274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_R0037 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_R0037  tRNA-Val  100 
 
 		 78 bp  155  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0051  tRNA-Val  93.33 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.959203 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0001  tRNA-Ile  91.38 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0010  tRNA-Val  87.18 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.239466  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t039  tRNA-Val  88.24 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t040  tRNA-Val  88.24 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0063  tRNA-Val  88.24 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00384271  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0064  tRNA-Val  88.24 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00446845  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t069  tRNA-Val  88.24 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00122297  hitchhiker  0.00465561 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0043  tRNA-Val  88.24 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00131984  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0042  tRNA-Val  88.24 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00634518  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0062  tRNA-Val  88.24 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.373541  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0061  tRNA-Val  88.24 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.144549  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0062  tRNA-Val  88.24 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.202264  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2208  tRNA-Val  89.71 
 
 		 78 bp  63.9  0.000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2130  tRNA-Val  89.71 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0089  tRNA-Val  88.24 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000402356  normal  0.221127 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0090  tRNA-Val  88.24 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000384332  normal  0.221127 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0100  tRNA-Val  88.24 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00395733  normal  0.242808 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0101  tRNA-Val  88.24 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.003873  normal  0.249554 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0073  tRNA-Val  88.24 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.618922  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0074  tRNA-Val  88.24 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.593802  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0073  tRNA-Val  88.24 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00216703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0085  tRNA-Val  88.24 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0569302  hitchhiker  0.00000332622 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0086  tRNA-Val  88.24 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.236197  normal  0.0136376 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0087  tRNA-Val  88.24 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.235286  normal  0.0134883 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0074  tRNA-Val  88.24 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00199895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0061  tRNA-Val  88.24 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.366342  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0066  tRNA-Val  88.24 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.603715  normal  0.0472692 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0067  tRNA-Val  88.24 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.325907  normal  0.0460929 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t068  tRNA-Val  88.24 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0011202  hitchhiker  0.00473676 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4230  tRNA-Val  87.88 
 
 		 79 bp  60  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000689927  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0032  tRNA-Val  85.9 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00000020219  hitchhiker  8.04575e-18 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0057  tRNA-Val  89.66 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.385214  hitchhiker  0.00196821 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0075  tRNA-Val  87.88 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00433017  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2580  tRNA-Val  87.88 
 
 		 79 bp  60  0.00000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0938444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0001  tRNA-Ile  89.66 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4229  tRNA-Val  87.88 
 
 		 79 bp  60  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000067821  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0076  tRNA-Val  87.88 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00448767  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0023  tRNA-Val  86.3 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.885733 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2581  tRNA-Val  87.3 
 
 		 79 bp  54  0.000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0567199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t06  tRNA-Val  93.02 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0022  tRNA-Val  93.02 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0746641  normal  0.301569 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0050  tRNA-Val  93.02 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0021  tRNA-Val  90.7 
 
 		 72 bp  54  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0037  tRNA-Val  93.02 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1519  tRNA-Val  87.1 
 
 		 79 bp  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000581354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0022  tRNA-Val  84.62 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.766553  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0066  tRNA-Val  86.36 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00442679  hitchhiker  0.000900174 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Val-2  tRNA-Val  84.62 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS05795  tRNA-OTHER  84.62 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0054  tRNA-Val  84.62 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0025  tRNA-Val  84.62 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0029  tRNA-Val  84.62 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.804432  normal  0.0419406 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t34  tRNA-Val  84.62 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0987104  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t35  tRNA-Val  84.62 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0521138  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_R0076  tRNA-Val  84.62 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.369233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0045  tRNA-Val  84.62 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.431879  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0081  tRNA-Val  86.36 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0183039  normal  0.0880297 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0079  tRNA-Val  86.36 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0663805  normal  0.0847945 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0109  tRNA-Val  86.36 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0124836  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0043  tRNA-Val  84.62 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.13273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0041  tRNA-Val  84.62 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.0000251829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0068  tRNA-Val  86.36 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0104216  hitchhiker  0.000843897 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0001  tRNA-Ile  87.93 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.826373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0047  tRNA-Val  84.62 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.877588  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA41  tRNA-Val  84.62 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.179382 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA42  tRNA-Val  84.62 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.191671  normal  0.176048 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0010  tRNA-Val  84.62 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.116783  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0021  tRNA-Val  84.62 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0026  tRNA-Val  84.62 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.211344  normal  0.0167997 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0017  tRNA-Val  84.62 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00286264  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R39  tRNA-Val  84.62 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0141809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0111  tRNA-Val  86.36 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0150231  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0035  tRNA-Val  87.93 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0045  tRNA-Val  84.62 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00877282  normal  0.995576 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0042  tRNA-Val  84.62 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00372557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0084  tRNA-Val  86.36 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0193203  normal  0.0545316 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0060  tRNA-Val  86.36 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00132937  hitchhiker  0.000239512 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0010  tRNA-Val  84.62 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00245461  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0029  tRNA-Val  84.62 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0528689 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0032  tRNA-Val  84.62 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.100652  normal  0.0918353 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0050  tRNA-Val  84.62 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0857362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0033  tRNA-Val  84.62 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.449979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0015  tRNA-Val  84.62 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000941457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_R0080  tRNA-Val  84.62 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0217837  normal  0.25513 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0045  tRNA-Val  84.62 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0026  tRNA-Val  84.62 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.478102  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0020  tRNA-Val  84.62 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.649475  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1533  tRNA-Val  87.1 
 
 		 79 bp  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.102488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1556  tRNA-Val  87.1 
 
 		 79 bp  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0029  tRNA-Val  84.62 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0041  tRNA-Val  84.62 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.352531  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0001  tRNA-Ile  87.93 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1751  tRNA-Val  87.1 
 
 		 79 bp  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000295955  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0033  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.523176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1920  tRNA-Val  87.1 
 
 		 79 bp  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0104306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0016  tRNA-Val  84.62 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0039  tRNA-Val  84.62 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0358134  normal  0.456153 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0042  tRNA-Val  84.62 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.921175  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>