134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_R0051 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_R0051  tRNA-Ile  100 
 
 
74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0054  tRNA-Ile  96.61 
 
 
74 bp  101  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.467793  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0001  tRNA-Ile  94.83 
 
 
74 bp  91.7  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0001  tRNA-Ile  96 
 
 
74 bp  83.8  0.000000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0001  tRNA-Ile  97.62 
 
 
74 bp  75.8  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0001  tRNA-Ile  97.62 
 
 
77 bp  75.8  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00699866 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0001  tRNA-Ile  94 
 
 
74 bp  75.8  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0001  tRNA-Ile  97.5 
 
 
77 bp  71.9  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.826373  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0001  tRNA-Ile  89.83 
 
 
74 bp  69.9  0.00000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.429514  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  95.24 
 
 
74 bp  67.9  0.0000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00665402  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0007  tRNA-Ile  86.49 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0924996  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0036  tRNA-Ile  86.49 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.432918  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0052  tRNA-Ile  86.49 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0001  tRNA-Ile  95.24 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0001  tRNA-Ile  95.24 
 
 
74 bp  67.9  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0001  tRNA-Ile  92 
 
 
74 bp  67.9  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0001  tRNA-Ile  95.24 
 
 
74 bp  67.9  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0026  tRNA-Ile  86.49 
 
 
74 bp  67.9  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0180152  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0007  tRNA-Ile  86.49 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00808178  normal  0.792486 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0042  tRNA-Ile  86.49 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00111432  normal  0.385328 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0001  tRNA-Ile  92 
 
 
74 bp  67.9  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000000056497 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00080  tRNA-Ile  93.18 
 
 
74 bp  63.9  0.000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0038  tRNA-Val  86.49 
 
 
72 bp  61.9  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00268365  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00090  tRNA-Ile  93.02 
 
 
74 bp  61.9  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.387136  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0015  tRNA-Val  86.49 
 
 
72 bp  61.9  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0605809  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tIle01  tRNA-Ile  88.14 
 
 
77 bp  61.9  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.982278 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0001  tRNA-Ile  93.02 
 
 
77 bp  61.9  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0001  tRNA-Ile  92.86 
 
 
74 bp  60  0.00000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0037  tRNA-Ile  85.14 
 
 
74 bp  60  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0001  tRNA-Ile  90 
 
 
74 bp  60  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0441602 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0006  tRNA-Ile  85.14 
 
 
74 bp  60  0.00000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0033  tRNA-Ile  85.14 
 
 
74 bp  60  0.00000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0017  tRNA-Ile  85.14 
 
 
74 bp  60  0.00000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0314309  normal  0.837845 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0050  tRNA-Ile  85.14 
 
 
74 bp  60  0.00000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0010  tRNA-Ile  85.14 
 
 
74 bp  60  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0022  tRNA-Ile  85.14 
 
 
77 bp  60  0.00000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000102931  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0033  tRNA-Ile  85.14 
 
 
77 bp  60  0.00000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000000982153  normal  0.21977 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0001  tRNA-Ile  92.86 
 
 
77 bp  60  0.00000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.269179  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0001  tRNA-Ile  92.86 
 
 
74 bp  60  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0015  tRNA-Ile  85.14 
 
 
77 bp  60  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000549591  normal  0.119153 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0028  tRNA-Ile  85.14 
 
 
77 bp  60  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000471614  decreased coverage  0.000367782 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0001  tRNA-Ile  92.86 
 
 
74 bp  60  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.226648  normal  0.0173253 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0001  tRNA-Ile  92.86 
 
 
74 bp  60  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.531061 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAIleVIMSS1309088  tRNA-Ile  85.14 
 
 
74 bp  60  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAIleVIMSS1309139  tRNA-Ile  85.14 
 
 
74 bp  60  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAIleVIMSS1309203  tRNA-Ile  85.14 
 
 
74 bp  60  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.765225  normal  0.83434 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAIleVIMSS1309281  tRNA-Ile  85.14 
 
 
74 bp  60  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.126115 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAIleVIMSS1309289  tRNA-Ile  85.14 
 
 
74 bp  60  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0001  tRNA-Ile  92.86 
 
