38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_R0053 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_R0053  tRNA-Val  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.223885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0045  tRNA-Val  87.5 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.16589  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0044  tRNA-Val  87.5 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.320122  normal  0.198064 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAValVIMSS1309382  tRNA-Val  86.11 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.658487  normal  0.0584078 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0037  tRNA-Val  86.11 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAValVIMSS1309269  tRNA-Val  86.11 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0063  tRNA-Val  86.3 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.741524  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0025  tRNA-Val  84.72 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000640058  normal  0.0750081 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAValVIMSS1309173  tRNA-Val  84.72 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.124324  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAValVIMSS1309212  tRNA-Val  84.72 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.430818  normal  0.748874 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAValVIMSS1309100  tRNA-Val  84.72 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0025  tRNA-Val  100 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0030  tRNA-Val  84.72 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.282956  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0041  tRNA-Val  100 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.576244  normal  0.292589 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0036  tRNA-Val  84.72 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0018  tRNA-Val  84.72 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.347531  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0008  tRNA-Val  84.72 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0013  tRNA-Val  100 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0014  tRNA-Val  100 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0029  tRNA-Val  96.43 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0245746  normal  0.0651884 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0041  tRNA-Val  96.43 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000505895  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0017  tRNA-Val  83.33 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00877292  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAValVIMSS1309132  tRNA-Val  83.33 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0004  tRNA-Val  91.43 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0045  tRNA-Val  83.78 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0449962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0028  tRNA-Val  96.15 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000436096 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0026  tRNA-Val  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000411365 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0029  tRNA-Val  96.15 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.575368 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0027  tRNA-Val  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.60657 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0037  tRNA-Val  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0016  tRNA-Val  96.15 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0040  tRNA-Val  96.15 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.142714 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0046  tRNA-Val  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.146675 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15510  tRNA-Val  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00141573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0025  tRNA-Val  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000057008  normal  0.409519 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0038  tRNA-Val  96.15 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00268365  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0024  tRNA-Val  96.15 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0028  tRNA-Val  96.15 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.13979  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>