28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_R0077 on replicon NC_011879
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011879  Achl_R0077  tRNA-Ile  100 
 
 
74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0001  tRNA-Ile  90.38 
 
 
77 bp  63.9  0.000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14001  tRNA-Ile  92.68 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00090  tRNA-Ile  92.68 
 
 
74 bp  58  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.387136  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0001  tRNA-Ile  92.68 
 
 
74 bp  58  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0001  tRNA-Ile  92.68 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.48782 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00090  tRNA-Ile  92.68 
 
 
74 bp  58  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.609024  normal  0.459297 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00080  tRNA-Ile  92.68 
 
 
74 bp  58  0.0000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0001  tRNA-Ile  92.68 
 
 
74 bp  58  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000000056497 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0004  tRNA-Ile  92.68 
 
 
74 bp  58  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0654807  normal  0.562233 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0001  tRNA-Ile  92.68 
 
 
74 bp  58  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.484512  normal  0.062918 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0001  tRNA-Ile  92.68 
 
 
74 bp  58  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.531061 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0001  tRNA-Ile  92.68 
 
 
74 bp  58  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.226648  normal  0.0173253 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0001  tRNA-Ile  92.68 
 
 
74 bp  58  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0001  tRNA-Ile  92.68 
 
 
74 bp  58  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0001  tRNA-Ile  92.68 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.269179  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0001  tRNA-Ile  90.24 
 
 
77 bp  50.1  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00699866 
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  91.89 
 
 
74 bp  50.1  0.00007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00665402  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0001  tRNA-Ile  90.24 
 
 
74 bp  50.1  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0095  tRNA-Ile  90.24 
 
 
74 bp  50.1  0.00007  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0001  tRNA-Ile  90.24 
 
 
74 bp  50.1  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0051  tRNA-Ile  90.24 
 
 
74 bp  50.1  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0001  tRNA-Ile  90.24 
 
 
74 bp  50.1  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0001  tRNA-Ile  90 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.826373  normal 
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Met-2  tRNA-Met  91.67 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0660  tRNA-Ile  93.55 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.834568  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflt016  tRNA-Ile  93.55 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0035  tRNA-Thr  86.96 
 
 
75 bp  44.1  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000000289059  normal  0.587643 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>