60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_R0045 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_R0045  tRNA-Val  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0449962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0004  tRNA-Val  93.33 
 
 		 77 bp  109  9.000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0037  tRNA-Val  90.67 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0061  tRNA-Val  92.54 
 
 		 73 bp  85.7  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.154596  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0003  tRNA-Val  88 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0063  tRNA-Val  89.33 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.741524  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0049  tRNA-Val  88 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000683912  normal  0.27317 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0053  tRNA-Val  89.47 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0873696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0030  tRNA-Val  90.91 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.282956  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0045  tRNA-Val  90.74 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.16589  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0054  tRNA-Val  87.69 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00910713  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0023  tRNA-Val  88.16 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.169175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0024  tRNA-Val  88.16 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.469275  hitchhiker  0.0000034793 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0001  tRNA-Val  88.33 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0035  tRNA-Val  85.33 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00123613  unclonable  0.0000000227981 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0022  tRNA-Val  85.33 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0746641  normal  0.301569 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0026  tRNA-Val  85.33 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0021  tRNA-Val  86.49 
 
 		 73 bp  60  0.00000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.824854  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0037  tRNA-Val  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0033  tRNA-Val  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0024  tRNA-Val  85.33 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000776805  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAValVIMSS1309269  tRNA-Val  92.31 
 
 		 72 bp  54  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0008  tRNA-Val  92.31 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0410887  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_008309  HS_tVal03  tRNA-Val  87.27 
 
 		 80 bp  54  0.000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0001  tRNA-Val  85.71 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAValVIMSS1309382  tRNA-Val  92.31 
 
 		 72 bp  54  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.658487  normal  0.0584078 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0010  tRNA-Val  83.12 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0015  tRNA-Val  96.55 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000000205698  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0026  tRNA-Val  96.43 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0024  tRNA-Val  96.43 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0044  tRNA-Val  88.64 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.311014  normal  0.10516 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0052  tRNA-Val  84.38 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00919857  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0028  tRNA-Val  96.43 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.13979  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0016  tRNA-Val  96.43 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0018  tRNA-Val  96.43 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.347531  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAValVIMSS1309212  tRNA-Val  96.43 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.430818  normal  0.748874 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0032  tRNA-Val  90 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0046  tRNA-Val  96.43 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.146675 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0052  tRNA-Val  96.43 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.587124 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0012  tRNA-Val  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.500744  normal  0.114573 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAValVIMSS1309132  tRNA-Val  96.43 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0053  tRNA-Val  83.78 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.223885  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0032  tRNA-Val  88.37 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00002348 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13860  tRNA-Val  88.37 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0312518  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0071  tRNA-Val  82.67 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.99894  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0031  tRNA-Val  88.37 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0117254 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0008  tRNA-Val  93.55 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1374  tRNA-Val  84.13 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.110948 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0036  tRNA-Val  89.74 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.821341  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Val-1  tRNA-Val  82.43 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.133132  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0044  tRNA-Asp  86 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000264444  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAValVIMSS1309173  tRNA-Val  96.15 
 
 		 72 bp  44.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.124324  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAValVIMSS1309100  tRNA-Val  96.15 
 
 		 72 bp  44.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0060  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.203868  normal  0.918224 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0010  tRNA-Val  85.19 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.239466  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0019  tRNA-Asp  86 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.206388  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0054  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0017  tRNA-Asp  86 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.214507  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0036  tRNA-Val  96.15 
 
 		 72 bp  44.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0050  tRNA-Val  88.1 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>