More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_t0040 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_t0040  tRNA-Ile  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.22275  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1353  tRNA-Ile  98.65 
 
 		 77 bp  139  1e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00031485 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0001  tRNA-Ile  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.996709  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0001  tRNA-Ile  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t050  tRNA-Ile  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  8e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0331004  hitchhiker  0.0000227439 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  93.44 
 
 		 77 bp  89.7  8e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0697106  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Ile-2  tRNA-Ile  93.44 
 
 		 77 bp  89.7  8e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0142737  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t003  tRNA-Ile  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  8e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t064  tRNA-Ile  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  8e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t096  tRNA-Ile  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  8e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0007  tRNA-Ile  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  8e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000911687  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0010  tRNA-Ile  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  8e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000891119  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0020  tRNA-Ile  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  8e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0504823  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0067  tRNA-Ile  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  8e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000189357  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t042  tRNA-Ile  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  8e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0159624  hitchhiker  0.000000229903 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0011  tRNA-Ile  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  8e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0129022  hitchhiker  0.000473278 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0157  tRNA-Ile  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  8e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.131945  hitchhiker  0.00000102805 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0051  tRNA-Ile  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  8e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00698245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0008  tRNA-Ile  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  8e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0314854  hitchhiker  0.00756038 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0025  tRNA-Ile  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  8e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0513291  unclonable  0.00000384252 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0008  tRNA-Ile  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  8e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0289136  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0093  tRNA-Ile  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  8e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.879368  normal  0.134634 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0118  tRNA-Ile  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  8e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000845195  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0008  tRNA-Ile  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  8e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0770657  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0160  tRNA-Ile  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  8e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0152441  normal  0.0451567 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0149  tRNA-Ile  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  8e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00584205  unclonable  0.0000000149917 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0098  tRNA-Ile  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  8e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.331727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t009  tRNA-Ile  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  8e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.111936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0008  tRNA-Ile  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  8e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000331872  normal  0.303515 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0072  tRNA-Ile  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  8e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0376486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0008  tRNA-Ile  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  8e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.160787  hitchhiker  0.00984378 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0021  tRNA-Ile  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  8e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000203116  normal  0.0522769 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0072  tRNA-Ile  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  8e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00892637  normal  0.130437 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0005  tRNA-Ile  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  8e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000734395  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0062  tRNA-Ile  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  8e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00713608  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0127  tRNA-Ile  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  8e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000330359  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0081  tRNA-Ile  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  8e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000962065  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0008  tRNA-Ile  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  8e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00154963  normal  0.549393 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0070  tRNA-Ile  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  8e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000447214  normal  0.107395 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0135  tRNA-Ile  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  8e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000335927  normal  0.0144188 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0114  tRNA-Ile  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  8e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000347317  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0175  tRNA-Ile  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  8e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0770081  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0036  tRNA-Ile  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  8e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0271306  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0009  tRNA-Ile  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  8e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0154814  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0072  tRNA-Ile  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  8e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0761618  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0137  tRNA-Ile  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  8e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000306582  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0002  tRNA-Ile  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  8e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0365419  normal  0.118397 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0084  tRNA-Ile  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  8e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0017286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0117  tRNA-Ile  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  8e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000183962  hitchhiker  0.000210385 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0001  tRNA-Ile  94.64 
 
 		 74 bp  87.7  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0001  tRNA-Ile  93.22 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00699866 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0001  tRNA-Ile  93.22 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0022  tRNA-Ile  89.19 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0042  tRNA-Ile  89.19 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.359065  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0020  tRNA-Ile  89.19 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0012  tRNA-Ile  89.19 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.181038  normal  0.23369 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0014  tRNA-Ile  89.19 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.712374 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0041  tRNA-Ile  89.19 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.018808 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0067  tRNA-Ile  89.19 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0634109  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0052  tRNA-Ile  89.19 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.307306  normal  0.320522 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0060  tRNA-Ile  89.19 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0548087 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0035  tRNA-Ile  89.19 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.695665 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0007  tRNA-Ile  89.19 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.32375  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0043  tRNA-Ile  89.19 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0041  tRNA-Ile  89.19 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00126395 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0022  tRNA-Ile  89.19 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.879931  normal  0.983676 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0012  tRNA-Ile  89.19 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.430923 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0014  tRNA-Ile  89.19 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0043  tRNA-Ile  89.19 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.333285 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0050  tRNA-Ile  89.19 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.356265 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0071  tRNA-Ile  89.19 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.207153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0020  tRNA-Ile  89.19 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0036  tRNA-Ile  89.19 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0028  tRNA-Ile  89.19 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0028  tRNA-Ile  89.19 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0007  tRNA-Ile  89.19 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.367995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0019  tRNA-Ile  89.19 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.522587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0033  tRNA-Ile  89.19 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.715295 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0027  tRNA-Ile  89.19 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0053  tRNA-Ile  89.19 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0080  tRNA-Ile  89.19 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00090  tRNA-Ile  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.609024  normal  0.459297 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0035  tRNA-Ile  89.19 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0021  tRNA-Ile  89.19 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.383429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0028  tRNA-Ile  89.19 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.404313  hitchhiker  0.002006 
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00061  tRNA-Ile  92.98 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0509967  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0077  tRNA-Ile  92.98 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000248576  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4704  tRNA-Ile  92.98 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000142472  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0005  tRNA-Ile  91.8 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000000353567  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5092  tRNA-Ile  92.98 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000866499  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5077  tRNA-Ile  92.98 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000584569  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0011  tRNA-Ile  91.8 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000846583  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0005  tRNA-Ile  91.8 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000168156  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4714  tRNA-Ile  92.98 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504108  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tIle01  tRNA-Ile  92.98 
 
 		 80 bp  81.8  0.00000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tIle02  tRNA-Ile  92.98 
 
 		 80 bp  81.8  0.00000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4293  tRNA-Ile  92.98 
 
 		 79 bp  81.8  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000401395  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0059  tRNA-Ile  92.98 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000373197  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0006  tRNA-Ile  92.98 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0108839  normal  0.0634944 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0468  tRNA-Ile  92.98 
 
 		 79 bp  81.8  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000056688  normal  0.0165845 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>