207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_R0046 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_R0046  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0191389  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0023  tRNA-Val  94.44 
 
 		 72 bp  111  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.720893  normal  0.0127386 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0060  tRNA-Val  93.15 
 
 		 75 bp  105  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000546078  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0045  tRNA-Val  93.15 
 
 		 75 bp  105  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0031  tRNA-Val  93.15 
 
 		 75 bp  105  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000478109 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0043  tRNA-Val  93.15 
 
 		 75 bp  105  1e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0172535  normal  0.864924 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0049  tRNA-Val  93.15 
 
 		 75 bp  105  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0024  tRNA-Val  93.15 
 
 		 75 bp  105  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000776805  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0040  tRNA-Val  93.94 
 
 		 75 bp  99.6  9e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14900  tRNA-Val  91.78 
 
 		 75 bp  97.6  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0026  tRNA-Val  91.78 
 
 		 75 bp  97.6  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0408746  normal  0.0924489 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0042  tRNA-Val  91.78 
 
 		 75 bp  97.6  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0153066  hitchhiker  0.00834851 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0025  tRNA-Val  91.78 
 
 		 75 bp  97.6  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000057008  normal  0.409519 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0031  tRNA-Val  91.78 
 
 		 75 bp  97.6  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0030  tRNA-Val  91.78 
 
 		 75 bp  97.6  3e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2270  hypothetical protein  100 
 
 		 333 bp  95.6  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0037  tRNA-Val  91.67 
 
 		 72 bp  95.6  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.960362  normal  0.0810888 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0029  tRNA-Val  91.67 
 
 		 72 bp  95.6  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.742373  hitchhiker  0.00208243 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14860  tRNA-Val  92.54 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.303289  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Val-2  tRNA-Val  90.41 
 
 		 75 bp  89.7  8e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.516841  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Val-4  tRNA-Val  90.41 
 
 		 75 bp  89.7  8e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.464554  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0051  tRNA-Val  90.41 
 
 		 75 bp  89.7  8e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000353155  normal  0.0160187 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0029  tRNA-Val  90.41 
 
 		 75 bp  89.7  8e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0032  tRNA-Val  90.41 
 
 		 75 bp  89.7  8e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0061  tRNA-Val  90.41 
 
 		 75 bp  89.7  8e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.700263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0025  tRNA-Val  90.41 
 
 		 75 bp  89.7  8e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.149964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2783  tRNA-Val  90.41 
 
 		 75 bp  89.7  8e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0812706  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1831  tRNA-Val  90.41 
 
 		 75 bp  89.7  8e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0026  tRNA-Val  90.41 
 
 		 75 bp  89.7  8e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.179113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0031  tRNA-Val  90.41 
 
 		 75 bp  89.7  8e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.432364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_R0089  tRNA-Val  90.41 
 
 		 75 bp  89.7  8e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347614  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0061  tRNA-Val  90.41 
 
 		 75 bp  89.7  8e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0059  tRNA-Val  90.41 
 
 		 75 bp  89.7  8e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565602  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2266  tRNA-Val  90.41 
 
 		 75 bp  89.7  8e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.248753  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3052  tRNA-Val  90.41 
 
 		 75 bp  89.7  8e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.728072  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0061  tRNA-Val  90.41 
 
 		 75 bp  89.7  8e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.17954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2650  tRNA-Val  90.41 
 
 		 75 bp  89.7  8e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2705  tRNA-Val  90.41 
 
 		 75 bp  89.7  8e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1539  tRNA-Val  90.41 
 
 		 75 bp  89.7  8e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.051003  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0037  tRNA-Val  90.41 
 
 		 75 bp  89.7  8e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.605152  normal  0.0106326 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0038  tRNA-Val  90.41 
 
 		 75 bp  89.7  8e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.827791  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0069  tRNA-Val  90.28 
 
 		 72 bp  87.7  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00232154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0026  tRNA-Val  90.28 
 
 		 72 bp  87.7  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0265977  hitchhiker  0.000432959 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0038  tRNA-Val  96 
 
 		 72 bp  83.8  0.000000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.463505  normal  0.275868 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0044  tRNA-Val  89.04 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00403684  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0033  tRNA-Val  89.04 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000112986  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0038  tRNA-Val  92.98 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.405817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0018  tRNA-Val  89.04 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0036  tRNA-Val  92.98 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.012717  normal  0.28653 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0054  tRNA-Val  92.98 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.214372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0047  tRNA-Val  89.04 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.561657  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0054  tRNA-Val  89.04 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.452754 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0020  tRNA-Val  94.12 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0496105  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0015  tRNA-Val  89.55 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0817161  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0014  tRNA-Val  89.55 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.591193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0018  tRNA-Val  89.55 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0014  tRNA-Val  89.55 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0046  tRNA-Val  89.55 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.467185  normal  0.202309 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14034  tRNA-Val  89.55 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000622318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0043  tRNA-Val  92.59 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.125725  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0021  tRNA-Val  90.32 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Val-3  tRNA-Val  87.67 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0041  tRNA-Val  87.67 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0041  tRNA-Val  87.67 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0784234  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0024  tRNA-Val  87.67 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.508678  normal  0.235406 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1555  tRNA-Val  87.67 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0026  tRNA-Val  87.5 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.289153  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0039  tRNA-Val  87.5 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00107403  hitchhiker  0.00887894 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13860  tRNA-Val  87.5 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0312518  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0038  tRNA-Val  87.5 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00268365  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0024  tRNA-Val  87.5 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0024  tRNA-Val  87.5 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0036  tRNA-Val  88.06 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0258762  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0021  tRNA-Val  88.06 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0034  tRNA-Val  92 
 
 		 72 bp  67.9  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0146998  normal  0.0280728 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0058  tRNA-Val  90.74 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0029  tRNA-Val  92 
 
 		 72 bp  67.9  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.76241 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0037  tRNA-Val  86.3 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0032  tRNA-Val  86.3 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00002348 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0044  tRNA-Val  87.69 
 
 		 72 bp  65.9  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0051  tRNA-Val  86.96 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000163002  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0033  tRNA-Val  86.3 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.526612  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0035  tRNA-Val  86.3 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.522217  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0025  tRNA-Val  86.3 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000640058  normal  0.0750081 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0028  tRNA-Val  86.3 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00986707 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0038  tRNA-Val  86.3 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0039  tRNA-Val  89.47 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.867547  hitchhiker  0.000112761 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0026  tRNA-Val  87.67 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0026  tRNA-Val  87.69 
 
 		 72 bp  65.9  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.142579 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0029  tRNA-Val  86.3 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000337509 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0036  tRNA-Val  86.3 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0029  tRNA-Val  86.3 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0245746  normal  0.0651884 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0044  tRNA-Val  86.3 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.311014  normal  0.10516 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0032  tRNA-Val  86.3 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.463355  normal  0.0505941 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0026  tRNA-Val  86.3 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.851542  hitchhiker  0.00348632 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0031  tRNA-Val  86.11 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000451767 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0033  tRNA-Val  86.11 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000837062 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0032  tRNA-Val  89.29 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.297766  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0054  tRNA-Val  89.29 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.163017  normal  0.0248084 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0055  tRNA-Val  89.29 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0679296  normal  0.0243248 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>