70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_R0037 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_R0037  tRNA-Val  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0260915  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0017  tRNA-Val  91.53 
 
 		 72 bp  61.9  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.598097  normal  0.464383 
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Val-2  tRNA-Val  84.21 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000334583  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0050  tRNA-Val  84.21 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0053  tRNA-Val  84.21 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0873696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0053  tRNA-Val  84.21 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_966  tRNA-Val  84.21 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00216309  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t06  tRNA-Val  84.21 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0022  tRNA-Val  84.21 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0746641  normal  0.301569 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0036  tRNA-Val  86.44 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.432227 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0037  tRNA-Val  83.78 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  86.21 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0697106  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Ile-2  tRNA-Ile  86.21 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0142737  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0001  tRNA-Ile  86.21 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0022  tRNA-Val  96.55 
 
 		 74 bp  50.1  0.00008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.267849  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0016  tRNA-Val  84.21 
 
 		 75 bp  50.1  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.372982  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60310  tRNA-Met  96.55 
 
 		 74 bp  50.1  0.00008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0013  tRNA-Met  96.55 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0245889  normal  0.232589 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0036  tRNA-Val  87.76 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61830  tRNA-Met  96.55 
 
 		 74 bp  50.1  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000100063  hitchhiker  0.00456196 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0018  tRNA-Val  85.25 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5361  tRNA-Met  96.55 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.338891  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0001  tRNA-Val  85.96 
 
 		 74 bp  50.1  0.00008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0022  tRNA-Val  84.21 
 
 		 75 bp  50.1  0.00008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.448408  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0023  tRNA-Val  82.89 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.169175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0024  tRNA-Val  82.89 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.469275  hitchhiker  0.0000034793 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0057  tRNA-Ile  86.54 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0001  tRNA-Met  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0001  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0010  tRNA-Val  96.43 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0020  tRNA-Ile  96.43 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0038  tRNA-Ile  96.43 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt17  tRNA-Met  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0037  tRNA-Asp  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0700091  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0008  tRNA-Met  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0051  tRNA-Val  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.959203 
 
 
-
 
NC_006369  lplt17  tRNA-Met  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0051  tRNA-Ile  96.43 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Met-2  tRNA-Met  100 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Met-3  tRNA-Met  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.617808  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0010  tRNA-Val  83.1 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.239466  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0001  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.783183  hitchhiker  0.00194035 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0001  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.334662  normal  0.586783 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0029  tRNA-Val  89.74 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.76241 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0034  tRNA-Val  89.74 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0146998  normal  0.0280728 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0056  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.239639  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0051  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1353  tRNA-Ile  84.48 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00031485 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0001  tRNA-Ile  84.48 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.996709  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0001  tRNA-Ile  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0046  tRNA-Val  89.47 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0191389  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0025  tRNA-Pro  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0001  tRNA-Ile  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0441602 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0001  tRNA-Ile  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.226648  normal  0.0173253 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0001  tRNA-Ile  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.429514  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0001  tRNA-Ile  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.484512  normal  0.062918 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0001  tRNA-Ile  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531061 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0052  tRNA-Met  86 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.106885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0004  tRNA-Ile  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0654807  normal  0.562233 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0006  tRNA-Thr  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000132587  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14001  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0040  tRNA-Ile  84.48 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.22275  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0001  tRNA-Ile  84.48 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00699866 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0011  tRNA-Ile  84.48 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0062166  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0005  tRNA-Ile  84.48 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000168156  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0011  tRNA-Ile  84.48 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000846583  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0005  tRNA-Ile  84.48 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000000353567  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0034  tRNA-Asp  85.19 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.848663  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0005  tRNA-Asp  85.19 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0001  tRNA-Pro  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>