.47 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0017  tRNA-Ala  89.47 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0394632  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0030  tRNA-Ala  89.47 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.915184  normal  0.110132 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0072  tRNA-Ala  89.47 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.821542  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0039  tRNA-Ala  89.47 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0737446 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0010  tRNA-Ala  89.47 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.560104  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0034  tRNA-Ala  89.47 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000978021  normal  0.113899 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0056  tRNA-Ala  89.47 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4580  tRNA-Ala  89.47 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4552  tRNA-Ala  89.47 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.566095  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0048  tRNA-Ala  89.47 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.498854 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>