293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lppt17 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006368  lppt17  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt17  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0006  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna1  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0077  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.171478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0044  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0002  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0044  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0034  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.903011  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0035  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2045  tRNA-Met  89.33 
 
 		 79 bp  85.7  0.000000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0074  tRNA-Met  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0001  tRNA-Ile  92.98 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.560835  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0018  tRNA-Met  92.86 
 
 		 74 bp  79.8  0.00000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.144719  normal  0.0381447 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0050  tRNA-Met  94.12 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00180994 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0056  tRNA-Met  87.01 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.864924 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0106  tRNA-Met  87.01 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000245591  normal  0.103844 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0100  tRNA-Met  87.01 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000240677  normal  0.14602 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0096  tRNA-Met  87.01 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000771704  normal  0.141608 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0008  tRNA-Met  89.83 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0001  tRNA-Met  89.83 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t13660  tRNA-Met  93.33 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0986692  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0026  tRNA-Ile  88.33 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.556154 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0153  tRNA-Met  88.14 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000229594  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0120  tRNA-Met  88.14 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000849976  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0116  tRNA-Met  88.14 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000126363  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t014  tRNA-Met  88.14 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t018  tRNA-Met  88.14 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0105  tRNA-Met  88.14 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000402123  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0129  tRNA-Met  88.14 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000830942  hitchhiker  0.000497336 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0125  tRNA-Met  88.14 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000214753  hitchhiker  0.00047099 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0030  tRNA-Met  88.14 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000378723  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0156  tRNA-Met  88.14 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000253856  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0159  tRNA-Met  88.14 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000201379  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0032  tRNA-Met  88.14 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000017089  normal  0.142093 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0036  tRNA-Met  88.14 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000524362  normal  0.145466 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0033  tRNA-Met  88.14 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000181749  normal  0.113479 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0037  tRNA-Met  88.14 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000667787  normal  0.114256 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0038  tRNA-Met  88.14 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000161182  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t013  tRNA-Met  88.14 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000114065  hitchhiker  0.000000000483497 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t108  tRNA-Met  88.14 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000118343  hitchhiker  0.00000000052642 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0031  tRNA-Met  88.14 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000000967357  normal  0.0254093 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0035  tRNA-Met  88.14 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000026454  normal  0.0264572 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0102  tRNA-Met  87.3 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000510016  normal  0.102262 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0101  tRNA-Met  88.14 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000000109758  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0052  tRNA-Met  88.14 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.106885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0108  tRNA-Met  88.14 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000000925479  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0112  tRNA-Met  88.14 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000385548  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4259  tRNA-Met  89.8 
 
 		 79 bp  58  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.0089e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4255  tRNA-Met  89.8 
 
 		 79 bp  58  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.1357e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0062  tRNA-Met  89.8 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000650555  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0006  tRNA-Met  91.11 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.412994  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0018    87.72 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0050  tRNA-Met  87.72 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0015  tRNA-Met  87.72 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.329575  decreased coverage  0.00000481165 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0061  tRNA-Met  89.8 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0156851  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0037  tRNA-Met  84.42 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.45674  normal  0.44338 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0065  tRNA-Met  87.72 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0018  tRNA-Met  87.72 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0091  tRNA-Met  89.8 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.62007  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0065  tRNA-Met  89.8 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0370622  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0332  tRNA-Met  89.8 
 
 		 79 bp  58  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000136063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0032  tRNA-Met  89.8 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000831848  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0028  tRNA-Met  89.8 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000000167131  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0329  tRNA-Met  89.8 
 
 		 79 bp  58  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000153412  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0066  tRNA-Met  89.8 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00279413  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0031  tRNA-Met  89.8 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.240758  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0035  tRNA-Met  89.8 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000293929  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0031  tRNA-Met  84.42 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000893845  normal  0.390946 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0052  tRNA-Met  88.68 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.526652  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0031  tRNA-Met  89.8 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000375201  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0027  tRNA-Met  89.8 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.155792  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAMetVIMSS1309206  tRNA-Met  91.11 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.218177  hitchhiker  0.000283446 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA14  tRNA-Met  87.72 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.839312 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0025  tRNA-Ile  86.67 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0513291  unclonable  0.00000384252 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0010  tRNA-Ile  86.67 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000891119  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0098  tRNA-Ile  86.67 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.331727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0036  tRNA-Ile  86.67 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0271306  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0081  tRNA-Ile  86.67 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000962065  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t003  tRNA-Ile  86.67 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0051  tRNA-Ile  86.67 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00698245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0175  tRNA-Ile  86.67 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0770081  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0093  tRNA-Ile  86.67 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.879368  normal  0.134634 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0008  tRNA-Ile  86.67 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0314854  hitchhiker  0.00756038 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0005  tRNA-Ile  84.72 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000000353567  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0020  tRNA-Ile  86.67 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0504823  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0007  tRNA-Ile  86.67 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000911687  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0067  tRNA-Ile  86.67 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000189357  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0008  tRNA-Ile  86.67 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000331872  normal  0.303515 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0072  tRNA-Ile  86.67 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0376486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0008  tRNA-Ile  86.67 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.160787  hitchhiker  0.00984378 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0021  tRNA-Ile  86.67 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000203116  normal  0.0522769 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0072  tRNA-Ile  86.67 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00892637  normal  0.130437 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0005  tRNA-Ile  86.67 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000734395  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0160  tRNA-Ile  86.67 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0152441  normal  0.0451567 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0009  tRNA-Ile  86.67 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0154814  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0072  tRNA-Ile  86.67 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0761618  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0137  tRNA-Ile  86.67 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000306582  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0002  tRNA-Ile  86.67 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0365419  normal  0.118397 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0084  tRNA-Ile  86.67 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0017286  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>