89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_04040 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012803  Mlut_04040  tRNA-Val  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0034  tRNA-Val  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0899378  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0029  tRNA-Val  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15450  tRNA-Val  94.64 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0490498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t24  tRNA-Val  93.1 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0028  tRNA-Val  92.98 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna039  tRNA-Ile  87.14 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00772194  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna079  tRNA-Ile  87.14 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0722838  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna157  tRNA-Ile  87.14 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0113755  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0035  tRNA-Val  89.66 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00329  tRNA-Ile  89.47 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00202  tRNA-Ile  89.47 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03616  tRNA-Ile  89.47 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03720  tRNA-Ile  89.47 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00196  tRNA-Ile  89.47 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0057  tRNA-Val  85.92 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.385214  hitchhiker  0.00196821 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0565  tRNA-Met  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0043  tRNA-Val  94.74 
 
 		 72 bp  60  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mflt022  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  0.000116471  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0743  tRNA-Met  90.7 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14031  tRNA-Val  92.11 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000460426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0077  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0008  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0008  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0049  tRNA-Val  86.21 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000000400511  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA08020  tRNA-Val  96.55 
 
 		 103 bp  50.1  0.00008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00270  tRNA-Val  96.55 
 
 		 105 bp  50.1  0.00008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0174  tRNA-Met  86.54 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.453072  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0030  tRNA-Met  86.54 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0564  tRNA-Met  86.54 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0033  tRNA-Val  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0056  tRNA-Asp  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0015  tRNA-Val  90.48 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000000205698  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0007  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0001  tRNA-Ile  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0053  tRNA-Val  90.48 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0873696  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07709  tRNA-Asn  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0523717  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0026  tRNA-Val  93.55 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.142579 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0022  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0006  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0017  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000161525  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0042  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.447058  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0019  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000000626399  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0033  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.507086  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0031  tRNA-His  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.679826  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28350  tRNA-Ile  86 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.145936 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00070  tRNA-Ile  86 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000758823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0001  tRNA-Ile  86 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000567837 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1372  tRNA-Lys  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000123284 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0036  tRNA-Val  91.18 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.432227 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0052  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.52519  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0033  tRNA-Val  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0049  tRNA-Pro  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ile-3  tRNA-Ile  82.86 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000945265  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2459  tRNA-Ile  82.86 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2212  tRNA-Ile  82.86 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2772  tRNA-Ile  82.86 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2506  tRNA-Ile  82.86 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0018  tRNA-Val  89.47 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0243467  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0037  tRNA-Val  86.21 
 
 		 78 bp  44.1  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0005  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00829837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0744  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tMet02  tRNA-Met  100 
 
 		 80 bp  44.1  0.005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0193377  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0045  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.339043  hitchhiker  0.000000161581 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0012  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0130258  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mflt021  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  0.000111165  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ile-3  tRNA-Ile  82.86 
 
 		 80 bp  44.1  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0703604  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4332  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Met-3  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Ile-2  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.226079  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0021  tRNA-Val  89.47 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0052  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2800  tRNA-Ile  82.86 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000121659  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2707  tRNA-Ile  82.86 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000190822  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2075  tRNA-Ile  82.86 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00411358  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0043  tRNA-Val  89.47 
 
 		 72 bp  44.1  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0298498  normal  0.206957 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0017  tRNA-Val  89.47 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  tRNA-Val-1  tRNA-Val  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.301674  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0016  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000174645  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0035  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0017  tRNA-Val  89.47 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.217131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0063  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0802008  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0053  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00143998  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0033  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0776982  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0022  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00808191  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1608  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.838152 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1573  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t1220  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.400945  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>