281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_R0044 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010577  XfasM23_R0044  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0044  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna1  tRNA-Met  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0077  tRNA-Met  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.171478  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lppt17  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt17  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0035  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0006  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0096  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000771704  normal  0.141608 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0002  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0100  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000240677  normal  0.14602 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0106  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000245591  normal  0.103844 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2045  tRNA-Met  90.67 
 
 		 79 bp  93.7  6e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0074  tRNA-Met  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0034  tRNA-Met  89.61 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.903011  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0056  tRNA-Met  89.61 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.864924 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t108  tRNA-Met  93.22 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000118343  hitchhiker  0.00000000052642 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0116  tRNA-Met  93.22 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000126363  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t014  tRNA-Met  93.22 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t018  tRNA-Met  93.22 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0112  tRNA-Met  93.22 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000385548  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t013  tRNA-Met  93.22 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000114065  hitchhiker  0.000000000483497 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0105  tRNA-Met  93.22 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000402123  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0101  tRNA-Met  93.22 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000000109758  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0030  tRNA-Met  93.22 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000378723  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0153  tRNA-Met  93.22 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000229594  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0032  tRNA-Met  93.22 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000017089  normal  0.142093 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0036  tRNA-Met  93.22 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000524362  normal  0.145466 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0033  tRNA-Met  93.22 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000181749  normal  0.113479 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0037  tRNA-Met  93.22 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000667787  normal  0.114256 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0038  tRNA-Met  93.22 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000161182  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0159  tRNA-Met  93.22 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000201379  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0108  tRNA-Met  93.22 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000000925479  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0031  tRNA-Met  93.22 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000000967357  normal  0.0254093 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0035  tRNA-Met  93.22 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000026454  normal  0.0264572 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0156  tRNA-Met  93.22 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000253856  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0120  tRNA-Met  93.22 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000849976  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0102  tRNA-Met  92.06 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000510016  normal  0.102262 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0125  tRNA-Met  93.22 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000214753  hitchhiker  0.00047099 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0129  tRNA-Met  93.22 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000830942  hitchhiker  0.000497336 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0062  tRNA-Met  95.92 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000650555  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0031  tRNA-Met  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000893845  normal  0.390946 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0027  tRNA-Met  95.92 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.155792  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0065  tRNA-Met  95.92 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0370622  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0061  tRNA-Met  95.92 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0156851  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0037  tRNA-Met  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.45674  normal  0.44338 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0329  tRNA-Met  95.92 
 
 		 79 bp  81.8  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000153412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0332  tRNA-Met  95.92 
 
 		 79 bp  81.8  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000136063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0028  tRNA-Met  95.92 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000000167131  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0032  tRNA-Met  95.92 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000831848  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4255  tRNA-Met  95.92 
 
 		 79 bp  81.8  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.1357e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4259  tRNA-Met  95.92 
 
 		 79 bp  81.8  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.0089e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0035  tRNA-Met  95.92 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000293929  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0031  tRNA-Met  95.92 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.240758  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0031  tRNA-Met  95.92 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000375201  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0066  tRNA-Met  95.92 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00279413  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0052  tRNA-Met  94.34 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.526652  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0026  tRNA-Met  92.86 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000000983992  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0034  tRNA-Met  92.86 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000193112  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0134  tRNA-Met  91.53 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000000283847  normal  0.273117 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0131  tRNA-Met  91.53 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000542069  normal  0.386091 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0128  tRNA-Met  91.07 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000459259  normal  0.192833 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0018  tRNA-Met  91.07 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.144719  normal  0.0381447 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0125  tRNA-Met  91.07 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000032683  normal  0.193684 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0050  tRNA-Met  92.16 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00180994 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0018    89.47 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0071  tRNA-Met  85.71 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000012956  normal  0.0431401 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0073  tRNA-Met  85.71 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000819508  normal  0.0429545 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0050  tRNA-Met  89.47 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01240  tRNA-Met  91.84 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0015  tRNA-Met  89.47 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.329575  decreased coverage  0.00000481165 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0023  tRNA-Met  87.69 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0065  tRNA-Met  89.47 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna143  tRNA-Met  91.84 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000903927  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0018  tRNA-Met  89.47 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0091  tRNA-Met  91.84 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.62007  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna147  tRNA-Met  91.84 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000833162  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tMet03  tRNA-Met  85.71 
 
 		 80 bp  65.9  0.000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00892587  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0048  tRNA-Met  91.84 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000017739  normal  0.0157813 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01238  tRNA-Met  91.84 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna132  tRNA-Met  91.84 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000790983  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01243  tRNA-Met  91.84 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna135  tRNA-Met  91.84 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000774984  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA14  tRNA-Met  89.47 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.839312 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0044  tRNA-Met  91.84 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000282394  normal  0.033686 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0052  tRNA-Met  91.84 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.058148 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_R0061  tRNA-Met  85.92 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.714727 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_4303  tRNA-Met  85.92 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0008  tRNA-Met  88.14 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_R0047  tRNA-Met  85.92 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.501158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0001  tRNA-Met  88.14 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0006  tRNA-Met  92.86 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0111825  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3154t  tRNA-Met  92.86 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00000967763  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0069  tRNA-Met  92.86 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.439816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0074  tRNA-Met  92.86 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.135637  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00014  tRNA-Met  89.8 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000132366  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0065  tRNA-Met  89.8 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  4.7933e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t13660  tRNA-Met  91.11 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0986692  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0016  tRNA-Met  87.72 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0031  tRNA-Met  89.8 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000629379  hitchhiker  0.000794999 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>