40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_R0008 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_R0008  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.153849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0042  tRNA-Val  94.67 
 
 		 75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.288324  hitchhiker  0.00194275 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2615  tRNA-Val  94.67 
 
 		 75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.71269  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0021  tRNA-Val  93.33 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0144657  normal  0.36354 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Val-1  tRNA-Val  93.33 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.0049359  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0028  tRNA-Val  93.33 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.464795  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0045  tRNA-Val  93.33 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.218137  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0029  tRNA-Val  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  7.23403e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0051  tRNA-Val  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.223947  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0040  tRNA-Val  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0040  tRNA-Val  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00410606 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0041  tRNA-Val  91.67 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.424139  normal  0.210105 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0021  tRNA-Val  90.2 
 
 		 72 bp  61.9  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0059  tRNA-Val  92.86 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000382947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0024  tRNA-Val  90 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.415553  normal  0.401158 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0037  tRNA-Val  94.44 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.605152  normal  0.0106326 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14860  tRNA-Val  94.44 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.303289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0066  tRNA-Val  87.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.011758  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0026  tRNA-Val  94.44 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.179113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0029  tRNA-Val  94.44 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11940  tRNA-Val  94.29 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000016484  normal  0.0993064 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0025  tRNA-Val  94.29 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000000368107  normal  0.0217616 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0053  tRNA-Val  90.7 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000250607  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0046  tRNA-Val  90.7 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000910848  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0043  tRNA-Val  94.12 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000000282186  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA13  tRNA-Val  94.12 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00601929  normal  0.184013 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0014  tRNA-Val  88 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0031  tRNA-Val  91.89 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.057517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0032  tRNA-Val  91.67 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0036  tRNA-Val  88.64 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0045  tRNA-Val  93.55 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0045  tRNA-Val  93.55 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0057  tRNA-Val  82.67 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.700226  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0024  tRNA-Val  87.23 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000776805  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0028  tRNA-Val  82.67 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.278514 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0027  tRNA-Val  82.67 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0757548  normal  0.697108 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0036  tRNA-Val  91.18 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.821341  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0043  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000221825  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0043  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.174816  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0046  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>