298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_R0025 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_R0025  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000185989  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0025  tRNA-Ala  98.68 
 
 		 76 bp  143  7e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000151787  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0006  tRNA-Ala  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0009  tRNA-Ala  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0039  tRNA-Ala  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000281938  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0040  tRNA-Ala  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000050813  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0054  tRNA-Ala  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0005  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0152026  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0057  tRNA-Ala  92.19 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0335757  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0006  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0034  tRNA-Ala  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00540131 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0011  tRNA-Ala  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0030  tRNA-Ala  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.546773  normal  0.473005 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0022  tRNA-Ala  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.734931  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0010  tRNA-Ala  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0964882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0038  tRNA-Ala  88.14 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0031  tRNA-Ala  85.71 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0016  tRNA-Ala  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00130891  unclonable  0.0000000248752 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0006  tRNA-Ala  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0020  tRNA-Ala  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0044  tRNA-Ala  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.167304  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0062  tRNA-Ala  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0008  tRNA-Ala  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0607736  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0023  tRNA-Ala  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.365423 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0008  tRNA-Ala  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.52636  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0001  tRNA-Ala  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.599986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0029  tRNA-Ala  86.67 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.978783  normal  0.786802 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0039  tRNA-Ala  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.980011 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0031  tRNA-Ala  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.488566  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0007  tRNA-Ala  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.682382  normal  0.836798 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0008  tRNA-Ala  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.142528  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t1816  tRNA-Ala  87.5 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0004  tRNA-Ala  85.07 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.155196  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0066  tRNA-Val  92.31 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.011758  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0025  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.03724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0049  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.695027  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0043  tRNA-Asp  96.67 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383968  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0017  tRNA-Ala  84.29 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.476615  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0041  tRNA-Val  92.86 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.424139  normal  0.210105 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0028  tRNA-Ala  86.21 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0101867  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t32  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.318982  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t37  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00721336  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRAt13  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0344586  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0003  tRNA-Arg  100 
 
 		 78 bp  50.1  0.00007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.79204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0029  tRNA-Val  92.68 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0260  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0017  tRNA-Thr  85.96 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0721546  normal  0.333053 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0026  tRNA-Val  92.68 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.179113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0033  tRNA-OTHER  100 
 
 		 98 bp  50.1  0.00007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1084  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14860  tRNA-Val  92.68 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.303289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0042  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0052  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1792  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00323492  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1584  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0037  tRNA-Val  92.68 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.605152  normal  0.0106326 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1020  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0087  tRNA-Val  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0004  tRNA-Ala  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.554141  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Ala-3  tRNA-Ala  82.89 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.05432  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Ala-4  tRNA-Ala  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00508313  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Val-1  tRNA-Val  93.75 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.0049359  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Val-3  tRNA-Val  84.38 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Val-1  tRNA-Val  86.54 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.987752  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Val-4  tRNA-Val  86.54 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.834758  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0057  tRNA-Ala  82.89 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0053  tRNA-Ala  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0004    96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.887473 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0118  tRNA-Val  86.54 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.384232  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0029  tRNA-Ala  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0022  tRNA-Ala  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0002  tRNA-Ala  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.381422  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0046  tRNA-Ala  82.89 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.137197 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0113  tRNA-Val  86.54 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00182115  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0020  tRNA-Ala  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000865622  hitchhiker  2.9719399999999996e-20 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0021  tRNA-Val  93.75 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0144657  normal  0.36354 
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Val-5  tRNA-Val  86.54 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0010  tRNA-Ala  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.100058 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0117  tRNA-Val  86.54 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0164  tRNA-Pro  100 
 
 		 79 bp  48.1  0.0003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0038  tRNA-Ala  82.89 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.59206  normal  0.592226 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0029  tRNA-Ala  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.180945  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0005  tRNA-Ala  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0042  tRNA-Val  93.75 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.288324  hitchhiker  0.00194275 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0004  tRNA-Ala  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0055  tRNA-Ala  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.623624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5751  tRNA-Val  86.54 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2615  tRNA-Val  93.75 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.71269  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0994  tRNA-Ala  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0502689  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0002  tRNA-Ala  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.778996  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1426  tRNA-Val  86.54 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.842618  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1767  tRNA-Val  84.38 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0087  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000016212  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07693  tRNA-Gly  85.71 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0027  tRNA-Ala  82.89 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.987879  normal  0.104292 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2091  tRNA-Val  84.38 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.872247  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_R0030  tRNA-Val  93.75 
 
 		 100 bp  48.1  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.298715 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0051  tRNA-Ala  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0068  tRNA-Ala  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0550455 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0067  tRNA-Ala  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0193127 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>