27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_R0063 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_R0063  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.741524  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0008  tRNA-Val  92.11 
 
 		 75 bp  95.6  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0410887  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0045  tRNA-Val  92.11 
 
 		 75 bp  95.6  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.16589  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0037  tRNA-Val  92.11 
 
 		 75 bp  95.6  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0061  tRNA-Val  92.42 
 
 		 73 bp  91.7  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.154596  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0004  tRNA-Val  89.61 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0045  tRNA-Val  89.33 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0449962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0012  tRNA-Val  88.41 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.500744  normal  0.114573 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0030  tRNA-Val  92.86 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.282956  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0022  tRNA-Val  91.67 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0746641  normal  0.301569 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0024  tRNA-Val  86.84 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000776805  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0021  tRNA-Val  90 
 
 		 69 bp  60  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.702052 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0037  tRNA-Val  91.11 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0053  tRNA-Val  86.3 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.223885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07570  tRNA-Val  89.36 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.10137  normal  0.977811 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0022  tRNA-Val  89.36 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0121384  normal  0.0431401 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0021  tRNA-Val  83.56 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.824854  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0066  tRNA-Val  92.68 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.011758  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11940  tRNA-Val  87.5 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000016484  normal  0.0993064 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0037  tRNA-Val  84.21 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.605152  normal  0.0106326 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0025  tRNA-Val  87.5 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000000368107  normal  0.0217616 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0029  tRNA-Val  84.21 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09530  tRNA-Val  87.23 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0129641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0026  tRNA-Val  84 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.179113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0025  tRNA-Val  93.55 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.962727  normal  0.312894 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0008  tRNA-Val  93.55 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0035  tRNA-Val  87.23 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.81932  normal  0.306729 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>