 
74 bp  60  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.484512  normal  0.062918 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0001  tRNA-Ile  92.86 
 
 
74 bp  60  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAIleVIMSS1309162  tRNA-Ile  85.14 
 
 
74 bp  60  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0004  tRNA-Ile  92.86 
 
 
74 bp  60  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0654807  normal  0.562233 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0001  tRNA-Ile  92.86 
 
 
77 bp  60  0.00000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.48782 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14001  tRNA-Ile  92.86 
 
 
77 bp  60  0.00000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAIleVIMSS1309371  tRNA-Ile  85.14 
 
 
74 bp  60  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.284723  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0023  tRNA-Ile  85.14 
 
 
77 bp  60  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0042  tRNA-Ile  85.14 
 
 
77 bp  60  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0012  tRNA-Ile  85.14 
 
 
77 bp  60  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0028  tRNA-Ile  85.14 
 
 
77 bp  60  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.568304 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0001  tRNA-Ile  92.86 
 
 
77 bp  60  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.522467  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0043  tRNA-Ile  85.14 
 
 
77 bp  60  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0208406  normal  0.220068 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00090  tRNA-Ile  92.86 
 
 
74 bp  60  0.00000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.609024  normal  0.459297 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0022  tRNA-Ile  85.14 
 
 
77 bp  60  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.362568  normal  0.10266 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0057  tRNA-Ile  87.72 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0031  tRNA-Ile  86.89 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0041  tRNA-Val  85.14 
 
 
72 bp  54  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000505895  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0022  tRNA-Val  83.78 
 
 
77 bp  52  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0746641  normal  0.301569 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0038  tRNA-Ile  83.78 
 
 
77 bp  52  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0037  tRNA-Ile  83.78 
 
 
74 bp  52  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0181  tRNA-Ile  83.78 
 
 
74 bp  52  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00212444  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0037  tRNA-Val  83.78 
 
 
74 bp  52  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0020  tRNA-Ile  83.78 
 
 
77 bp  52  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00170  tRNA-Ile  88 
 
 
74 bp  52  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00090  tRNA-Ile  88 
 
 
77 bp  52  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0053  tRNA-Val  83.78 
 
 
77 bp  52  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0873696  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0007  tRNA-Val  96.55 
 
 
74 bp  50.1  0.00007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.309042  normal  0.118966 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0044  tRNA-Ile  85.96 
 
 
77 bp  50.1  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000172197  normal  0.222216 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0050  tRNA-Val  96.55 
 
 
77 bp  50.1  0.00007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0014  tRNA-Ile  85.96 
 
 
74 bp  50.1  0.00007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_R0077  tRNA-Ile  90.24 
 
 
74 bp  50.1  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0048  tRNA-Thr  87.5 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.397818  normal  0.996159 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0001  tRNA-Ile  90 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.996709  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0036  tRNA-Val  87.27 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0258762  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0021  tRNA-Val  87.27 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0010  tRNA-Val  96.43 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0006  tRNA-Thr  87.5 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000288516  hitchhiker  0.0000067546 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0310  tRNA-Thr  87.5 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00278593  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0035  tRNA-Val  96.43 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00123613  unclonable  0.0000000227981 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0037  tRNA-Val  96.43 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0260915  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0044  tRNA-Val  83.78 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00403684  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0028  tRNA-Val  91.43 
 
 
72 bp  46.1  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.13979  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0024  tRNA-Val  91.43 
 
 
72 bp  46.1  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0046  tRNA-Val  91.43 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.146675 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0029  tRNA-Val  83.78 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0245746  normal  0.0651884 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0016  tRNA-Val  91.43 
 
 
72 bp  46.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0026  tRNA-Val  83.78 
 
 
72 bp  46.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0265977  hitchhiker  0.000432959 
 
 
-
 
NC_002950  PGt04  tRNA-Ile  88.1 
 
 
74 bp  44.1  0.004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000322453 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0026  tRNA-Val  82.43 
 
 
77 bp  44.1  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0004  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  44.1  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.0000188757  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0012  tRNA-Val  96.15 
 
 
77 bp  44.1  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>