26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_R0045 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_R0045  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.16589  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0030  tRNA-Val  94.67 
 
 		 75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.282956  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0004  tRNA-Val  92.21 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0063  tRNA-Val  92.11 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.741524  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0037  tRNA-Val  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0008  tRNA-Val  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0410887  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0053  tRNA-Val  87.5 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.223885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0024  tRNA-Val  90.91 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000776805  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0045  tRNA-Val  90.74 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0449962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0066  tRNA-Val  94.74 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.011758  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0029  tRNA-Val  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0037  tRNA-Val  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.605152  normal  0.0106326 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0012  tRNA-Val  91.3 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.500744  normal  0.114573 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0040  tRNA-Val  100 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.142714 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0026  tRNA-Val  83.78 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.179113  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0061  tRNA-Val  90.48 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.154596  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0025  tRNA-Val  96.43 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0041  tRNA-Val  96.43 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.576244  normal  0.292589 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0025  tRNA-Val  82.67 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000057008  normal  0.409519 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0008  tRNA-Val  93.55 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0033  tRNA-Val  82.67 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000112986  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0029  tRNA-Val  93.55 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0245746  normal  0.0651884 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0044  tRNA-Val  96.15 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.320122  normal  0.198064 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0014  tRNA-Val  96.15 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0013  tRNA-Val  96.15 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Val-1  tRNA-Val  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>