29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_R0066 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_R0066  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.011758  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0024  tRNA-Val  96 
 
 		 75 bp  83.8  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000776805  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2615  tRNA-Val  86.49 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.71269  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0042  tRNA-Val  86.49 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.288324  hitchhiker  0.00194275 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0008  tRNA-Val  89.66 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0410887  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0028  tRNA-Val  85.14 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.464795  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0045  tRNA-Val  94.74 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.16589  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0037  tRNA-Val  92.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0008  tRNA-Val  87.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.153849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0025  tRNA-Ala  92.31 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000185989  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0025  tRNA-Ala  92.31 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000151787  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0030  tRNA-Val  92.11 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.282956  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0063  tRNA-Val  92.68 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.741524  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14860  tRNA-Val  93.94 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.303289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0020  tRNA-Val  84.62 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0496105  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0953  tRNA-Val  89.74 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0027  tRNA-Val  89.74 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.480715 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0012  tRNA-Val  86.44 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.500744  normal  0.114573 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0046  tRNA-Val  87.23 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0191389  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0058  tRNA-Val  89.74 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0050  tRNA-Val  89.74 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR_t15  tRNA-Val  89.74 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS01505  tRNA-Met  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.946328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0046  tRNA-Val  88.1 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0056  tRNA-Val  88.1 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0046  tRNA-Val  88.1 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.26227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0020  tRNA-Val  88.1 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0049  tRNA-Val  88.1 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.507561 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0052    88.1 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>