229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_tRNAValVIMSS1309269 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009976  P9211_tRNAValVIMSS1309382  tRNA-Val  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.658487  normal  0.0584078 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAValVIMSS1309269  tRNA-Val  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0018  tRNA-Val  98.61 
 
 		 72 bp  135  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.347531  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAValVIMSS1309212  tRNA-Val  98.61 
 
 		 72 bp  135  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.430818  normal  0.748874 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0025  tRNA-Val  94.44 
 
 		 75 bp  111  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000640058  normal  0.0750081 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0032  tRNA-Val  91.67 
 
 		 75 bp  95.6  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0044  tRNA-Val  91.67 
 
 		 72 bp  95.6  1e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.320122  normal  0.198064 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0036  tRNA-Val  91.67 
 
 		 72 bp  95.6  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAValVIMSS1309100  tRNA-Val  91.67 
 
 		 72 bp  95.6  1e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAValVIMSS1309173  tRNA-Val  91.67 
 
 		 72 bp  95.6  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.124324  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0044  tRNA-Val  92.31 
 
 		 72 bp  89.7  8e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0029  tRNA-Val  90.28 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0036  tRNA-Val  90.28 
 
 		 72 bp  87.7  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.821341  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0026  tRNA-Val  90.28 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.179113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0037  tRNA-Val  90.28 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.605152  normal  0.0106326 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0023  tRNA-Val  90.28 
 
 		 72 bp  87.7  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.720893  normal  0.0127386 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0051  tRNA-Val  92.19 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000163002  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAValVIMSS1309132  tRNA-Val  90.28 
 
 		 72 bp  87.7  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14860  tRNA-Val  91.04 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.303289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0068  tRNA-Val  94.44 
 
 		 72 bp  83.8  0.000000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.064456  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0025  tRNA-Val  88.89 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.149964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0038  tRNA-Val  88.89 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.827791  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Val-4  tRNA-Val  88.89 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.464554  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0051  tRNA-Val  88.89 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000353155  normal  0.0160187 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0061  tRNA-Val  88.89 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.17954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2783  tRNA-Val  88.89 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0812706  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0045  tRNA-Val  88.89 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0069  tRNA-Val  88.89 
 
 		 72 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00232154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0008  tRNA-Val  88.89 
 
 		 72 bp  79.8  0.00000000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0028  tRNA-Val  88.89 
 
 		 72 bp  79.8  0.00000000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.13979  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0061  tRNA-Val  88.89 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.700263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0024  tRNA-Val  88.89 
 
 		 72 bp  79.8  0.00000000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0046  tRNA-Val  88.89 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.146675 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1831  tRNA-Val  88.89 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0052  tRNA-Val  88.89 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.886993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0016  tRNA-Val  88.89 
 
 		 72 bp  79.8  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_R0089  tRNA-Val  88.89 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347614  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0060  tRNA-Val  88.89 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000546078  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0061  tRNA-Val  88.89 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0059  tRNA-Val  88.89 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565602  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0049  tRNA-Val  88.89 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0031  tRNA-Val  88.89 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000478109 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2266  tRNA-Val  88.89 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.248753  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3052  tRNA-Val  88.89 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.728072  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2650  tRNA-Val  88.89 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2705  tRNA-Val  88.89 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1539  tRNA-Val  88.89 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.051003  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0016  tRNA-Val  92.59 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000321371  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0039  tRNA-Val  91.23 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.449991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0040  tRNA-Val  91.23 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.451217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna32  tRNA-Val  91.23 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0025  tRNA-Val  93.88 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000000368107  normal  0.0217616 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0046  tRNA-Val  91.23 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0046  tRNA-Val  91.23 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0038  tRNA-Val  87.5 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00268365  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0037  tRNA-Val  87.5 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0029  tRNA-Val  87.5 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.198673  normal  0.11041 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0025  tRNA-Val  87.5 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000057008  normal  0.409519 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0013  tRNA-Val  87.5 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0014  tRNA-Val  87.5 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0031  tRNA-Val  87.5 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0029  tRNA-Val  87.5 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0245746  normal  0.0651884 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0001  tRNA-Val  87.5 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.613575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0035  tRNA-Val  87.5 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.491254  normal  0.639036 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0054  tRNA-Val  89.83 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.214372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0036  tRNA-Val  89.83 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.012717  normal  0.28653 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0038  tRNA-Val  89.83 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.405817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0031  tRNA-Val  95.12 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.057517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11940  tRNA-Val  91.84 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000016484  normal  0.0993064 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Val-2  tRNA-Val  86.11 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.516841  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0021  tRNA-Val  86.11 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4309  tRNA-Val  86.11 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0053  tRNA-Val  86.11 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.223885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0047  tRNA-Val  86.11 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6005  tRNA-Val  86.11 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.859444 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0062  tRNA-Val  91.67 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.120267 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0052  tRNA-Val  86.11 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0014  tRNA-Val  97.22 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.629466 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0001  tRNA-Val  86.11 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0026  tRNA-Val  86.11 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.851542  hitchhiker  0.00348632 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0026  tRNA-Val  86.11 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0265977  hitchhiker  0.000432959 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0041  tRNA-Val  86.11 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000505895  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0049  tRNA-Val  90.2 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.507561 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0052    90.2 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0020  tRNA-Val  90.2 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA13  tRNA-Val  90.2 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00601929  normal  0.184013 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0046  tRNA-Val  90.2 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.26227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0046  tRNA-Val  90.2 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0056  tRNA-Val  90.2 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0037  tRNA-Val  88.89 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0022  tRNA-Val  88.89 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0746641  normal  0.301569 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0026  tRNA-Val  86.15 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.142579 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0039  tRNA-Val  87.72 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.867547  hitchhiker  0.000112761 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0033  tRNA-Val  84.72 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000837062 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0052  tRNA-Val  89.58 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00919857  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0046  tRNA-Val  84.72 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0191389  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0031  tRNA-Val  84.72 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000451767 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0033  tRNA-Val  84.72 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.526612  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0035  tRNA-Val  84.72 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.522217  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0023  tRNA-Val  90.91 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.885733 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>