299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_tVal03 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_tVal03  tRNA-Val  100 
 
 		 80 bp  159  1e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1201  tRNA-Val  93.15 
 
 		 77 bp  105  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0742483  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00027  tRNA-Val  96.55 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.825713  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0048  tRNA-Val  96.55 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000092114  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_t55  tRNA-Val  96.55 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.38897  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t56  tRNA-Val  96.55 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0045  tRNA-Val  96.55 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.653402  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0053  tRNA-Val  96.55 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0699636  normal  0.799268 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0032  tRNA-Val  96.55 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.148621  normal  0.0470696 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2378  tRNA-Val  96.55 
 
 		 79 bp  99.6  9e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000316536  hitchhiker  0.00924941 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1520  tRNA-Val  96.55 
 
 		 79 bp  99.6  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00188804  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0042  tRNA-Val  96.55 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60190  tRNA-Val  96.55 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1534  tRNA-Val  96.55 
 
 		 79 bp  99.6  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0495924  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0053  tRNA-Val  96.55 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4667  tRNA-Val  96.55 
 
 		 79 bp  99.6  9e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000334967  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1750  tRNA-Val  96.55 
 
 		 79 bp  99.6  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000307379  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0070  tRNA-Val  96.55 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.256886 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0071  tRNA-Val  96.55 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193392 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1919  tRNA-Val  96.55 
 
 		 79 bp  99.6  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0105703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0054  tRNA-Val  96.55 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0691597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1532  tRNA-Val  96.55 
 
 		 79 bp  99.6  9e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000254029  hitchhiker  0.00110314 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2148  tRNA-Val  96.55 
 
 		 79 bp  99.6  9e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000010936  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0046  tRNA-Val  96.55 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00020068 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0053  tRNA-Val  96.55 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.855863  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0045  tRNA-Val  96.55 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000191089 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5035  tRNA-Val  96.55 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000158599  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0046  tRNA-Val  96.55 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00278064 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1557  tRNA-Val  96.55 
 
 		 79 bp  99.6  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.939336  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00028  tRNA-Val  96.49 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.813226  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0047  tRNA-Val  96.49 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000347676  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1533  tRNA-Val  96.49 
 
 		 79 bp  97.6  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.102488  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Val-2  tRNA-Val  96.49 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t34  tRNA-Val  96.49 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0987104  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t35  tRNA-Val  96.49 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0521138  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1519  tRNA-Val  96.49 
 
 		 79 bp  97.6  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000581354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1202  tRNA-Val  96.49 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0491839  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA41  tRNA-Val  96.49 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.179382 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA42  tRNA-Val  96.49 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.191671  normal  0.176048 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4229  tRNA-Val  96.49 
 
 		 79 bp  97.6  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000067821  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4228  tRNA-Val  96.49 
 
 		 79 bp  97.6  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000102748  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0076  tRNA-Val  96.49 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00448767  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0063  tRNA-Val  96.49 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000215806  hitchhiker  0.00000333382 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R39  tRNA-Val  96.49 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0141809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0062  tRNA-Val  96.49 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000022739  hitchhiker  0.00000336445 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1751  tRNA-Val  96.49 
 
 		 79 bp  97.6  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000295955  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0046  tRNA-Val  96.49 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0045  tRNA-Val  96.49 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00278064 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2149  tRNA-Val  96.49 
 
 		 79 bp  97.6  4e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000169486  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4230  tRNA-Val  96.49 
 
 		 79 bp  97.6  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000689927  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5036  tRNA-Val  96.49 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000151572  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1531  tRNA-Val  96.49 
 
 		 79 bp  97.6  4e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000929457  hitchhiker  0.00112826 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0061  tRNA-Val  96.49 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000225678  hitchhiker  0.00000327406 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2580  tRNA-Val  96.49 
 
 		 79 bp  97.6  4e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0938444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2581  tRNA-Val  96.49 
 
 		 79 bp  97.6  4e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0567199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1556  tRNA-Val  96.49 
 
 		 79 bp  97.6  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2379  tRNA-Val  96.49 
 
 		 79 bp  97.6  4e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000292558  hitchhiker  0.00911124 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1920  tRNA-Val  96.49 
 
 		 79 bp  97.6  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0104306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0045  tRNA-Val  96.49 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.431879  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0052  tRNA-Val  96.49 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0041  tRNA-Val  96.49 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.777781  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0054  tRNA-Val  96.49 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0571511  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0077  tRNA-Val  96.49 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00426255  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0053  tRNA-Val  96.49 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.452595  hitchhiker  0.000000169384 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1713  tRNA-Val  96.72 
 
 		 76 bp  97.6  4e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.205594  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0075  tRNA-Val  96.49 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00433017  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0027  tRNA-Val  94.83 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.543066  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0054  tRNA-Val  96.3 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.322484  hitchhiker  0.000000167745 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0045  tRNA-Val  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0069  tRNA-Val  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000229538  normal  0.0109054 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0041  tRNA-Val  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.0000251829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0029  tRNA-Val  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0528689 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0010  tRNA-Val  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.116783  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0021  tRNA-Val  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0026  tRNA-Val  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.211344  normal  0.0167997 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1888  tRNA-Val  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.207939  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1133  tRNA-Val  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.646427  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0017  tRNA-Val  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00286264  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0070  tRNA-Val  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000820033  normal  0.0109054 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0020  tRNA-Val  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.649475  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2457  tRNA-Val  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0499895  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0032  tRNA-Val  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.100652  normal  0.0918353 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0050  tRNA-Val  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0857362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_BR0006  tRNA-Val  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0041  tRNA-Val  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0075941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0004  tRNA-Val  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0212233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0042  tRNA-Val  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00372557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1734  tRNA-Val  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.528515  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0015  tRNA-Val  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000941457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_R0080  tRNA-Val  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0217837  normal  0.25513 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0001  tRNA-Val  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.400265  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0026  tRNA-Val  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000276019  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_R0076  tRNA-Val  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.369233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0004  tRNA-Val  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.559063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2904  tRNA-Val  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0016  tRNA-Val  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0039  tRNA-Val  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0358134  normal  0.456153 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0042  tRNA-Val  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.921175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1541  tRNA-Val  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.713195  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0054  tRNA-Val  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.125066 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>